More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1440 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1440  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  100 
 
 		 233 aa  466  9.999999999999999e-131  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0358  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  90.99 
 
 		 233 aa  428  1e-119  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.304436  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0479  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  87.98 
 
 		 233 aa  420  1e-116  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.161878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0547  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  68.09 
 
 		 237 aa  336  1.9999999999999998e-91  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1248  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  46.78 
 
 		 249 aa  211  7e-54  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1911  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  34.21 
 
 		 249 aa  157  1e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0990  hypothetical protein  37.34 
 
 		 506 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.663742 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1030  formate dehydrogenase accessory protein  36.51 
 
 		 263 aa  126  3e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1258  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  30.37 
 
 		 224 aa  122  6e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2876  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  33.88 
 
 		 262 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0487293  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1386  fdhD protein  34.72 
 
 		 257 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0211  formate dehydrogenase accessory protein  32.22 
 
 		 260 aa  110  1.0000000000000001e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1058  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  29.34 
 
 		 264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1062  formate dehydrogenase, subunit FdhD  30.25 
 
 		 479 aa  110  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0656292 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2019  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  31.3 
 
 		 260 aa  109  3e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.948078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1293  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  28.4 
 
 		 255 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000222407  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0780  formate dehydrogenase accessory protein FdhD  30.6 
 
 		 478 aa  107  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.162723  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2264  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  30.28 
 
 		 468 aa  107  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1958  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  30.28 
 
 		 468 aa  107  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1205  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  26.46 
 
 		 303 aa  106  4e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.495294 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1860  formate dehydrogenase accessory protein  30.51 
 
 		 260 aa  105  5e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1216  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  29.52 
 
 		 261 aa  105  7e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.944709  normal  0.100536 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1840  formate dehydrogenase accessory protein  29.8 
 
 		 268 aa  104  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00380429  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2122  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  29.25 
 
 		 259 aa  104  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.545765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2010  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  30.1 
 
 		 248 aa  104  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.068526  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5379  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  29.11 
 
 		 248 aa  103  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0597745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3374  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  29.88 
 
 		 260 aa  103  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0035  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  30.09 
 
 		 238 aa  103  3e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3385  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  28.39 
 
 		 483 aa  102  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1681  formate dehydrogenase accessory protein  30.08 
 
 		 260 aa  102  6e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3364  formate dehydrogenase accessory protein  32.02 
 
 		 265 aa  102  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.144836  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3628  formate dehydrogenase accessory protein  32.02 
 
 		 265 aa  102  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1500  formate dehydrogenase accessory protein  30.08 
 
 		 260 aa  102  6e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.919736  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2204  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  28.39 
 
 		 254 aa  102  7e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.154366  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3578  formate dehydrogenase accessory protein  32.02 
 
 		 265 aa  101  9e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1157  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  27.44 
 
 		 274 aa  101  9e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3328  formate dehydrogenase accessory protein  32.02 
 
 		 265 aa  101  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0183588  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3595  formate dehydrogenase accessory protein  32.02 
 
 		 265 aa  101  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0280  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  25.85 
 
 		 282 aa  101  1e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.717981  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3678  formate dehydrogenase accessory protein  32.02 
 
 		 265 aa  100  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.688402  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0300  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  29.48 
 
 		 268 aa  100  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3585  formate dehydrogenase accessory protein  31.62 
 
 		 265 aa  99.8  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3278  formate dehydrogenase accessory protein  29.76 
 
 		 265 aa  100  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0466  formate dehydrogenase accessory protein  30.71 
 
 		 262 aa  100  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.276769  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3370  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  28.51 
 
 		 487 aa  99.8  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2060  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  32.79 
 
 		 262 aa  99.4  4e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000863556  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2076  formate dehydrogenase, subunit FdhD  28.8 
 
 		 263 aa  98.2  9e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  9.82479e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3534  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  27.27 
 
 		 284 aa  97.8  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2817  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  27.42 
 
 		 255 aa  97.8  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2990  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  27.57 
 
 		 255 aa  97.1  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.68227e-19 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0989  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  26.98 
 
 		 266 aa  96.3  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1914  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  27.04 
 
 		 285 aa  96.7  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.84446  hitchhiker  0.0000450272 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2175  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  27.2 
 
 		 260 aa  94.4  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.145342 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0644  formate dehydrogenase accessory protein  29.6 
 
 		 268 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0556  formate dehydrogenase accessory protein  29.6 
 
 		 268 aa  93.2  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0498  formate dehydrogenase accessory protein  29.6 
 
 		 268 aa  93.2  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1437  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  25.81 
 
 		 255 aa  93.2  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0588  formate dehydrogenase accessory protein  29.6 
 
 		 268 aa  93.2  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0626  formate dehydrogenase accessory protein  29.2 
 
 		 268 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0406  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  35.25 
 
 		 284 aa  93.2  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2665  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  36.57 
 
 		 275 aa  92.8  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2451  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  27.02 
 
 		 281 aa  92.4  5e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0979035  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0654  formate dehydrogenase accessory protein  29.2 
 
 		 268 aa  92.4  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0817  formate dehydrogenase accessory protein  33.5 
 
 		 276 aa  92.4  6e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0766349  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0500  formate dehydrogenase accessory protein  29.6 
 
 		 268 aa  92  7e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1335  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  34.81 
 
 		 289 aa  90.9  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000543766 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2130  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  38.76 
 
 		 283 aa  90.9  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.455912  normal  0.581272 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0504  formate dehydrogenase accessory protein  29.96 
 
 		 269 aa  91.7  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11240  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  27.5 
 
 		 290 aa  90.9  1e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.559455 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0145  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  40.71 
 
 		 289 aa  90.9  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2431  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  31.14 
 
 		 297 aa  91.7  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3682  formate dehydrogenase subunit FdhD  25.71 
 
 		 279 aa  91.3  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0715  formate dehydrogenase accessory protein  29.2 
 
 		 268 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4711  formate dehydrogenase accessory protein  28.8 
 
 		 268 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4145  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  26.09 
 
 		 321 aa  90.5  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197477 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0444  formate dehydrogenase accessory protein  23.94 
 
 		 287 aa  90.1  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1325  formate dehydrogenase  26.17 
 
 		 282 aa  90.5  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.201918 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0501  formate dehydrogenase accessory protein  28.8 
 
 		 268 aa  89.7  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0758  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  32.89 
 
 		 299 aa  90.1  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0667  formate dehydrogenase, subunit FdhD  43.64 
 
 		 320 aa  89.7  3e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.187577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0784  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  32.89 
 
 		 299 aa  89.7  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3339  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  27.42 
 
 		 297 aa  89.4  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.224084 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1639  formate dehydrogenase accessory protein  32.13 
 
 		 223 aa  89.4  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0829  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  39.53 
 
 		 296 aa  89  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158751 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2346  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  45.05 
 
 		 284 aa  89  6e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.36394  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0110  formate dehydrogenase accessory protein  26.47 
 
 		 278 aa  88.6  7e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0106  formate dehydrogenase accessory protein  26.47 
 
 		 278 aa  88.6  7e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4019  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  26.95 
 
 		 288 aa  88.6  8e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0719  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  24.8 
 
 		 278 aa  88.2  9e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1320  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  29.06 
 
 		 254 aa  87.8  1e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4033  formate dehydrogenase accessory protein  27.86 
 
 		 287 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.681532  normal  0.294632 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0111  formate dehydrogenase accessory protein  26.05 
 
 		 278 aa  88.2  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0108  formate dehydrogenase accessory protein  27.2 
 
 		 278 aa  87.4  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0053  formate dehydrogenase, subunit FdhD  27.92 
 
 		 281 aa  87  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0107  formate dehydrogenase accessory protein  26.69 
 
 		 278 aa  87  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2305  formate dehydrogenase accessory protein  27.98 
 
 		 265 aa  87.4  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2347  formate dehydrogenase accessory protein  27.98 
 
 		 265 aa  87.4  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4143  formate dehydrogenase subunit FdhD  36.5 
 
 		 280 aa  86.7  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00469  formate dehydrogenase accessory protein  24.8 
 
 		 273 aa  86.7  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0885199  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2410  formate dehydrogenase subunit FdhD  26.54 
 
 		 240 aa  86.3  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.038103 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>