More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1386 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1386  fdhD protein  100 
 
 		 257 aa  525  1e-148  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1911  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  39.29 
 
 		 249 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1248  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  32.74 
 
 		 249 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0358  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  35.19 
 
 		 233 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.304436  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2019  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  32.49 
 
 		 260 aa  123  3e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.948078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2175  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  30.89 
 
 		 260 aa  123  4e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.145342 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1216  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  35.19 
 
 		 261 aa  122  7e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.944709  normal  0.100536 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0479  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  35.19 
 
 		 233 aa  122  7e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.161878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1440  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  34.72 
 
 		 233 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0280  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  33.2 
 
 		 282 aa  115  7.999999999999999e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.717981  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0547  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  34.13 
 
 		 237 aa  112  6e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2277  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  31.23 
 
 		 258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.181166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2876  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  31.69 
 
 		 262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0487293  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1033  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  33.06 
 
 		 266 aa  106  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0364714  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1030  formate dehydrogenase accessory protein  29.96 
 
 		 263 aa  105  5e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4115  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  30.9 
 
 		 255 aa  105  5e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.271618  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0780  formate dehydrogenase accessory protein FdhD  30.65 
 
 		 478 aa  103  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.162723  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1860  formate dehydrogenase accessory protein  29.34 
 
 		 260 aa  103  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1293  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  32.1 
 
 		 255 aa  103  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000222407  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0035  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  28.29 
 
 		 238 aa  104  2e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0211  formate dehydrogenase accessory protein  28.52 
 
 		 260 aa  103  3e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3370  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  30.92 
 
 		 487 aa  103  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3385  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  31.05 
 
 		 483 aa  102  5e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1681  formate dehydrogenase accessory protein  29.34 
 
 		 260 aa  102  5e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2451  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  30.99 
 
 		 281 aa  102  7e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0979035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2122  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  28.87 
 
 		 259 aa  102  8e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.545765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1500  formate dehydrogenase accessory protein  29.34 
 
 		 260 aa  101  9e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.919736  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0989  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  31.3 
 
 		 266 aa  101  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2204  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  30.04 
 
 		 254 aa  99.4  5e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.154366  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3374  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  29.01 
 
 		 260 aa  97.4  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0103  formate dehydrogenase accessory protein  30.52 
 
 		 278 aa  96.7  4e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2990  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  30.77 
 
 		 255 aa  96.3  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.68227e-19 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11240  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  31.22 
 
 		 290 aa  96.3  5e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.559455 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1840  formate dehydrogenase accessory protein  31.54 
 
 		 268 aa  96.3  5e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00380429  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0108  formate dehydrogenase accessory protein  30.52 
 
 		 278 aa  95.9  5e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0108  formate dehydrogenase accessory protein  30.52 
 
 		 278 aa  95.9  6e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0990  hypothetical protein  29.75 
 
 		 506 aa  95.5  7e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.663742 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0107  formate dehydrogenase accessory protein  30.52 
 
 		 278 aa  95.1  9e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1062  formate dehydrogenase, subunit FdhD  28.51 
 
 		 479 aa  93.6  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0656292 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0111  formate dehydrogenase accessory protein  30.52 
 
 		 278 aa  93.6  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4711  formate dehydrogenase accessory protein  26.94 
 
 		 268 aa  92.8  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0110  formate dehydrogenase accessory protein  30.12 
 
 		 278 aa  92.8  5e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0106  formate dehydrogenase accessory protein  30.12 
 
 		 278 aa  92.8  5e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0654  formate dehydrogenase accessory protein  27.87 
 
 		 268 aa  92  8e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0500  formate dehydrogenase accessory protein  26.53 
 
 		 268 aa  92  9e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0639  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  32.44 
 
 		 255 aa  91.7  1e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.444789  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0620  formate dehydrogenase accessory protein  30.17 
 
 		 288 aa  91.7  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.979772  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1923  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  28.74 
 
 		 280 aa  91.7  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00469  formate dehydrogenase accessory protein  28.17 
 
 		 273 aa  91.3  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0885199  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0626  formate dehydrogenase accessory protein  26.94 
 
 		 268 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1858  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  30.5 
 
 		 285 aa  91.7  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3364  formate dehydrogenase accessory protein  27.16 
 
 		 265 aa  90.5  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.144836  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2149  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  26.59 
 
 		 282 aa  90.9  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3628  formate dehydrogenase accessory protein  27.16 
 
 		 265 aa  90.5  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0715  formate dehydrogenase accessory protein  26.75 
 
 		 268 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1471  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  31.47 
 
 		 261 aa  90.9  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0194722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0444  formate dehydrogenase accessory protein  30.04 
 
 		 287 aa  90.5  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0556  formate dehydrogenase accessory protein  31.4 
 
 		 281 aa  90.5  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.152789  normal  0.415785 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0556  formate dehydrogenase accessory protein  26.53 
 
 		 268 aa  89.7  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0498  formate dehydrogenase accessory protein  26.53 
 
 		 268 aa  89.7  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3328  formate dehydrogenase accessory protein  27.16 
 
 		 265 aa  89.7  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0183588  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0588  formate dehydrogenase accessory protein  26.53 
 
 		 268 aa  89.7  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0644  formate dehydrogenase accessory protein  26.53 
 
 		 268 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2105  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  28.74 
 
 		 284 aa  89.7  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.719105  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2717  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  28.74 
 
 		 284 aa  89.7  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.546813  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2744  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  28.74 
 
 		 284 aa  89.7  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.135991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3678  formate dehydrogenase accessory protein  27.76 
 
 		 265 aa  89.4  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.688402  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2817  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  31.2 
 
 		 255 aa  89.4  6e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3578  formate dehydrogenase accessory protein  26.75 
 
 		 265 aa  89  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0300  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  31.25 
 
 		 268 aa  89  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3585  formate dehydrogenase accessory protein  27.16 
 
 		 265 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3278  formate dehydrogenase accessory protein  27.16 
 
 		 265 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0200  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  28.52 
 
 		 272 aa  88.6  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.754057  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0504  formate dehydrogenase accessory protein  26.53 
 
 		 269 aa  87.8  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0994  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  25.29 
 
 		 295 aa  88.2  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.506851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1157  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  32.56 
 
 		 274 aa  87.8  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0501  formate dehydrogenase accessory protein  26.53 
 
 		 268 aa  87  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0829  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  28.73 
 
 		 265 aa  87.8  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0159111  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1423  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  27.67 
 
 		 289 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1042  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  27.07 
 
 		 243 aa  87.4  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0564626  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6406  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  27.67 
 
 		 289 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.678396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1914  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  31.07 
 
 		 285 aa  86.7  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.84446  hitchhiker  0.0000450272 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2076  formate dehydrogenase, subunit FdhD  28.63 
 
 		 263 aa  87  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  9.82479e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0719  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  27.31 
 
 		 278 aa  87  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1205  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  31.42 
 
 		 303 aa  87  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.495294 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12240  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  29.43 
 
 		 272 aa  86.7  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6044  formate dehydrogenase, subunit FdhD  27.78 
 
 		 278 aa  86.7  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1437  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  28.1 
 
 		 255 aa  86.3  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3595  formate dehydrogenase accessory protein  26.75 
 
 		 265 aa  85.9  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3157  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  30.53 
 
 		 281 aa  85.9  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.630603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7065  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  27.27 
 
 		 289 aa  85.5  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.20274  normal  0.543352 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2264  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  27.27 
 
 		 468 aa  85.1  9e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3534  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  27.6 
 
 		 284 aa  84.7  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1958  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  27.27 
 
 		 468 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3478  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  30.19 
 
 		 292 aa  85.1  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.739751  normal  0.474196 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0389  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  28.85 
 
 		 273 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.318407 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2382  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  29.89 
 
 		 277 aa  84  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0665  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  29.58 
 
 		 279 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0145  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  32 
 
 		 289 aa  84  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0877  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  29.48 
 
 		 288 aa  84  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>