More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1042 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1042  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  100 
 
 		 243 aa  479  1e-134  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0564626  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2122  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  54.58 
 
 		 259 aa  268  4e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.545765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1216  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  46.03 
 
 		 261 aa  218  8.999999999999998e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.944709  normal  0.100536 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2220  hypothetical protein  44.98 
 
 		 246 aa  187  1e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2204  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  43.72 
 
 		 254 aa  186  2e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.154366  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1513  formate dehydrogenase subunit FdhD  38.82 
 
 		 247 aa  143  3e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0566283 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0799  hypothetical protein  40.8 
 
 		 210 aa  125  7e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000364297 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2876  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  30.9 
 
 		 262 aa  115  5e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0487293  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0989  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  29.44 
 
 		 266 aa  115  6e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0035  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  30.67 
 
 		 238 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1840  formate dehydrogenase accessory protein  29.06 
 
 		 268 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00380429  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2175  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  32.05 
 
 		 260 aa  106  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.145342 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1033  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  28.09 
 
 		 266 aa  106  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0364714  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3678  formate dehydrogenase accessory protein  27.43 
 
 		 265 aa  106  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.688402  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3585  formate dehydrogenase accessory protein  26.58 
 
 		 265 aa  106  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3595  formate dehydrogenase accessory protein  26.58 
 
 		 265 aa  105  5e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3364  formate dehydrogenase accessory protein  26.58 
 
 		 265 aa  105  9e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.144836  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3628  formate dehydrogenase accessory protein  26.58 
 
 		 265 aa  105  9e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0639  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  30.2 
 
 		 255 aa  104  1e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.444789  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3328  formate dehydrogenase accessory protein  26.58 
 
 		 265 aa  104  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0183588  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1437  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  28.29 
 
 		 255 aa  104  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1320  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  29.6 
 
 		 254 aa  104  1e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3578  formate dehydrogenase accessory protein  26.58 
 
 		 265 aa  104  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3278  formate dehydrogenase accessory protein  27 
 
 		 265 aa  103  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2076  formate dehydrogenase, subunit FdhD  31.78 
 
 		 263 aa  103  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  9.82479e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2557  formate dehydrogenase accessory protein  32.63 
 
 		 269 aa  103  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.266553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0501  formate dehydrogenase accessory protein  26.88 
 
 		 268 aa  103  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3374  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  27.47 
 
 		 260 aa  103  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2277  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  28.35 
 
 		 258 aa  103  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.181166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1058  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  31.93 
 
 		 264 aa  102  4e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1030  formate dehydrogenase accessory protein  29.24 
 
 		 263 aa  101  9e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0504  formate dehydrogenase accessory protein  27.02 
 
 		 269 aa  101  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3819  formate dehydrogenase accessory protein  32.5 
 
 		 269 aa  101  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.934196  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0715  formate dehydrogenase accessory protein  26.48 
 
 		 268 aa  100  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0626  formate dehydrogenase accessory protein  26.07 
 
 		 268 aa  101  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00469  formate dehydrogenase accessory protein  31.64 
 
 		 273 aa  101  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0885199  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4711  formate dehydrogenase accessory protein  26.07 
 
 		 268 aa  101  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0654  formate dehydrogenase accessory protein  26.36 
 
 		 268 aa  100  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3577  formate dehydrogenase accessory protein  34.54 
 
 		 274 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2347  formate dehydrogenase accessory protein  28.76 
 
 		 265 aa  100  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1923  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  29.79 
 
 		 280 aa  100  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3572  formate dehydrogenase accessory protein  34.54 
 
 		 274 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2305  formate dehydrogenase accessory protein  28.76 
 
 		 265 aa  100  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3645  formate dehydrogenase accessory protein  34.54 
 
 		 274 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.259742 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0466  formate dehydrogenase accessory protein  27.97 
 
 		 262 aa  100  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.276769  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2817  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  27.39 
 
 		 255 aa  99.8  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1343  formate dehydrogenase accessory protein  31.06 
 
 		 263 aa  99  6e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1205  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  30.47 
 
 		 303 aa  99  6e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.495294 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0556  formate dehydrogenase accessory protein  25 
 
 		 268 aa  98.2  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0498  formate dehydrogenase accessory protein  25 
 
 		 268 aa  98.2  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0588  formate dehydrogenase accessory protein  25 
 
 		 268 aa  98.2  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4115  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  27.41 
 
 		 255 aa  97.8  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.271618  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0644  formate dehydrogenase accessory protein  25 
 
 		 268 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0500  formate dehydrogenase accessory protein  25 
 
 		 268 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1062  formate dehydrogenase, subunit FdhD  30.87 
 
 		 479 aa  97.4  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0656292 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0817  formate dehydrogenase accessory protein  27.12 
 
 		 276 aa  97.4  2e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0766349  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1639  formate dehydrogenase accessory protein  26.94 
 
 		 223 aa  96.3  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12913  formate dehydrogenase accessory protein  31.47 
 
 		 276 aa  96.3  4e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.167876  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1390  formate dehydrogenase accessory protein FdhD  33.61 
 
 		 306 aa  95.9  5e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.780868  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2149  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  30.2 
 
 		 282 aa  95.9  5e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1860  formate dehydrogenase accessory protein  28.45 
 
 		 260 aa  95.1  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0211  formate dehydrogenase accessory protein  26.29 
 
 		 260 aa  95.1  1e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3339  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  30.62 
 
 		 297 aa  94.4  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.224084 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1858  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  32.77 
 
 		 285 aa  93.6  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2382  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  32.35 
 
 		 277 aa  94  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2451  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  26.97 
 
 		 281 aa  94.4  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0979035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2060  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  26.18 
 
 		 262 aa  94  2e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000863556  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1386  fdhD protein  28.38 
 
 		 257 aa  93.2  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3534  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  33.2 
 
 		 284 aa  93.2  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1911  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  32 
 
 		 249 aa  93.6  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1681  formate dehydrogenase accessory protein  28.21 
 
 		 260 aa  92.4  6e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1500  formate dehydrogenase accessory protein  28.21 
 
 		 260 aa  92.4  6e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.919736  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4473  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  31.11 
 
 		 276 aa  92  7e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.979472  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0990  hypothetical protein  29.88 
 
 		 506 aa  92  7e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.663742 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06930  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  29.39 
 
 		 297 aa  92  7e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.215671 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1157  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  31.45 
 
 		 274 aa  91.7  9e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2665  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  29.57 
 
 		 275 aa  91.3  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4114  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  28.09 
 
 		 293 aa  91.3  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3467  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  31.17 
 
 		 294 aa  91.3  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2747  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  31.78 
 
 		 292 aa  91.3  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0059323 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2742  formate dehydrogenase accessory protein  33.2 
 
 		 271 aa  90.5  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.455642 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3370  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  27.62 
 
 		 487 aa  90.9  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0200  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  30.13 
 
 		 272 aa  90.9  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.754057  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15020  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  31.1 
 
 		 281 aa  90.5  2e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.503102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5379  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  32.19 
 
 		 248 aa  90.9  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0597745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3478  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  31.67 
 
 		 292 aa  90.1  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.739751  normal  0.474196 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1081  formate dehydrogenase accessory protein  32.07 
 
 		 271 aa  89.7  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0994  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  28.87 
 
 		 295 aa  90.1  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.506851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0806  formate dehydrogenase accessory protein  28.99 
 
 		 276 aa  89.7  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4033  formate dehydrogenase accessory protein  30.36 
 
 		 287 aa  89.4  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.681532  normal  0.294632 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1624  formate dehydrogenase accessory protein  30.12 
 
 		 275 aa  89  6e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.199677  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1471  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  31.86 
 
 		 261 aa  89  7e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0194722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2744  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  31.82 
 
 		 251 aa  89  7e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3635  formate dehydrogenase accessory protein  29.83 
 
 		 274 aa  88.6  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.222739 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1654  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  30.4 
 
 		 282 aa  88.6  8e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2130  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  29.24 
 
 		 283 aa  88.6  8e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.455912  normal  0.581272 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1352  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  30.4 
 
 		 282 aa  88.6  8e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2593  formate dehydrogenase accessory protein  31.08 
 
 		 278 aa  88.6  9e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3715  formate dehydrogenase subunit FdhD  30.36 
 
 		 275 aa  87.8  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.351414  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0784  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  24.9 
 
 		 299 aa  88.2  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>