More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02271 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02271  hypothetical protein  100 
 
 		 276 aa  572  1.0000000000000001e-162  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003500  formate dehydrogenase chain D  94.49 
 
 		 277 aa  541  1e-153  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1126  formate dehydrogenase accessory protein  84.31 
 
 		 337 aa  499  1e-140  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1448  putative formate dehydrogenase accessory protein  76.95 
 
 		 283 aa  442  1e-123  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3714  formate dehydrogenase, subunit FdhD  64.04 
 
 		 298 aa  369  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.272943  normal  0.525322 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0053  formate dehydrogenase, subunit FdhD  64.71 
 
 		 281 aa  370  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4819  formate dehydrogenase subunit FdhD  66.04 
 
 		 298 aa  369  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3910  formate dehydrogenase accessory protein FdhD, putative  64.53 
 
 		 298 aa  367  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.131875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3619  formate dehydrogenase accessory protein FdhD, putative  64.84 
 
 		 282 aa  369  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4143  formate dehydrogenase subunit FdhD  64.04 
 
 		 280 aa  367  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3785  formate dehydrogenase, subunit FdhD  64.04 
 
 		 298 aa  367  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0292467  normal  0.549187 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4427  formate dehydrogenase, subunit FdhD  63.67 
 
 		 295 aa  362  3e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0343  formate dehydrogenase, subunit FdhD  63.26 
 
 		 298 aa  358  6e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00229888  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0051  formate dehydrogenase, subunit FdhD  62.88 
 
 		 284 aa  355  5e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4218  formate dehydrogenase subunit FdhD  62.69 
 
 		 296 aa  352  2.9999999999999997e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.072328  normal  0.431807 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4503  formate dehydrogenase accessory protein FdhD, putative  65.84 
 
 		 249 aa  352  4e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4130  formate dehydrogenase subunit FdhD  62.69 
 
 		 296 aa  352  4e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.142791  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4100  formate dehydrogenase subunit FdhD  62.69 
 
 		 296 aa  352  4e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.015822  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0239  formate dehydrogenase subunit FdhD  62.69 
 
 		 290 aa  351  5.9999999999999994e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000144632 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1909  formate dehydrogenase, subunit FdhD  50.9 
 
 		 300 aa  296  3e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0648  formate dehydrogenase, subunit FdhD  50.92 
 
 		 276 aa  285  7e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3715  formate dehydrogenase subunit FdhD  47.83 
 
 		 275 aa  276  2e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.351414  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2756  formate dehydrogenase subunit FdhD  53.2 
 
 		 278 aa  272  3e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000145311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0687  formate dehydrogenase, subunit FdhD  52.8 
 
 		 276 aa  272  4.0000000000000004e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2786  formate dehydrogenase subunit FdhD  50.39 
 
 		 296 aa  272  4.0000000000000004e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0374953  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3459  formate dehydrogenase, subunit FdhD  50.39 
 
 		 296 aa  272  4.0000000000000004e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.215556 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3256  formate dehydrogenase, subunit FdhD  48.46 
 
 		 280 aa  270  1e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.340615  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2367  FDHD protein  52.99 
 
 		 291 aa  265  5.999999999999999e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0478854 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2176  formate dehydrogenase subunit FdhD  50.19 
 
 		 291 aa  263  3e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.60851  normal  0.0520829 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2580  formate dehydrogenase subunit FdhD  50.19 
 
 		 291 aa  263  3e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.437396  normal  0.264505 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1176  putative fdhD protein  49.81 
 
 		 299 aa  261  1e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.108793 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3723  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  47.04 
 
 		 303 aa  254  2.0000000000000002e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.521477 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4057  formate dehydrogenase, subunit FdhD  48.28 
 
 		 290 aa  246  3e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0839  formate dehydrogenase, subunit FdhD  46.44 
 
 		 290 aa  246  4e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.145713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5485  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  45.72 
 
 		 290 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2431  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  43.7 
 
 		 297 aa  228  8e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0942  formate dehydrogenase, subunit FdhD  41.72 
 
 		 319 aa  228  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3132  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  42.86 
 
 		 296 aa  226  2e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3756  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  46.33 
 
 		 293 aa  218  6e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3282  putative formate dehydrogenase accessory protein FdhD  46.15 
 
 		 294 aa  209  4e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.610509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1205  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  35.78 
 
 		 303 aa  154  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.495294 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2876  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  35.86 
 
 		 262 aa  150  3e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0487293  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0989  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  29.39 
 
 		 266 aa  130  3e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1840  formate dehydrogenase accessory protein  32.37 
 
 		 268 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00380429  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3678  formate dehydrogenase accessory protein  29.23 
 
 		 265 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.688402  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3578  formate dehydrogenase accessory protein  28.46 
 
 		 265 aa  126  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0715  formate dehydrogenase accessory protein  27.39 
 
 		 268 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1958  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  33.62 
 
 		 468 aa  124  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2264  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  33.62 
 
 		 468 aa  124  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0501  formate dehydrogenase accessory protein  29.51 
 
 		 268 aa  122  9e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0654  formate dehydrogenase accessory protein  27.2 
 
 		 268 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3585  formate dehydrogenase accessory protein  27.69 
 
 		 265 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3364  formate dehydrogenase accessory protein  27.69 
 
 		 265 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.144836  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3278  formate dehydrogenase accessory protein  27.69 
 
 		 265 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3628  formate dehydrogenase accessory protein  27.69 
 
 		 265 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3595  formate dehydrogenase accessory protein  27.69 
 
 		 265 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3328  formate dehydrogenase accessory protein  27.69 
 
 		 265 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0183588  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3374  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  30.54 
 
 		 260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4711  formate dehydrogenase accessory protein  27.2 
 
 		 268 aa  120  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0626  formate dehydrogenase accessory protein  27.2 
 
 		 268 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0556  formate dehydrogenase accessory protein  26.36 
 
 		 268 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0498  formate dehydrogenase accessory protein  26.36 
 
 		 268 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0644  formate dehydrogenase accessory protein  26.36 
 
 		 268 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0588  formate dehydrogenase accessory protein  26.36 
 
 		 268 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0466  formate dehydrogenase accessory protein  26.98 
 
 		 262 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.276769  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0500  formate dehydrogenase accessory protein  26.36 
 
 		 268 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06930  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  29.2 
 
 		 297 aa  116  5e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.215671 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3385  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  31.65 
 
 		 483 aa  116  5e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1062  formate dehydrogenase, subunit FdhD  30.38 
 
 		 479 aa  115  6e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0656292 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1343  formate dehydrogenase accessory protein  30.25 
 
 		 263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1033  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  28.93 
 
 		 266 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0364714  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0780  formate dehydrogenase accessory protein FdhD  30.93 
 
 		 478 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.162723  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1293  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  33.47 
 
 		 255 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000222407  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0817  formate dehydrogenase accessory protein  26.44 
 
 		 276 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0766349  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0504  formate dehydrogenase accessory protein  27.62 
 
 		 269 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1058  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  29.75 
 
 		 264 aa  112  9e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1678  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  29.92 
 
 		 250 aa  111  1.0000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0788652  normal  0.0488768 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1639  formate dehydrogenase accessory protein  28.91 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1437  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  29.2 
 
 		 255 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2175  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  28.69 
 
 		 260 aa  110  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.145342 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2076  formate dehydrogenase, subunit FdhD  30.68 
 
 		 263 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  9.82479e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2347  formate dehydrogenase accessory protein  28.45 
 
 		 265 aa  109  5e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2305  formate dehydrogenase accessory protein  28.45 
 
 		 265 aa  109  5e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1030  formate dehydrogenase accessory protein  30.17 
 
 		 263 aa  108  8.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2817  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  28 
 
 		 255 aa  108  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1216  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  28.69 
 
 		 261 aa  107  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.944709  normal  0.100536 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2990  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  30.58 
 
 		 255 aa  106  5e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.68227e-19 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1923  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  28.51 
 
 		 280 aa  105  6e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0211  formate dehydrogenase accessory protein  28.03 
 
 		 260 aa  105  9e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3370  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  29.46 
 
 		 487 aa  103  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1208  formate dehydrogenase, subunit FdhD  53.47 
 
 		 109 aa  103  4e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000012099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4115  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  23.83 
 
 		 255 aa  100  4e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.271618  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2204  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  27.24 
 
 		 254 aa  96.7  4e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.154366  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2060  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  27.47 
 
 		 262 aa  94.7  1e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000863556  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1860  formate dehydrogenase accessory protein  26.72 
 
 		 260 aa  94.7  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2010  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  27.23 
 
 		 248 aa  94.4  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.068526  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0358  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  35.29 
 
 		 233 aa  93.2  4e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.304436  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1681  formate dehydrogenase accessory protein  28.09 
 
 		 260 aa  92.4  7e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1500  formate dehydrogenase accessory protein  28.09 
 
 		 260 aa  92  8e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.919736  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2451  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  26.05 
 
 		 281 aa  91.3  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0979035  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>