152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0584 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0584  selenocysteine synthase  100 
 
 		 431 aa  825    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3738  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  65.96 
 
 		 429 aa  484  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241783  normal  0.0172698 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5689  L-seryl-tRNA selenium transferase  65.48 
 
 		 455 aa  462  1e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5215  selenocysteine synthase  62.38 
 
 		 425 aa  421  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5303  selenocysteine synthase  62.38 
 
 		 425 aa  421  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5595  selenocysteine synthase  62.38 
 
 		 425 aa  420  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.116536 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1608  selenocysteine synthase  66.59 
 
 		 435 aa  396  1e-109  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0237465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5281  selenocysteine synthase  59.03 
 
 		 432 aa  380  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04250  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  58.92 
 
 		 458 aa  374  1e-102  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.2703 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16930  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  56.84 
 
 		 433 aa  372  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.211472  normal  0.41597 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3579  L-seryl-tRNA selenium transferase  57.37 
 
 		 439 aa  370  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.963562  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1631  L-seryl-tRNA selenium transferase  58.63 
 
 		 436 aa  339  5e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09650  selenocysteine synthase  56.68 
 
 		 440 aa  322  6e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.789382  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6183  selenocysteine synthase  53.77 
 
 		 455 aa  286  2.9999999999999996e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal  0.101949 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0439  selenocysteine synthase  52.66 
 
 		 535 aa  283  6.000000000000001e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1162  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  35.68 
 
 		 476 aa  276  5e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103584 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0672  selenocysteine synthase  42.53 
 
 		 462 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0140  selenocysteine synthase  42.06 
 
 		 463 aa  268  1e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2504  selenocysteine synthase  42.27 
 
 		 470 aa  266  4e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0196405  normal  0.0690834 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4115  selenocysteine synthase  40.62 
 
 		 462 aa  266  5e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3766  selenocysteine synthase  40.99 
 
 		 462 aa  266  5e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0042  selenocysteine synthase  40.62 
 
 		 462 aa  266  5e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2373  selenocysteine synthase  36.58 
 
 		 462 aa  264  2e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2085  selenocysteine synthase  36.58 
 
 		 462 aa  263  6.999999999999999e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0760  selenocysteine synthase  40.39 
 
 		 472 aa  262  8.999999999999999e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.306605  normal  0.694521 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4068  selenocysteine synthase  42.38 
 
 		 463 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3897  selenocysteine synthase  42.16 
 
 		 463 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4006  selenocysteine synthase  42.16 
 
 		 463 aa  262  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.247282 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3961  selenocysteine synthase  42.38 
 
 		 463 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.498417  normal  0.481861 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3883  selenocysteine synthase  42.16 
 
 		 463 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.851696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4157  selenocysteine synthase  42.64 
 
 		 478 aa  260  3e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.109282 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1646  selenocysteine synthase  42.93 
 
 		 471 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000318162  unclonable  0.000000000338513 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2706  selenocysteine synthase  39.69 
 
 		 468 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277049 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1093  selenocysteine synthase  41.65 
 
 		 473 aa  253  5.000000000000001e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0812  L-seryl-tRNA selenium transferase  42.37 
 
 		 468 aa  252  7e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0493  selenocysteine synthase  39.55 
 
 		 475 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.568026 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3988  selenocysteine synthase  45.62 
 
 		 479 aa  250  3e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2186  selenocysteine synthase  36.07 
 
 		 475 aa  250  3e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000130274  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3540  selenocysteine synthase  45.62 
 
 		 479 aa  251  3e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.607599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0527  selenocysteine synthase  39.55 
 
 		 475 aa  250  4e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.817809 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0873  selenocysteine synthase  39.1 
 
 		 468 aa  249  5e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3919  selenocysteine synthase  40.84 
 
 		 463 aa  249  8e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.419812 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0548  selenocysteine synthase  43.2 
 
 		 475 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.147839 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2867  selenocysteine synthase  39.46 
 
 		 465 aa  247  3e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.861059  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0090  selenocysteine synthase  40.77 
 
 		 463 aa  247  4e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3060  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  41.05 
 
 		 491 aa  247  4e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000814567  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0536  selenocysteine synthase  39.47 
 
 		 475 aa  244  3e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3883  selenocysteine synthase  44.76 
 
 		 479 aa  244  3e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3486  selenocysteine synthase  39.34 
 
 		 484 aa  243  5e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0801308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63540  selenocysteine synthase  40.8 
 
 		 468 aa  242  7e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.219869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0831  selenocysteine synthase  32.67 
 
 		 449 aa  242  7.999999999999999e-63  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.322314  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0506  selenocysteine synthase  40.57 
 
 		 468 aa  241  2e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.487693  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2561  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  35.23 
 
 		 470 aa  241  2e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3381  selenocysteine synthase  44.07 
 
 		 478 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1983  selenocysteine synthase  47.77 
 
 		 455 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.484837  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6556  selenocysteine synthase  42.16 
 
 		 476 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0759041  decreased coverage  0.00101657 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3796  selenocysteine synthase  39.52 
 
 		 468 aa  240  4e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.245945  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0765  L-seryl-tRNA selenium transferase  36.8 
 
 		 442 aa  239  6.999999999999999e-62  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.522445  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0440  selenocysteine synthase  41.81 
 
 		 491 aa  238  1e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2392  selenocysteine synthase  43.52 
 
 		 480 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.36039  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2965  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  44.84 
 
 		 446 aa  238  1e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0158372  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1569  selenocysteine synthase  32.09 
 
 		 440 aa  238  2e-61  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.339371  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1678.1  selenocysteine synthase  43.26 
 
 		 480 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0726  selenocysteine synthase  43.26 
 
 		 480 aa  237  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1696  selenocysteine synthase  43.26 
 
 		 480 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1903  selenocysteine synthase  43.26 
 
 		 480 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2255  selenocysteine synthase  43.26 
 
 		 480 aa  237  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0575  selenocysteine synthase  43.26 
 
 		 480 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.81182  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5527  selenocysteine synthase  40.05 
 
 		 468 aa  238  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0441  selenocysteine synthase  41.81 
 
 		 491 aa  238  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3879  selenocysteine synthase  39.37 
 
 		 468 aa  237  3e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.797755 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4006  selenocysteine synthase  40.71 
 
 		 463 aa  237  4e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4521  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  41.36 
 
 		 472 aa  236  5.0000000000000005e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1546  selenocysteine synthase  29.89 
 
 		 442 aa  236  5.0000000000000005e-61  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1380  selenocysteine synthase  32.09 
 
 		 440 aa  236  6e-61  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.924415  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1740  selenocysteine synthase  38.18 
 
 		 475 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.820555  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03446  selenocysteine synthase  40.62 
 
 		 463 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0117  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  40.62 
 
 		 463 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03397  hypothetical protein  40.62 
 
 		 463 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4962  selenocysteine synthase  40.62 
 
 		 463 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.922888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4162  selenocysteine synthase  43.13 
 
 		 462 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0273  selenocysteine synthase  32.56 
 
 		 440 aa  234  2.0000000000000002e-60  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3796  selenocysteine synthase  40.62 
 
 		 463 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.915143  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0122  selenocysteine synthase  40.62 
 
 		 463 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4089  selenocysteine synthase  40.4 
 
 		 463 aa  233  5e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0106  selenocysteine synthase  37.36 
 
 		 476 aa  231  2e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0101  selenocysteine synthase  37.36 
 
 		 473 aa  231  2e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0105  selenocysteine synthase  37.61 
 
 		 473 aa  229  5e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25310  seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  37.09 
 
 		 477 aa  229  6e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.362155 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4522  selenocysteine synthase  41.22 
 
 		 478 aa  229  7e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.843638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0412  selenocysteine synthase  40.83 
 
 		 491 aa  229  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0106  selenocysteine synthase  37.14 
 
 		 476 aa  228  1e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0301  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  43.92 
 
 		 466 aa  227  3e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0108  selenocysteine synthase  36.04 
 
 		 476 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1311  selenocysteine synthase  44.1 
 
 		 506 aa  226  7e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000207864 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0104  selenocysteine synthase  36.26 
 
 		 476 aa  226  7e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0109  selenocysteine synthase  36.26 
 
 		 476 aa  226  7e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0061  selenocysteine synthase  42.23 
 
 		 462 aa  224  3e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3059  selenocysteine synthase  48.28 
 
 		 483 aa  223  4.9999999999999996e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00615002  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0442  selenocysteine synthase  36.95 
 
 		 496 aa  220  3e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>