296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3849 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_3849  ABC-2 type transporter  100 
 
 
252 aa  483  1e-135  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3261  ABC-2 type transporter  47.76 
 
 
249 aa  223  3e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0497  ABC-2 type transporter  27.48 
 
 
286 aa  102  8e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.779296  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1123  ABC-2 type transporter  27.4 
 
 
257 aa  94  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4106  ABC-2 type transporter  28.38 
 
 
293 aa  89.7  4e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1380  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.96 
 
 
256 aa  89.7  4e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000932687  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1426  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.51 
 
 
256 aa  88.6  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0562869  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0388  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.51 
 
 
249 aa  86.3  4e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.169706  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2056  ABC-2 type transporter  27.8 
 
 
241 aa  85.5  7e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.794734  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0785  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  25.5 
 
 
253 aa  82  0.000000000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1448  putative ABC transporter transmembrane protein  29.25 
 
 
252 aa  81.6  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1170  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.4 
 
 
253 aa  81.6  0.00000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1766  multidrug ABC transporter, permease protein  28.09 
 
 
242 aa  80.5  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0062  ABC-2 type transporter  23.29 
 
 
260 aa  79.7  0.00000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000566487  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0014  ABC-2 type transporter  24.82 
 
 
304 aa  79.3  0.00000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0476  ABC transporter  26.38 
 
 
261 aa  79.3  0.00000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0918062 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1478  ABC-2 type transporter  28.1 
 
 
254 aa  78.2  0.0000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0966  ABC-2 type transporter  22.69 
 
 
259 aa  78.2  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1203  ABC-2 type transporter  25.84 
 
 
251 aa  78.2  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0595438 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1165  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  25.59 
 
 
253 aa  77.8  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2409  ABC-2 type transporter  27.05 
 
 
253 aa  77.8  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2588  ABC-2 type transporter  27.83 
 
 
298 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3518  ABC-2 type transporter  27.83 
 
 
298 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4873  ABC-2 type transporter  26.67 
 
 
298 aa  76.6  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23570  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  25.83 
 
 
267 aa  75.9  0.0000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.24456  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05121  putative multidrug efflux ABC transporter  30.43 
 
 
274 aa  74.7  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0192  hypothetical protein  26.19 
 
 
295 aa  73.9  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.144906 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0176  hypothetical protein  23.75 
 
 
241 aa  74.3  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.67071  normal  0.0449558 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2864  ABC-2 type transporter  24.44 
 
 
290 aa  73.6  0.000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  24.3 
 
 
250 aa  73.2  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1079  ABC-2 type transporter  27.44 
 
 
296 aa  72.8  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3408  ABC-2 type transporter, permease protein  20.9 
 
 
243 aa  72.8  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184246  normal  0.618546 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1510  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  24.3 
 
 
253 aa  72.4  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.525568  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0906  ABC-2 type transporter  26.39 
 
 
253 aa  72.4  0.000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000570099 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4150  hypothetical protein  24.66 
 
 
261 aa  72  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000233601  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1126  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  25.64 
 
 
254 aa  72  0.000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.339371  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3137  ABC-2 type transporter  25.71 
 
 
277 aa  72  0.000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.428202  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4170  ABC-2 type transporter  24.88 
 
 
270 aa  70.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6126  ABC-2 type transporter  23.04 
 
 
275 aa  70.5  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0365687  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3861  ABC-2 type transporter  26.07 
 
 
291 aa  70.5  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.92497  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  25.82 
 
 
249 aa  70.5  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3574  ABC transporter, permease protein  25.12 
 
 
254 aa  69.7  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.426841  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2561  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.76 
 
 
249 aa  69.7  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.760407 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1750  putative multidrug efflux ABC transporter  26.77 
 
 
277 aa  69.3  0.00000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0190039  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05051  putative multidrug efflux ABC transporter  28.02 
 
 
274 aa  69.3  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.507008  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0449  putative multidrug efflux ABC transporter  28.71 
 
 
274 aa  68.9  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.603097  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2065  ABC-2 type transporter  22.22 
 
 
254 aa  68.9  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1561  ABC-2 type transporter  25.89 
 
 
252 aa  68.9  0.00000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.403911  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0251  ABC-2 type transporter  28.63 
 
 
255 aa  68.9  0.00000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.452318 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04741  putative multidrug efflux ABC transporter  28.71 
 
 
274 aa  68.9  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1448  ABC-2 type transporter  25.23 
 
 
251 aa  68.9  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0318973  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2893  ABC-2 type transporter  24.24 
 
 
270 aa  68.9  0.00000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0380  ABC-2 type transporter  22.27 
 
 
280 aa  68.6  0.00000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3882  ABC-2 type transporter  21.83 
 
 
278 aa  68.6  0.00000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6375  ABC-2 type transporter  23.56 
 
 
247 aa  68.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2716  ABC-2 type transporter  27.49 
 
 
254 aa  68.2  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3239  ABC transporter efflux permease  26.61 
 
 
249 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0786  ABC-2 type transporter  22.98 
 
 
254 aa  67.4  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.585621  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3492  ABC transporter permease  26.61 
 
 
249 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.799548  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2250  ABC-2 type transporter  22.78 
 
 
256 aa  67.8  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.239998  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0242  ABC-2 type transporter  24.48 
 
 
278 aa  67.4  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3453  ABC transporter, efflux permease protein  26.61 
 
 
249 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0426  ABC-2 type transporter  26.1 
 
 
256 aa  67  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0223  hypothetical protein  26.64 
 
 
251 aa  67  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.587044  normal  0.793487 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8873  ABC-2 type transporter  21.23 
 
 
270 aa  66.2  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.53633  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3149  ABC transporter efflux permease; daunorubicin resistance transmembrane protein  26.21 
 
 
249 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0286068  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1358  ABC-2 type transporter  27.4 
 
 
294 aa  66.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.624692  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1808  ABC transporter, efflux permease protein  25.61 
 
 
249 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0340  ABC-2 type transporter  24.66 
 
 
273 aa  65.9  0.0000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.171685  hitchhiker  0.00234396 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3467  ABC transporter, efflux permease protein  25.2 
 
 
249 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000810233  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2407  ABC-2 type transporter  23.7 
 
 
288 aa  65.5  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000146811  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0427  ABC-2 type transporter  25.33 
 
 
278 aa  65.5  0.0000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.469533  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1683  ABC-2 type transporter  24.14 
 
 
274 aa  64.7  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000181652  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3547  ABC-2 type transporter  21.9 
 
 
259 aa  64.7  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.369986 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0542  ABC-2 type transporter  24.19 
 
 
253 aa  64.7  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0215  ABC-2 type transporter  22.17 
 
 
275 aa  65.1  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.716105  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4936  ABC-2 type transporter  24.15 
 
 
280 aa  63.9  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.707728  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0287  hypothetical protein  26.02 
 
 
241 aa  63.9  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.301015  normal  0.184502 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1861  ABC-2 type transporter  22.89 
 
 
258 aa  63.9  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04481  putative multidrug efflux ABC transporter  26.13 
 
 
284 aa  63.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.86864  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1533  ABC-2 type transporter  23.58 
 
 
274 aa  63.5  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3016  ABC-2 type transporter  23.29 
 
 
254 aa  63.5  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.021308 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  24.53 
 
 
249 aa  63.5  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4739  ABC-2 type transporter  22.96 
 
 
285 aa  63.2  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0612  putative multidrug efflux ABC transporter  28.14 
 
 
284 aa  63.5  0.000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2221  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  21.39 
 
 
273 aa  63.9  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000454003  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4383  ABC-2 type transporter  25.98 
 
 
253 aa  63.5  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2328  transporter, putative  26.6 
 
 
246 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.117528  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2157  ABC transporter protein  22.16 
 
 
284 aa  63.2  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3438  ABC transporter, efflux permease protein  26.02 
 
 
249 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1958  ABC-2 type transporter  26.51 
 
 
250 aa  62.8  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00055396  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0375  ABC-2 type transporter  24.24 
 
 
264 aa  62.4  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.133292  hitchhiker  0.00534901 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3446  ABC transporter, efflux permease protein  26.02 
 
 
249 aa  62.4  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00692281  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3132  ABC-2 type transporter  22.78 
 
 
248 aa  62  0.000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.571081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3212  ABC transporter efflux permease; daunorubicin resistance transmembrane protein  27.02 
 
 
249 aa  61.6  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2515  ABC transporter, permease protein  21.97 
 
 
278 aa  61.6  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0096  ABC-2 type transporter  22.01 
 
 
247 aa  61.2  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5588  ABC-2 type transporter  24.81 
 
 
261 aa  61.6  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3147  ABC-2 type transporter  25.81 
 
 
249 aa  61.2  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.145802  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0042  ABC-2 type transporter  21.9 
 
 
266 aa  61.6  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>