More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1980 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1980  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 		 411 aa  834    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1821  FAD linked oxidase domain-containing protein  76.85 
 
 		 409 aa  652    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.778953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1443  FAD linked oxidase domain protein  25.72 
 
 		 443 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1414  FAD linked oxidase domain protein  25.72 
 
 		 443 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1368  FAD linked oxidase-like  26.29 
 
 		 446 aa  106  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0179747 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5295  FAD linked oxidase domain protein  25.91 
 
 		 446 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3051  FAD linked oxidase-like  23.74 
 
 		 469 aa  103  7e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.89467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3682  FAD linked oxidase-like  25.23 
 
 		 451 aa  102  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1715  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.91 
 
 		 462 aa  100  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.131468  normal  0.62537 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2034  FAD linked oxidase domain protein  25.23 
 
 		 462 aa  99  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0807703  normal  0.594146 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1099  FAD linked oxidase domain protein  25.06 
 
 		 456 aa  98.2  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.160498  normal  0.70916 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3873  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.88 
 
 		 459 aa  95.9  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.132225  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0567  hypothetical protein  23.92 
 
 		 449 aa  95.5  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.806895  decreased coverage  0.0060454 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2889  FAD linked oxidase domain protein  30.45 
 
 		 1000 aa  91.3  3e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4667  FAD linked oxidase domain protein  32.34 
 
 		 469 aa  90.1  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.526864 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0798  putative FAD linked oxidase  29.19 
 
 		 474 aa  88.6  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2134  hypothetical protein  31.43 
 
 		 1024 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13511  FAD/FMN-containing dehydrogenase  24.77 
 
 		 443 aa  89  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1082  hypothetical protein  28.02 
 
 		 1015 aa  87.4  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4761  FAD linked oxidase domain protein  25.45 
 
 		 457 aa  86.3  8e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.19101  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0869  FAD/FMN-containing dehydrogenase  24.82 
 
 		 450 aa  85.9  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17231  FAD/FMN-containing dehydrogenase  24.82 
 
 		 450 aa  85.5  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1380  FAD linked oxidase domain protein  29.02 
 
 		 468 aa  84  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.221073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1674  FAD linked oxidase domain protein  31.49 
 
 		 468 aa  83.6  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0159335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1737  hypothetical protein  22.92 
 
 		 1024 aa  82.8  0.000000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.522031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14891  FAD/FMN-containing dehydrogenase  24.83 
 
 		 452 aa  82  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14641  FAD/FMN-containing dehydrogenase  26.56 
 
 		 451 aa  81.3  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1475  FAD linked oxidase-like  23.68 
 
 		 468 aa  80.9  0.00000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0855  hypothetical protein  22.86 
 
 		 449 aa  79.7  0.00000000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17300  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  27.78 
 
 		 454 aa  79.3  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0304649  normal  0.13811 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1268  hypothetical protein  24.88 
 
 		 448 aa  79  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.76462  normal  0.796012 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0727  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.1 
 
 		 989 aa  79.3  0.0000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15021  FAD/FMN-containing dehydrogenase  24.83 
 
 		 450 aa  78.6  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.244066  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1399  FAD/FMN-containing dehydrogenase  25.58 
 
 		 451 aa  78.6  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.150639  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19871  FAD/FMN-containing dehydrogenase  24.53 
 
 		 459 aa  77.8  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0370705 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5135  FAD linked oxidase domain protein  23.52 
 
 		 454 aa  77  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.949399  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0748  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.54 
 
 		 456 aa  76.3  0.0000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3554  hypothetical protein  28.57 
 
 		 468 aa  74.7  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0329887  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1018  glycolate oxidase, subunit GlcD  23.52 
 
 		 470 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3144  FAD linked oxidase domain-containing protein  22.2 
 
 		 463 aa  72.4  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.720764  normal  0.256061 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2178  FAD linked oxidase domain protein  31.09 
 
 		 452 aa  72  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.393978  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1142  FAD linked oxidase-like protein  23.75 
 
 		 1015 aa  72  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00601773  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2037  FAD linked oxidase domain protein  28.41 
 
 		 503 aa  70.5  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.159157  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1210  glycolate oxidase subunit GlcD  28.95 
 
 		 470 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1188  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  28 
 
 		 470 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1386  glycolate oxidase, subunit GlcD  28 
 
 		 470 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1309  glycolate oxidase subunit GlcD  28.95 
 
 		 470 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3996  glycolate oxidase, subunit GlcD  27.56 
 
 		 470 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.52944 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4256  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.12 
 
 		 1005 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1190  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  27.56 
 
 		 470 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3555  glycolate oxidase, subunit GlcD  25 
 
 		 499 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1537  hypothetical protein  23.13 
 
 		 452 aa  69.3  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.90174  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1348  glycolate oxidase, subunit GlcD  27.56 
 
 		 470 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0866  FAD linked oxidase domain protein  36.36 
 
 		 1020 aa  69.3  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0708  FAD linked oxidase domain protein  35.9 
 
 		 460 aa  68.9  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1450  glycolate oxidase, subunit GlcD  27.89 
 
 		 470 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02320  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  32.76 
 
 		 485 aa  68.2  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6956  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.9 
 
 		 1007 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2306  glycolate oxidase subunit GlcD  27.33 
 
 		 499 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3025  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.29 
 
 		 1038 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.473379 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1212  glycolate oxidase, subunit GlcD  28.42 
 
 		 470 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.225801  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1410  glycolate oxidase, subunit GlcD  27.11 
 
 		 470 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3331  glycolate oxidase subunit GlcD  24.54 
 
 		 499 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000167182 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0495  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.89 
 
 		 496 aa  67  0.0000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2369  FAD linked oxidase domain protein  25.79 
 
 		 481 aa  67  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0650  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.22 
 
 		 497 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0624  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.22 
 
 		 497 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.864789  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0221  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.97 
 
 		 501 aa  66.2  0.0000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.120176  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3820  FAD linked oxidase-like  30.22 
 
 		 497 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0635309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3296  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.33 
 
 		 473 aa  66.2  0.0000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0160978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2652  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.22 
 
 		 497 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0510945 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3764  FAD linked oxidase domain protein  29.59 
 
 		 1070 aa  66.2  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0200676  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1914  FAD linked oxidase domain protein  25.13 
 
 		 485 aa  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0185125  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5632  D-lactate dehydrogenase  31.9 
 
 		 1007 aa  65.9  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0250  FAD linked oxidase-like  30.22 
 
 		 497 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.579749  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0702  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.22 
 
 		 497 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.138361 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0734  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.22 
 
 		 497 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.651197  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2159  glycolate oxidase subunit GlcD  27.97 
 
 		 499 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251033 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2514  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.89 
 
 		 501 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0858  FAD linked oxidase domain protein  31.9 
 
 		 1052 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2219  glycolate oxidase subunit GlcD  30 
 
 		 499 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.165204  hitchhiker  0.00964982 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5973  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30 
 
 		 500 aa  64.3  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2526  FAD linked oxidase domain protein  27.92 
 
 		 457 aa  64.7  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3330  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  29.01 
 
 		 497 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.510979  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2414  glycolate oxidase, subunit GlcD  29.01 
 
 		 497 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3342  glycolate oxidase, subunit GlcD  29.01 
 
 		 497 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2018  glycolate oxidase subunit GlcD  29.17 
 
 		 499 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.252442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6133  putative D-lactate dehydrogenase (D-lactate ferricytochrome C oxidoreductase)  28.3 
 
 		 473 aa  63.9  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0750595 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3296  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  29.01 
 
 		 497 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0160  FAD linked oxidase domain protein  29.31 
 
 		 483 aa  63.9  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2601  glycolate oxidase, subunit GlcD  29.01 
 
 		 497 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8219  FAD linked oxidase domain protein  28.32 
 
 		 470 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0331  glycolate oxidase, subunit GlcD  29.01 
 
 		 497 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3745  glycolate oxidase subunit GlcD  29.17 
 
 		 499 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.337857  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1501  glycolate oxidase, GlcD subunit  29.17 
 
 		 484 aa  63.9  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0901528  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0173  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.51 
 
 		 485 aa  63.9  0.000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.155859  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3304  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.67 
 
 		 490 aa  63.9  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.563604  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1313  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.17 
 
 		 469 aa  63.9  0.000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.130987  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1291  glycolate oxidase, subunit GlcD  29.01 
 
 		 497 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22220  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  25.96 
 
 		 496 aa  63.5  0.000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.10573  normal  0.191937 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>