175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1948 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1948  hypothetical protein  100 
 
 		 326 aa  682    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.270103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0196  hypothetical protein  80.06 
 
 		 326 aa  560  1e-158  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.157282 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2653  hypothetical protein  78.83 
 
 		 326 aa  555  1e-157  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2628  hypothetical protein  72.39 
 
 		 326 aa  509  1e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0135  hypothetical protein  68.92 
 
 		 325 aa  501  1e-141  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1921  hypothetical protein  70.4 
 
 		 325 aa  501  1e-141  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3680  hypothetical protein  70.4 
 
 		 325 aa  501  1e-141  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0115  hypothetical protein  70.19 
 
 		 325 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4530  hypothetical protein  70.5 
 
 		 325 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0670  hypothetical protein  70.5 
 
 		 325 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2392  hypothetical protein  68.85 
 
 		 325 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.134929  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2299  hypothetical protein  70.81 
 
 		 325 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.187044  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1547  hypothetical protein  69.57 
 
 		 325 aa  490  1e-137  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3087  hypothetical protein  68.85 
 
 		 325 aa  488  1e-137  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1510  hypothetical protein  69.16 
 
 		 325 aa  484  1e-136  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3040  hypothetical protein  69.57 
 
 		 325 aa  487  1e-136  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3447  hypothetical protein  69.57 
 
 		 325 aa  487  1e-136  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2785  hypothetical protein  69.16 
 
 		 325 aa  484  1e-136  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0143634  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2555  hypothetical protein  69.25 
 
 		 325 aa  485  1e-136  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00750734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1511  hypothetical protein  70.22 
 
 		 325 aa  486  1e-136  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2402  hypothetical protein  69.25 
 
 		 325 aa  485  1e-136  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.283143  normal  0.277541 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2814  hypothetical protein  69.88 
 
 		 325 aa  487  1e-136  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3473  hypothetical protein  69.57 
 
 		 325 aa  484  1e-136  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0116  hypothetical protein  68.63 
 
 		 325 aa  481  1e-135  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1241  hypothetical protein  68.94 
 
 		 325 aa  481  1e-135  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1546  hypothetical protein  68.32 
 
 		 326 aa  481  1e-135  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1890  hypothetical protein  70.53 
 
 		 325 aa  484  1e-135  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4547  hypothetical protein  68.63 
 
 		 325 aa  482  1e-135  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1610  hypothetical protein  68.97 
 
 		 325 aa  482  1e-135  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3084  hypothetical protein  68.22 
 
 		 325 aa  480  1e-134  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3323  hypothetical protein  68.42 
 
 		 325 aa  480  1e-134  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1264  hypothetical protein  69.16 
 
 		 325 aa  480  1e-134  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0957  hypothetical protein  69.16 
 
 		 325 aa  480  1e-134  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00250015  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1812  hypothetical protein  70.87 
 
 		 316 aa  471  1e-132  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3681  hypothetical protein  67.5 
 
 		 323 aa  472  1e-132  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4465  hypothetical protein  66.46 
 
 		 325 aa  473  1e-132  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1378  hypothetical protein  66.77 
 
 		 325 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000599998 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2622  hypothetical protein  69.58 
 
 		 319 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0144606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0606  hypothetical protein  68.22 
 
 		 325 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1861  hypothetical protein  67.79 
 
 		 329 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.633128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3627  hypothetical protein  66.46 
 
 		 325 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.92162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2307  hypothetical protein  65.94 
 
 		 326 aa  466  9.999999999999999e-131  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3091  hypothetical protein  66.25 
 
 		 326 aa  466  9.999999999999999e-131  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0496594 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2533  hypothetical protein  68.73 
 
 		 326 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0991372  normal  0.0595118 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4299  hypothetical protein  66.14 
 
 		 325 aa  463  1e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2958  hypothetical protein  65.53 
 
 		 325 aa  462  1e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0052  hypothetical protein  65.94 
 
 		 326 aa  464  1e-129  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.186799 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4749  hypothetical protein  65.2 
 
 		 325 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.291957  hitchhiker  0.000564584 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3773  hypothetical protein  65.52 
 
 		 325 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.149988  hitchhiker  0.00126811 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2922  hypothetical protein  64.31 
 
 		 325 aa  456  1e-127  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0200  hypothetical protein  71.72 
 
 		 293 aa  449  1e-125  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2414  hypothetical protein  68 
 
 		 326 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.196776  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3356  hypothetical protein  54.4 
 
 		 323 aa  374  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.526564  normal  0.864241 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1385  hypothetical protein  54.94 
 
 		 327 aa  372  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.868466  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1948  hypothetical protein  54.43 
 
 		 327 aa  374  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.557873  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1848  hypothetical protein  54.74 
 
 		 327 aa  371  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4132  hypothetical protein  53.52 
 
 		 327 aa  369  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0907  hypothetical protein  54.32 
 
 		 327 aa  365  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0248219  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1735  hypothetical protein  53.52 
 
 		 327 aa  365  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3465  hypothetical protein  53.4 
 
 		 325 aa  356  2.9999999999999997e-97  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0641119 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2393  hypothetical protein  73.78 
 
 		 238 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0597783  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0111  hypothetical protein  57.24 
 
 		 325 aa  352  4e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3074  CheW protein  53.11 
 
 		 325 aa  350  1e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.464984  normal  0.367409 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0333  Type I secretion outer membrane protein, TolC  52.83 
 
 		 325 aa  349  3e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0672756 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0282  hypothetical protein  52.22 
 
 		 325 aa  338  8e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.822944  hitchhiker  0.00000243422 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0281  hypothetical protein  52.22 
 
 		 325 aa  335  5e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015206 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1111  hypothetical protein  49.24 
 
 		 327 aa  334  1e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0480419  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0607  hypothetical protein  51.58 
 
 		 325 aa  331  1e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2943  histidine kinase  52.22 
 
 		 325 aa  331  1e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3017  hypothetical protein  50.16 
 
 		 325 aa  330  2e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0296678 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1856  hypothetical protein  45.71 
 
 		 370 aa  310  2e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1436  protein of unknown function DUF1568  48.48 
 
 		 341 aa  301  1e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2679  hypothetical protein  45.95 
 
 		 336 aa  298  1e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0118762  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3659  hypothetical protein  46.61 
 
 		 347 aa  293  3e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0856  hypothetical protein  45.13 
 
 		 347 aa  290  2e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02418  hypothetical protein  44.62 
 
 		 328 aa  290  2e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2906  hypothetical protein  45.87 
 
 		 329 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.881072 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2780  hypothetical protein  50.69 
 
 		 336 aa  285  8e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000960474  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3041  hypothetical protein  72.22 
 
 		 198 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3446  hypothetical protein  72.22 
 
 		 198 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2840  protein of unknown function DUF1568  44.78 
 
 		 345 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0644633 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01831  hypothetical protein  52.11 
 
 		 271 aa  282  5.000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1700  protein of unknown function DUF1568  43.71 
 
 		 377 aa  281  1e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0414346 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2933  hypothetical protein  44.51 
 
 		 345 aa  280  2e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.161086  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1697  hypothetical protein  44.05 
 
 		 349 aa  278  8e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0910  hypothetical protein  44.89 
 
 		 344 aa  278  1e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1178  hypothetical protein  44.58 
 
 		 344 aa  277  2e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0303591  normal  0.0825627 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0868  hypothetical protein  44.17 
 
 		 344 aa  277  2e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2414  hypothetical protein  45.03 
 
 		 341 aa  276  4e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.301389  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1945  protein of unknown function DUF1568  45.03 
 
 		 341 aa  275  6e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.499337 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3200  hypothetical protein  44 
 
 		 344 aa  275  6e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.789239 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3682  hypothetical protein  69.78 
 
 		 198 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1226  protein of unknown function DUF1568  43.2 
 
 		 341 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.353731  hitchhiker  0.000000017845 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1126  hypothetical protein  44.27 
 
 		 344 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.776641  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2480  hypothetical protein  43.65 
 
 		 344 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02306  hypothetical protein  44.14 
 
 		 324 aa  273  4.0000000000000004e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.334783  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2403  hypothetical protein  44.55 
 
 		 341 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.284659  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0562  hypothetical protein  44.05 
 
 		 370 aa  270  2e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0862774 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2838  hypothetical protein  66.31 
 
 		 186 aa  268  7e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.579373  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0499  hypothetical protein  71.18 
 
 		 186 aa  264  1e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>