More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1701 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1701  hypothetical protein  100 
 
 		 302 aa  623  1e-177  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000328328  normal  0.027964 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2890  hypothetical protein  80.33 
 
 		 302 aa  513  1e-144  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0038147  hitchhiker  0.00000713173 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1666  hypothetical protein  75.67 
 
 		 303 aa  480  1e-134  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000201275  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1545  hypothetical protein  68.11 
 
 		 303 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000013291  normal  0.113881 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1486  hypothetical protein  68.44 
 
 		 303 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000118993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1551  hypothetical protein  67.44 
 
 		 303 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0147626  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2919  hypothetical protein  68.11 
 
 		 303 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2680  hypothetical protein  66.89 
 
 		 305 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00757466  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2701  hypothetical protein  67.22 
 
 		 305 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000560458  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1686  hypothetical protein  66.89 
 
 		 305 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000452263  normal  0.0252505 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2556  hypothetical protein  67.88 
 
 		 302 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2777  hypothetical protein  66.56 
 
 		 305 aa  437  1e-121  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00142049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2385  hypothetical protein  66.78 
 
 		 304 aa  431  1e-120  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000477017  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2397  hypothetical protein  68.67 
 
 		 305 aa  419  1e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00356323  normal  0.487755 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2359  hypothetical protein  71.03 
 
 		 305 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1491  hypothetical protein  61.33 
 
 		 308 aa  397  1e-109  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000879827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3357  hypothetical protein  55.19 
 
 		 319 aa  358  8e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0416158  normal  0.98402 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1661  hypothetical protein  53.67 
 
 		 319 aa  355  5e-97  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519453  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2094  hypothetical protein  53.67 
 
 		 319 aa  353  2e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.120571 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2468  hypothetical protein  53.07 
 
 		 310 aa  347  1e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.219028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46250  hypothetical protein  47.78 
 
 		 313 aa  268  1e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0321722  normal  0.0483373 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3932  hypothetical protein  47.93 
 
 		 313 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225792  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1918  hypothetical protein  46.88 
 
 		 318 aa  265  1e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.453837  normal  0.204639 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2527  hypothetical protein  44.12 
 
 		 320 aa  264  2e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.166496  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2337  hypothetical protein  44.95 
 
 		 320 aa  263  2e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.166557  normal  0.623791 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3530  hypothetical protein  46.92 
 
 		 313 aa  263  2e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.524505  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003801  methyltransferase  45.52 
 
 		 310 aa  264  2e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02689  methyltransferase  45.52 
 
 		 310 aa  262  6e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3313  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  42.86 
 
 		 314 aa  256  4e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3872  hypothetical protein  45.52 
 
 		 308 aa  255  5e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1143  hypothetical protein  44.33 
 
 		 321 aa  254  8e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1561  hypothetical protein  44.14 
 
 		 318 aa  248  6e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.207063  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4306  hypothetical protein  44.14 
 
 		 318 aa  248  8e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3577  SAM-dependent methyltransferase-like protein  43.45 
 
 		 308 aa  246  4e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.586441 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3633  hypothetical protein  43.55 
 
 		 321 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4405  hypothetical protein  41.26 
 
 		 299 aa  233  2.0000000000000002e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.134753  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1214  hypothetical protein  43.71 
 
 		 309 aa  227  2e-58  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1161  hypothetical protein  41.2 
 
 		 320 aa  205  7e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2881  SAM-dependent methyltransferases  40.15 
 
 		 305 aa  203  3e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000986982  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3286  hypothetical protein  32.39 
 
 		 335 aa  124  3e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3598  hypothetical protein  30.98 
 
 		 338 aa  120  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4481  hypothetical protein  34.94 
 
 		 338 aa  120  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1873  hypothetical protein  35.06 
 
 		 335 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2451  hypothetical protein  31.86 
 
 		 380 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4172  hypothetical protein  30.67 
 
 		 338 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2105  hypothetical protein  34.32 
 
 		 335 aa  116  6e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4815  hypothetical protein  32.51 
 
 		 338 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.195224  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3324  hypothetical protein  31.23 
 
 		 353 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1912  hypothetical protein  31.11 
 
 		 321 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0070  hypothetical protein  31.56 
 
 		 338 aa  113  3e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2332  hypothetical protein  30.41 
 
 		 335 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.946528  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2014  hypothetical protein  30.41 
 
 		 335 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00622676 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2332  hypothetical protein  30.41 
 
 		 335 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.97863  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2449  hypothetical protein  30.41 
 
 		 335 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.861715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0704  hypothetical protein  33.58 
 
 		 363 aa  109  6e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320832 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1380  hypothetical protein  29.57 
 
 		 385 aa  108  9.000000000000001e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0930599  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3633  hypothetical protein  30.56 
 
 		 350 aa  108  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3595  hypothetical protein  28.75 
 
 		 335 aa  108  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.222828  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4260  hypothetical protein  28.89 
 
 		 335 aa  105  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00951955 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1662  putative oxidoreductase  33.71 
 
 		 392 aa  102  7e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000338862  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1771  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  35.68 
 
 		 807 aa  102  1e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3492  pseudouridine synthase  29.85 
 
 		 560 aa  101  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3930  protein of unknown function Met10  34.02 
 
 		 479 aa  101  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1141  hypothetical protein  31.48 
 
 		 390 aa  100  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.432078  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1163  hypothetical protein  31.48 
 
 		 390 aa  100  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.809319  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02010  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.42 
 
 		 699 aa  100  4e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.347097  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3083  PUA domain-containing protein  37.01 
 
 		 404 aa  99.8  5e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0506746 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0772  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  39.07 
 
 		 776 aa  99.4  6e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.829763 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0259  SAM-dependent methyltransferase  29.43 
 
 		 389 aa  99.8  6e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.966549  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0766  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  39.07 
 
 		 768 aa  99  8e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.1454 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0667  hypothetical protein  32.08 
 
 		 390 aa  99  9e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0073  PUA domain-containing protein  39.55 
 
 		 400 aa  97.1  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.891321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3698  PUA domain containing protein  36.49 
 
 		 400 aa  95.9  7e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3375  PUA domain containing protein  36.49 
 
 		 397 aa  95.9  8e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3105  PUA domain-containing protein  34.59 
 
 		 404 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.281212 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1462  hypothetical protein  36.13 
 
 		 318 aa  94.4  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.685404  normal  0.241812 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2474  PUA domain-containing protein  34.59 
 
 		 404 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78499  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3088  PUA domain-containing protein  34.59 
 
 		 404 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6438  SAM-dependent methyltransferase  33.33 
 
 		 404 aa  94  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0223  SAM-dependent methyltransferase  36.6 
 
 		 397 aa  93.6  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1540  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  34.87 
 
 		 713 aa  93.6  4e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1607  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  34.87 
 
 		 713 aa  93.6  4e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00710463  normal  0.246745 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0346  PUA domain containing protein  35.81 
 
 		 400 aa  93.6  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.734176 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1479  SAM-dependent methyltransferase  34.46 
 
 		 396 aa  93.2  5e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.41969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2997  PUA domain-containing protein  34.59 
 
 		 404 aa  92.8  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0717099 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3134  PUA domain-containing protein  34.59 
 
 		 404 aa  92.8  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.312464  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1132  hypothetical protein  32.62 
 
 		 396 aa  92.8  7e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.250632 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1082  hypothetical protein  32.62 
 
 		 396 aa  92.8  7e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000305834  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2348  hypothetical protein  32.62 
 
 		 396 aa  92.4  7e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.287324  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0968  methyltransferase small  31.93 
 
 		 392 aa  92.4  8e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1491  putative RNA methylase  31.12 
 
 		 408 aa  92.4  8e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.286756 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0194  hypothetical protein  33.73 
 
 		 422 aa  92  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4665  hypothetical protein  31 
 
 		 399 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0528  methyltransferase  30.67 
 
 		 398 aa  92  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000817153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0390  SAM-dependent methyltransferase  33.73 
 
 		 425 aa  91.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0169  hypothetical protein  34.42 
 
 		 423 aa  91.7  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.397284  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0051  hypothetical protein  35.14 
 
 		 397 aa  91.3  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3257  hypothetical protein  34.42 
 
 		 425 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2170  hypothetical protein  34.42 
 
 		 425 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.64943  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2376  SAM-dependent methyltransferase  30.53 
 
 		 400 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>