More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8798 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_8798  Signal transduction histidine kinase-like protein  100 
 
 
419 aa  804    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.40221  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4416  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  58.33 
 
 
386 aa  410  1e-113  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.495846  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2232  putative two-component sensor kinase  57.55 
 
 
375 aa  398  1e-109  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0396  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.32 
 
 
424 aa  317  3e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1602  histidine kinase  48.97 
 
 
425 aa  309  8e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0369038 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2468  histidine kinase  45.94 
 
 
393 aa  276  7e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000420477  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2269  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  42.79 
 
 
446 aa  267  2e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00214967  normal  0.0837693 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1124  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.86 
 
 
422 aa  238  1e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.146653 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5657  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.1 
 
 
435 aa  220  3e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.613873  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1319  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  39.46 
 
 
384 aa  217  4e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2690  histidine kinase  39.15 
 
 
445 aa  214  1.9999999999999998e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.23221  normal  0.172281 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2025  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.36 
 
 
394 aa  212  9e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.720757  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2731  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  38.22 
 
 
367 aa  201  1.9999999999999998e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.810003  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4262  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.19 
 
 
469 aa  196  5.000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1985  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  37.37 
 
 
389 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4218  Signal transduction histidine kinase-like protein  46.89 
 
 
398 aa  190  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0481493  hitchhiker  0.000385051 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.2 
 
 
401 aa  187  3e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274941  normal  0.123085 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0823  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.63 
 
 
417 aa  187  4e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3315  histidine kinase  38.38 
 
 
393 aa  183  5.0000000000000004e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0173887  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5069  histidine kinase  35.99 
 
 
403 aa  177  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.101973  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0821  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.39 
 
 
418 aa  177  3e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17160  signal transduction histidine kinase  38.36 
 
 
449 aa  176  5e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.273662  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26890  signal transduction histidine kinase  34.9 
 
 
430 aa  169  6e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.304615  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4673  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.32 
 
 
399 aa  166  8e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.113165  normal  0.377169 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0760  histidine kinase  37.28 
 
 
461 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.29757  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.39 
 
 
424 aa  163  5.0000000000000005e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57519  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25050  signal transduction histidine kinase  37.71 
 
 
360 aa  156  8e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.193402  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1846  Signal transduction histidine kinase  42.96 
 
 
416 aa  147  3e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.280693  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2513  histidine kinase  32.05 
 
 
424 aa  146  5e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0276657  normal  0.73288 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2846  histidine kinase  36.83 
 
 
369 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000726126  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6162  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.78 
 
 
415 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611098  decreased coverage  0.000124452 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06240  histidine kinase  40.24 
 
 
438 aa  139  7.999999999999999e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7657  histidine kinase  42.86 
 
 
434 aa  139  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2490  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.6 
 
 
383 aa  137  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.562249  normal  0.736306 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1961  histidine kinase  40.14 
 
 
420 aa  134  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7210  Signal transduction histidine kinase-like protein  40.68 
 
 
379 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0177  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  36.75 
 
 
386 aa  130  5.0000000000000004e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0295  histidine kinase  41.07 
 
 
389 aa  130  5.0000000000000004e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.856795  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
536 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2107  histidine kinase  33.95 
 
 
401 aa  125  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.51786 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3715  histidine kinase  37.17 
 
 
374 aa  124  4e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.124427 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8899  histidine kinase  37.05 
 
 
455 aa  121  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2671  histidine kinase  33.59 
 
 
375 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5894  histidine kinase  38.05 
 
 
555 aa  121  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5904  Histidine kinase  32.72 
 
 
399 aa  119  7e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0106883  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7101  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.59 
 
 
496 aa  119  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1884  histidine kinase  36.34 
 
 
383 aa  119  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0784201 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2009  histidine kinase  43.85 
 
 
395 aa  118  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0367  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.39 
 
 
413 aa  117  5e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0318683  normal  0.223079 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3054  histidine kinase  34.9 
 
 
388 aa  117  5e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131437  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08500  signal transduction histidine kinase  29.97 
 
 
420 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115699  normal  0.612619 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5720  histidine kinase  35.76 
 
 
439 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3323  histidine kinase  32.71 
 
 
371 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0430816  normal  0.248964 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5192  histidine kinase  32.97 
 
 
445 aa  110  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.532416  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25610  histidine kinase  31.26 
 
 
458 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.309786 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2413  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.52 
 
 
373 aa  110  4.0000000000000004e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.8 
 
 
405 aa  110  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1634  histidine kinase  33.68 
 
 
384 aa  110  5e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.262727  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3670  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.18 
 
 
371 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2303  histidine kinase  31.38 
 
 
405 aa  107  5e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0024754  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2821  histidine kinase  35.11 
 
 
423 aa  106  7e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0543421  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  31.39 
 
 
381 aa  106  9e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3749  histidine kinase  31.58 
 
 
393 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4183  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  32.19 
 
 
407 aa  104  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.374339 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7160  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.92 
 
 
406 aa  104  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.374119  normal  0.0738774 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5401  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.16 
 
 
439 aa  104  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1510  histidine kinase  31.45 
 
 
378 aa  103  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0382398 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2532  Signal transduction histidine kinase-like protein  30.24 
 
 
400 aa  103  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.76647 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0309  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.5 
 
 
400 aa  103  8e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.13648 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3239  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  38.46 
 
 
422 aa  103  8e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.771417  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7302  putative two-component system sensor kinase  31.58 
 
 
417 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0277  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.66 
 
 
426 aa  102  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00110389 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2252  histidine kinase  35.34 
 
 
386 aa  101  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.352944 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4895  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  29.21 
 
 
378 aa  102  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.235337 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0200  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.88 
 
 
424 aa  102  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7008  histidine kinase  33.92 
 
 
402 aa  102  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3890  histidine kinase  32.99 
 
 
428 aa  102  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11590  signal transduction histidine kinase  33.79 
 
 
612 aa  101  3e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0338093  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3245  Signal transduction histidine kinase-like protein  30.65 
 
 
430 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000678537  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4478  histidine kinase  29.56 
 
 
400 aa  100  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.334166 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7842  histidine kinase  29.74 
 
 
402 aa  100  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.209529 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3997  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.43 
 
 
567 aa  99.8  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.224789  normal  0.328912 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26850  signal transduction histidine kinase  29.69 
 
 
441 aa  99.8  9e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4996  histidine kinase  40.49 
 
 
405 aa  99.8  9e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1603  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  29.57 
 
 
470 aa  99.4  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1952  histidine kinase  30.59 
 
 
442 aa  99.4  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.107161 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20450  signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 
441 aa  99  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0107895  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23670  signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 
404 aa  98.6  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0522  histidine kinase  31.25 
 
 
399 aa  98.6  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02410  signal transduction histidine kinase  32.18 
 
 
428 aa  98.6  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0682  histidine kinase  30.75 
 
 
433 aa  98.6  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.29384  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6212  putative two-component system sensor kinase  34.51 
 
 
408 aa  97.8  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.404432 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0111  histidine kinase  35.5 
 
 
372 aa  97.4  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0623  histidine kinase  35.27 
 
 
403 aa  97.1  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2269  histidine kinase  30.74 
 
 
397 aa  97.1  6e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000019217 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1739  histidine kinase  31.2 
 
 
392 aa  96.7  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4946  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.1 
 
 
793 aa  96.3  8e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.137067  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6236  histidine kinase  45.81 
 
 
387 aa  96.3  9e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.39934  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2232  histidine kinase  34.93 
 
 
399 aa  95.9  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000209414  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3640  histidine kinase  33.88 
 
 
380 aa  96.3  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>