More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7726 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7726  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 261 aa  519  1e-146  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  43.32 
 
 		 268 aa  190  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  37.85 
 
 		 256 aa  180  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  42 
 
 		 259 aa  180  2e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  39.44 
 
 		 261 aa  171  9e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 262 aa  160  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 272 aa  160  3e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  37.25 
 
 		 277 aa  158  9e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1885  IclR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 249 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.216873 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0127  transcriptional regulator, IclR family  41.92 
 
 		 544 aa  154  2e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  32.55 
 
 		 257 aa  152  7e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  36.9 
 
 		 255 aa  151  8e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 275 aa  151  8.999999999999999e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0612  transcriptional regulator IclR  35.83 
 
 		 255 aa  149  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000145018 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 276 aa  148  8e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 261 aa  148  9e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  37.35 
 
 		 257 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  36.82 
 
 		 254 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 284 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2008  transcriptional regulator IclR  33.46 
 
 		 260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 246 aa  147  3e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  33.33 
 
 		 246 aa  147  3e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0668  transcriptional regulator, IclR family  33.46 
 
 		 257 aa  145  8.000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000062061  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  39.84 
 
 		 256 aa  144  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 267 aa  144  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 254 aa  144  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4307  transcriptional regulator IclR  35.34 
 
 		 273 aa  143  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0456166 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  36.84 
 
 		 265 aa  143  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  32.79 
 
 		 252 aa  143  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 260 aa  142  7e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 267 aa  142  8e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 260 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  34.43 
 
 		 260 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  34.84 
 
 		 260 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  34.84 
 
 		 260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4491  transcriptional repressor IclR  35.55 
 
 		 276 aa  140  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.880691  normal  0.328338 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  35.86 
 
 		 275 aa  140  3e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0532  transcriptional regulator, IclR family  39.08 
 
 		 253 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3109  IclR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 257 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2240  regulatory protein, IclR  38.19 
 
 		 262 aa  136  3.0000000000000003e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  33.2 
 
 		 295 aa  136  4e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4675  transcriptional regulator, IclR family  42.19 
 
 		 272 aa  135  5e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.236119  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0645  transcriptional regulator, IclR family  36.43 
 
 		 259 aa  134  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0367  transcriptional repressor IclR  34.39 
 
 		 280 aa  135  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.504781  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3924  transcriptional repressor IclR  34.39 
 
 		 280 aa  135  9.999999999999999e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0297  transcriptional repressor IclR  34.39 
 
 		 280 aa  135  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0438568  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4893  transcriptional regulator, IclR family  39.17 
 
 		 262 aa  134  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3546  regulatory protein, IclR  36.12 
 
 		 265 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000366663  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 273 aa  134  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3776  transcriptional repressor IclR  33.59 
 
 		 276 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3031  regulatory protein, IclR  34.39 
 
 		 276 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03890  DNA-binding transcriptional repressor  33.08 
 
 		 274 aa  133  3e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3979  transcriptional regulator, IclR family  33.08 
 
 		 274 aa  133  3e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4012  transcriptional repressor IclR  33.08 
 
 		 274 aa  133  3e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.992009  normal  0.0359052 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4471  transcriptional repressor IclR  33.08 
 
 		 274 aa  133  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.215784  normal  0.0860899 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03850  hypothetical protein  33.08 
 
 		 274 aa  133  3e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4254  transcriptional repressor IclR  33.08 
 
 		 274 aa  133  3e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.084393  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5488  transcriptional repressor IclR  33.08 
 
 		 274 aa  133  3e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4562  transcriptional repressor IclR  33.08 
 
 		 274 aa  133  3e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0223  Transcriptional regulator IclR  38.4 
 
 		 246 aa  133  3.9999999999999996e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093608  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  33.47 
 
 		 252 aa  132  5e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 260 aa  132  5e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0202  regulatory proteins, IclR  34.38 
 
 		 276 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  31.98 
 
 		 260 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  33.2 
 
 		 252 aa  131  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0368  transcriptional repressor IclR  33.59 
 
 		 277 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4524  transcriptional repressor IclR  32.69 
 
 		 274 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4521  transcriptional repressor IclR  32.69 
 
 		 274 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.693212  normal  0.182303 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4434  transcriptional repressor IclR  32.69 
 
 		 274 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4399  transcriptional repressor IclR  32.69 
 
 		 274 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241135  normal  0.788445 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4597  transcriptional repressor IclR  32.69 
 
 		 274 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 260 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0116  IclR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 550 aa  128  9.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00456  DNA-binding transcriptional repressor  30.89 
 
 		 271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.832726  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  31.47 
 
 		 253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3106  transcriptional regulator, IclR family  30.89 
 
 		 271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3952  transcriptional repressor IclR  33.47 
 
 		 277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.398782  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0580  DNA-binding transcriptional repressor AllR  30.89 
 
 		 271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  35.22 
 
 		 280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1550  IclR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0453  transcriptional repressor IclR  33.46 
 
 		 277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0122119  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0543  DNA-binding transcriptional repressor AllR  30.89 
 
 		 271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00461  hypothetical protein  30.89 
 
 		 271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3116  DNA-binding transcriptional repressor AllR  30.89 
 
 		 271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.129581 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  30.24 
 
 		 263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0549  DNA-binding transcriptional repressor AllR  31.17 
 
 		 256 aa  127  3e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0607  DNA-binding transcriptional repressor AllR  31.17 
 
 		 256 aa  127  3e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3802  transcriptional regulator, IclR family  37.72 
 
 		 264 aa  126  4.0000000000000003e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.434289  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0370  IclR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 265 aa  125  5e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.470614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6599  putative transcriptional regulator, IclR family  36.68 
 
 		 273 aa  125  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0547312  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0211  transcriptional regulator IclR  32.33 
 
 		 262 aa  125  6e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  37.25 
 
 		 248 aa  125  6e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5478  transcriptional regulator, IclR family  41.63 
 
 		 249 aa  125  6e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0440  DNA-binding transcriptional repressor AllR  30.5 
 
 		 271 aa  125  7e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0717823  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 261 aa  124  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3928  IclR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 272 aa  124  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1249  transcriptional regulator  33.75 
 
 		 271 aa  125  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.568713  normal  0.308528 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01798  predicted DNA-binding transcriptional regulator  29.44 
 
 		 263 aa  124  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.440803  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01786  hypothetical protein  29.44 
 
 		 263 aa  124  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0221  transcriptional repressor IclR  32.03 
 
 		 275 aa  124  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0850662 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>