More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7626 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7626  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 455 aa  883    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452611  normal  0.196485 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1612  amino acid permease-associated region  74.77 
 
 		 452 aa  647    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000949107  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2434  amino acid transporter  59.42 
 
 		 446 aa  511  1e-144  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0159957 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23590  amino acid transporter  56.85 
 
 		 454 aa  451  1e-125  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.160802 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4923  amino acid permease-associated region  59.24 
 
 		 475 aa  448  1e-125  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.441557  normal  0.182333 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0522  amino acid permease-associated region  56.63 
 
 		 472 aa  427  1e-118  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2340  amino acid permease-associated region  58.58 
 
 		 506 aa  424  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1097  amino acid permease-associated region  57.27 
 
 		 446 aa  411  1e-113  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.253911  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16590  amino acid transporter  54.5 
 
 		 461 aa  402  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5386  amino acid permease-associated region  51.82 
 
 		 483 aa  392  1e-108  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4568  amino acid permease-associated region  53.85 
 
 		 470 aa  378  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4951  amino acid permease-associated region  53.62 
 
 		 470 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0545959  normal  0.179686 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4656  amino acid permease-associated region  53.85 
 
 		 470 aa  378  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.465533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4427  amino acid permease-associated region  52.04 
 
 		 452 aa  375  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.181856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0009  amino acid permease-associated region  51.95 
 
 		 474 aa  374  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3914  amino acid permease-associated region  47.67 
 
 		 472 aa  368  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728641  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3301  amino acid permease-associated region  48.51 
 
 		 483 aa  367  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.475008  hitchhiker  0.00374937 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1611  amino acid permease-associated region  50.44 
 
 		 479 aa  365  1e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0240  amino acid permease-associated region  53.3 
 
 		 439 aa  358  1.9999999999999998e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00159585 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2793  amino acid permease-associated region  45.77 
 
 		 438 aa  355  6.999999999999999e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15980  amino acid transporter  48.19 
 
 		 461 aa  350  3e-95  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.133211  normal  0.0674026 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4334  amino acid permease-associated region  48.82 
 
 		 487 aa  348  1e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.313346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30460  amino acid transporter  48.33 
 
 		 482 aa  346  5e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05480  amino acid transporter  51.84 
 
 		 454 aa  342  5.999999999999999e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3324  amino acid permease-associated region  48.89 
 
 		 451 aa  342  7e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0993  amino acid permease-associated region  48.26 
 
 		 473 aa  337  1.9999999999999998e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.171512  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3097  amino acid permease-associated region  44.92 
 
 		 502 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5147  amino acid permease-associated region  51.43 
 
 		 478 aa  338  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2379  amino acid permease-associated region  46.35 
 
 		 437 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0365952 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0059  amino acid permease-associated region  45.49 
 
 		 493 aa  332  1e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.32682  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5562  amino acid permease-associated region  47.88 
 
 		 451 aa  322  7e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5181  amino acid permease-associated region  46.82 
 
 		 451 aa  322  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215843  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5270  amino acid permease-associated region  46.82 
 
 		 451 aa  322  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31800  amino acid transporter  49.24 
 
 		 433 aa  310  4e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.68054  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0084  amino acid permease-associated region  48.07 
 
 		 449 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.687355  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  32.73 
 
 		 439 aa  221  3e-56  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1710  amino acid permease-associated region  37.31 
 
 		 418 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000301061  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0357  hypothetical protein  39.69 
 
 		 394 aa  208  1e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0333  hypothetical protein  39.06 
 
 		 394 aa  201  1.9999999999999998e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  36.58 
 
 		 436 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1779  hypothetical protein  36.97 
 
 		 412 aa  195  1e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2178  amino acid transporter  32.08 
 
 		 422 aa  182  1e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0107099  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0624  hypothetical protein  33.06 
 
 		 411 aa  171  3e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3419  putative amino acid permease  35.04 
 
 		 425 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0356803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3650  putative amino acid permease  34.24 
 
 		 413 aa  163  7e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.171718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  27.27 
 
 		 500 aa  142  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  31.39 
 
 		 494 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0053  amino acid permease-associated region  34.07 
 
 		 445 aa  140  6e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  27.18 
 
 		 489 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2857  amino acid permease-associated region  29.18 
 
 		 504 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.660626  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  27.1 
 
 		 495 aa  133  6e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0345  amino acid permease-associated region  27.96 
 
 		 468 aa  133  6.999999999999999e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  28.73 
 
 		 476 aa  133  7.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4919  amino acid permease-associated region  25.43 
 
 		 496 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4455  amino acid permease-associated region  25.43 
 
 		 496 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.689859 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2221  amino acid permease-associated region  29.45 
 
 		 495 aa  131  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300523  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3053  amino acid permease-associated region  28.85 
 
 		 466 aa  128  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  26.02 
 
 		 486 aa  127  4.0000000000000003e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  28.38 
 
 		 468 aa  127  5e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  28.38 
 
 		 468 aa  127  5e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  28.38 
 
 		 468 aa  127  5e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4969  amino acid permease-associated region  26.52 
 
 		 496 aa  126  8.000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0260765 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  26.83 
 
 		 471 aa  125  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  27.73 
 
 		 471 aa  125  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  27.94 
 
 		 466 aa  125  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  25.87 
 
 		 483 aa  124  2e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  27.94 
 
 		 466 aa  125  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  26.89 
 
 		 471 aa  124  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  26.89 
 
 		 471 aa  124  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  26.89 
 
 		 471 aa  124  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  26.62 
 
 		 471 aa  124  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  26.89 
 
 		 471 aa  124  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  26.89 
 
 		 471 aa  124  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  29.05 
 
 		 467 aa  124  4e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  28.63 
 
 		 467 aa  124  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2114  amino acid permease-associated region  28.74 
 
 		 485 aa  124  4e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.590902  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  27.43 
 
 		 471 aa  124  4e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  28.54 
 
 		 467 aa  123  5e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  28.63 
 
 		 467 aa  124  5e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  28.54 
 
 		 467 aa  123  5e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  28.42 
 
 		 467 aa  123  6e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  27.49 
 
 		 468 aa  123  6e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  27.85 
 
 		 476 aa  123  6e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4174  amino acid permease-associated region  27.52 
 
 		 478 aa  123  7e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.427253  normal  0.28467 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  28.75 
 
 		 467 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1609  amino acid permease-associated region  28.12 
 
 		 495 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1341  amino acid permease-associated region  26.05 
 
 		 496 aa  122  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  27.69 
 
 		 486 aa  121  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1785  amino acid permease-associated region  29.48 
 
 		 491 aa  122  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3581  amino acid transport protein  27.71 
 
 		 480 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0683236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06077  cationic amino acid transporter  27.35 
 
 		 486 aa  121  3e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00275694  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00850  cationic amino acid transporter  27.35 
 
 		 486 aa  121  3e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000549978  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0923  amino acid permease  28.63 
 
 		 495 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  26.53 
 
 		 471 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1603  amino acid permease-associated region  26.43 
 
 		 494 aa  120  6e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0963262  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  27.81 
 
 		 506 aa  120  7e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0272  amino acid permease-associated region  28.9 
 
 		 478 aa  119  7.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.656438  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21440  amino acid transporter  26.75 
 
 		 512 aa  119  9e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.250254 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  27.37 
 
 		 518 aa  119  9e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1758  amino acid permease-associated region  26.94 
 
 		 495 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120604  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>