221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7042 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_7042  protein of unknown function UPF0047  100 
 
 
135 aa  274  3e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2358  hypothetical protein  77.04 
 
 
135 aa  223  5.0000000000000005e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0335235  normal  0.0190831 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1646  protein of unknown function UPF0047  76.87 
 
 
135 aa  206  6e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0314568  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1966  hypothetical protein  70.9 
 
 
142 aa  206  9e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387815  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22490  conserved hypothetical protein TIGR00149  67.91 
 
 
155 aa  189  8e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.282378  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2945  protein of unknown function UPF0047  73.13 
 
 
135 aa  181  3e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.142491  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3395  hypothetical protein  62.69 
 
 
140 aa  180  5.0000000000000004e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.465123 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3612  hypothetical protein  65.41 
 
 
134 aa  176  8e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000432475 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1363  protein of unknown function UPF0047  64.18 
 
 
134 aa  171  2.9999999999999996e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3372  hypothetical protein  63.91 
 
 
151 aa  171  2.9999999999999996e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5843  protein of unknown function UPF0047  64.93 
 
 
135 aa  164  4e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.228828  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2870  hypothetical protein  73.68 
 
 
133 aa  164  4e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.142366  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3056  hypothetical protein  67.91 
 
 
134 aa  157  6e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10190  conserved hypothetical protein TIGR00149  64.44 
 
 
136 aa  153  9e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.698161 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1861  hypothetical protein  71.88 
 
 
129 aa  152  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0103013 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2345  hypothetical protein  61.48 
 
 
133 aa  152  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.202939  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2392  hypothetical protein  61.48 
 
 
133 aa  152  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2386  hypothetical protein  61.48 
 
 
133 aa  152  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3764  hypothetical protein  58.09 
 
 
136 aa  153  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.434678 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1034  hypothetical protein  58.21 
 
 
133 aa  147  4e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0183321 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2639  hypothetical protein  58.73 
 
 
129 aa  145  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12577  hypothetical protein  56.8 
 
 
129 aa  141  2e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0908128 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0880  protein of unknown function UPF0047  48.12 
 
 
136 aa  135  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0539  protein of unknown function UPF0047  49.63 
 
 
157 aa  130  6e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.503059  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1415  hypothetical protein  38.81 
 
 
137 aa  77.4  0.00000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1527  protein of unknown function UPF0047  35.07 
 
 
138 aa  75.5  0.0000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1631  hypothetical protein  38.35 
 
 
138 aa  74.7  0.0000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.482236  normal  0.0285677 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3771  protein of unknown function UPF0047  34.62 
 
 
134 aa  72.8  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1649  hypothetical protein  36.36 
 
 
161 aa  72.4  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.64557  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1711  hypothetical protein  39.1 
 
 
161 aa  70.1  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2637  protein of unknown function UPF0047  32.09 
 
 
131 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00164321  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3540  protein of unknown function UPF0047  32.82 
 
 
138 aa  68.2  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0349  protein of unknown function UPF0047  31.85 
 
 
131 aa  67.8  0.00000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0772026  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3000  protein of unknown function UPF0047  33.83 
 
 
130 aa  67.8  0.00000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1526  hypothetical protein  36.29 
 
 
133 aa  66.6  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.183474 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1050  protein of unknown function UPF0047  33.82 
 
 
136 aa  66.6  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.474236  normal  0.296699 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1211  protein of unknown function UPF0047  31.34 
 
 
133 aa  65.9  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2112  hypothetical protein  35.34 
 
 
132 aa  65.5  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000735836  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1517  protein of unknown function UPF0047  31.71 
 
 
130 aa  65.1  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1051  protein of unknown function UPF0047  37.07 
 
 
126 aa  63.9  0.0000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108207  normal  0.446861 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2150  hypothetical protein  30.83 
 
 
131 aa  64.3  0.0000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000319689  hitchhiker  0.000345758 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0408  protein of unknown function UPF0047  38.98 
 
 
128 aa  63.2  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.170864  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1967  hypothetical protein  34.33 
 
 
132 aa  63.5  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.990431  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1261  protein of unknown function UPF0047  28.91 
 
 
143 aa  62.4  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.285021  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0951  hypothetical protein  32.06 
 
 
129 aa  62.4  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.672358  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1000  protein of unknown function UPF0047  31.62 
 
 
133 aa  62  0.000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.606508  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1088  protein of unknown function UPF0047  26.67 
 
 
139 aa  61.6  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.977912 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1995  hypothetical protein  32.77 
 
 
133 aa  61.6  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1825  protein of unknown function UPF0047  30.08 
 
 
141 aa  61.2  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.47523 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3696  hypothetical protein  28.99 
 
 
145 aa  60.8  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1952  protein of unknown function UPF0047  31.54 
 
 
139 aa  60.8  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03800  conserved hypothetical protein TIGR00149  36.7 
 
 
132 aa  61.2  0.000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0264  protein of unknown function UPF0047  30.3 
 
 
140 aa  60.1  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.846801  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4820  hypothetical protein  31.36 
 
 
157 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.277818  normal  0.824892 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0463  hypothetical protein  30.3 
 
 
142 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.822173  normal  0.159097 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1745  protein of unknown function UPF0047  34.71 
 
 
132 aa  60.1  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1612  hypothetical protein  32.52 
 
 
137 aa  59.7  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0826  hypothetical protein  31.36 
 
 
133 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0251  hypothetical protein  31.82 
 
 
142 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.33287  normal  0.163984 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0603  hypothetical protein  29.55 
 
 
143 aa  59.3  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0925  hypothetical protein  33.33 
 
 
132 aa  58.9  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000978518  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0431  hypothetical protein  30.08 
 
 
132 aa  58.9  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0277947  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0129  hypothetical protein  31.85 
 
 
138 aa  58.9  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0301  hypothetical protein  30.3 
 
 
160 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.157186 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3648  hypothetical protein  29.1 
 
 
134 aa  58.5  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0103  hypothetical protein  29.37 
 
 
130 aa  58.5  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0339  protein of unknown function UPF0047  27.48 
 
 
137 aa  57.8  0.00000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0167  hypothetical protein  27.97 
 
 
136 aa  57.8  0.00000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0986  protein of unknown function UPF0047  36.69 
 
 
139 aa  57.4  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0759646  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0693  hypothetical protein  27.74 
 
 
133 aa  57.4  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000221984  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0262  hypothetical protein  28.81 
 
 
132 aa  57  0.00000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.016516  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2505  protein of unknown function UPF0047  28.79 
 
 
131 aa  57  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1056  hypothetical protein  31.11 
 
 
133 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.858147  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2724  hypothetical protein  30.48 
 
 
140 aa  56.2  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.277726  decreased coverage  0.0000377409 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1451  hypothetical protein  31.75 
 
 
157 aa  56.6  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0452  hypothetical protein  29.2 
 
 
132 aa  56.6  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.430845  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0451  hypothetical protein  32.03 
 
 
148 aa  56.2  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.355993  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0983  protein of unknown function UPF0047  36.69 
 
 
139 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2911  hypothetical protein  25.58 
 
 
145 aa  56.2  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735439  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0947  hypothetical protein  33.06 
 
 
132 aa  55.8  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12412  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0313  hypothetical protein  30.66 
 
 
152 aa  56.2  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2221  protein of unknown function UPF0047  29.23 
 
 
141 aa  55.5  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1494  hypothetical protein  31.75 
 
 
131 aa  55.1  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0918  protein of unknown function UPF0047  33.9 
 
 
157 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.676321  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0927  hypothetical protein  35.97 
 
 
136 aa  55.5  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3472  protein of unknown function UPF0047  28.35 
 
 
133 aa  55.5  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00822222  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1450  protein of unknown function UPF0047  28.45 
 
 
137 aa  55.5  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.713066  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2316  protein of unknown function UPF0047  29.63 
 
 
138 aa  55.1  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1204  hypothetical protein  27.12 
 
 
136 aa  55.5  0.0000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2077  hypothetical protein  29.09 
 
 
137 aa  54.7  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00188003  hitchhiker  0.000638573 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0242  hypothetical protein  28.89 
 
 
138 aa  54.7  0.0000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0850  hypothetical protein  29.66 
 
 
155 aa  54.7  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.162209  normal  0.719995 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0727  hypothetical protein  29.2 
 
 
143 aa  54.7  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0718399  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2260  protein of unknown function UPF0047  34.62 
 
 
130 aa  54.3  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000782775  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1703  protein of unknown function UPF0047  32.26 
 
 
140 aa  54.3  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_136  hypothetical protein  28.15 
 
 
138 aa  54.3  0.0000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0621  hypothetical protein  31.93 
 
 
131 aa  54.3  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.688874  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0655  hypothetical protein  27.97 
 
 
139 aa  54.3  0.0000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0017  hypothetical protein  30.51 
 
 
136 aa  54.3  0.0000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00239143  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2219  hypothetical protein  30.88 
 
 
140 aa  54.3  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.334245  normal  0.457573 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>