124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6360 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6360  hypothetical protein  100 
 
 		 619 aa  1218    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00827876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3206  hypothetical protein  56.2 
 
 		 574 aa  592  1e-168  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.136417  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3268  hypothetical protein  56.2 
 
 		 574 aa  592  1e-168  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3217  hypothetical protein  56.2 
 
 		 574 aa  592  1e-168  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.784644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4598  hypothetical protein  55.59 
 
 		 578 aa  588  1e-166  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0342  hypothetical protein  53.1 
 
 		 587 aa  571  1e-161  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4431  protein of unknown function DUF1446  52.48 
 
 		 581 aa  554  1e-156  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0308789 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3831  protein of unknown function DUF1446  51.92 
 
 		 587 aa  551  1e-155  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0438804  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4325  hypothetical protein  51.94 
 
 		 562 aa  541  9.999999999999999e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0144573 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4684  hypothetical protein  52.06 
 
 		 575 aa  533  1e-150  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.667747 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10994  hypothetical protein  52.75 
 
 		 560 aa  534  1e-150  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.59299e-17  normal  0.631418 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16490  Protein of unknown function (DUF1446)  52.72 
 
 		 561 aa  530  1e-149  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4304  hypothetical protein  51.9 
 
 		 575 aa  530  1e-149  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.488796  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4390  hypothetical protein  51.9 
 
 		 575 aa  530  1e-149  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.392949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4765  hypothetical protein  51.85 
 
 		 562 aa  526  1e-148  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000030187 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2176  hypothetical protein  49.92 
 
 		 596 aa  517  1.0000000000000001e-145  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1885  hypothetical protein  52.01 
 
 		 578 aa  512  1e-144  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.181463 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1033  protein of unknown function DUF1446  48.2 
 
 		 588 aa  499  1e-140  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.62804  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6153  protein of unknown function DUF1446  49.28 
 
 		 594 aa  498  1e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.723364  normal  0.255067 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4555  hypothetical protein  49.61 
 
 		 584 aa  491  1e-137  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.655173  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2826  protein of unknown function DUF1446  47.76 
 
 		 580 aa  464  1e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.125317  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4846  hypothetical protein  56.73 
 
 		 570 aa  458  1e-127  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.726466  normal  0.275126 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3231  protein of unknown function DUF1446  48.48 
 
 		 596 aa  451  1e-125  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.113119  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0040  protein of unknown function DUF1446  37.36 
 
 		 616 aa  318  2e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.479807  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26750  hypothetical protein  35.85 
 
 		 600 aa  317  5e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2689  hypothetical protein  36.99 
 
 		 612 aa  313  6.999999999999999e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.217964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2802  hypothetical protein  34.74 
 
 		 598 aa  312  1e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.780991  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2268  hypothetical protein  35.69 
 
 		 600 aa  310  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0110  protein of unknown function DUF1446  35.56 
 
 		 590 aa  306  8.000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0320  hypothetical protein  32.86 
 
 		 603 aa  300  7e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3945  hypothetical protein  33.49 
 
 		 596 aa  299  9e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3627  hypothetical protein  35.81 
 
 		 607 aa  293  4e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0103  protein of unknown function DUF1446  35.59 
 
 		 590 aa  291  2e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4459  hypothetical protein  33.96 
 
 		 599 aa  270  7e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286851  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06205  conserved hypothetical protein  29.56 
 
 		 654 aa  265  1e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4188  hypothetical protein  40 
 
 		 608 aa  252  1e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.217981  normal  0.463566 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1474  hypothetical protein  42.73 
 
 		 445 aa  238  2e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.274913  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1910  protein of unknown function DUF1446  43.1 
 
 		 450 aa  232  1e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1818  hypothetical protein  43.1 
 
 		 450 aa  231  3e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.991899 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3392  hypothetical protein  43.45 
 
 		 450 aa  230  6e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.703348  normal  0.110524 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2416  hypothetical protein  33.28 
 
 		 571 aa  230  7e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.011341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4171  hypothetical protein  39.39 
 
 		 445 aa  228  3e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4091  protein of unknown function DUF1446  42.15 
 
 		 452 aa  226  8e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1271  hypothetical protein  41.4 
 
 		 453 aa  225  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.11625 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1245  hypothetical protein  43.31 
 
 		 453 aa  223  6e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3735  protein of unknown function DUF1446  42.12 
 
 		 451 aa  223  7e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4812  protein of unknown function DUF1446  42.12 
 
 		 451 aa  223  7e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.532923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0825  hypothetical protein  36.9 
 
 		 445 aa  220  6e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.372095 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4511  hypothetical protein  40.86 
 
 		 452 aa  219  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.697863 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10086  DUF1446 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G11420)  34.47 
 
 		 587 aa  216  9.999999999999999e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.483728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3292  hypothetical protein  39.95 
 
 		 452 aa  216  9.999999999999999e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1346  hypothetical protein  40.21 
 
 		 461 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0284571 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0886  hypothetical protein  40.21 
 
 		 461 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1368  hypothetical protein  40.21 
 
 		 461 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1725  hypothetical protein  34.88 
 
 		 627 aa  214  3.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0106987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1928  hypothetical protein  41.86 
 
 		 453 aa  214  4.9999999999999996e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0148071 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3689  protein of unknown function DUF1446  41.57 
 
 		 444 aa  213  7e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.539292  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0976  hypothetical protein  39.13 
 
 		 442 aa  213  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000643753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0713  hypothetical protein  42.03 
 
 		 482 aa  213  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4147  protein of unknown function DUF1446  37.64 
 
 		 445 aa  212  2e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1939  hypothetical protein  39.08 
 
 		 445 aa  210  6e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  1.28662e-16  normal  0.114888 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3167  protein of unknown function DUF1446  37.5 
 
 		 446 aa  210  8e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0474207  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6325  hypothetical protein  40.99 
 
 		 452 aa  209  9e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.877291 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1495  hypothetical protein  37.22 
 
 		 454 aa  209  1e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.123064  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6706  hypothetical protein  41.98 
 
 		 444 aa  209  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0392889 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4610  hypothetical protein  36.28 
 
 		 451 aa  209  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5610  hypothetical protein  39.24 
 
 		 445 aa  208  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1164  hypothetical protein  36.44 
 
 		 446 aa  208  3e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.301898  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5398  hypothetical protein  44.97 
 
 		 453 aa  207  5e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4625  hypothetical protein  36.14 
 
 		 451 aa  207  6e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.245969  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4048  hypothetical protein  39.83 
 
 		 445 aa  207  6e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.905115 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3666  protein of unknown function DUF1446  43.24 
 
 		 443 aa  206  1e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0192  protein of unknown function DUF1446  36.43 
 
 		 445 aa  204  3e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000279886  decreased coverage  0.000101954 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2761  hypothetical protein  41.05 
 
 		 458 aa  199  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.0046084  normal  0.122953 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5880  hypothetical protein  44.65 
 
 		 466 aa  197  6e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2040  protein of unknown function DUF1446  42.6 
 
 		 473 aa  196  8.000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.378243  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2111  hypothetical protein  34.67 
 
 		 451 aa  196  9e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.310455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2673  hypothetical protein  36.29 
 
 		 454 aa  191  4e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0708192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18500  Protein of unknown function (DUF1446)  36.81 
 
 		 441 aa  191  4e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1227  hypothetical protein  35.67 
 
 		 448 aa  187  5e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17100  hypothetical protein  36.38 
 
 		 449 aa  166  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.550956  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4047  beta-lactamase  42.39 
 
 		 111 aa  68.9  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.98227 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2112  hypothetical protein  41.3 
 
 		 123 aa  66.6  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.481323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5609  hypothetical protein  40.22 
 
 		 103 aa  63.5  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1494  Beta-lactamase  38.04 
 
 		 505 aa  62.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0788592  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0824  hypothetical protein  38.46 
 
 		 103 aa  62.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.299347 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3688  hypothetical protein  41.86 
 
 		 105 aa  63.2  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0989403  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2041  hypothetical protein  39.18 
 
 		 122 aa  62.4  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.448416  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2933  hypothetical protein  39.33 
 
 		 107 aa  61.6  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0184973  normal  0.826578 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3291  hypothetical protein  41.57 
 
 		 108 aa  61.6  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3736  hypothetical protein  42.05 
 
 		 106 aa  60.8  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4813  hypothetical protein  42.05 
 
 		 106 aa  60.8  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.927854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5399  hypothetical protein  39.02 
 
 		 114 aa  60.8  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1473  hypothetical protein  37.08 
 
 		 104 aa  60.5  0.00000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.192982  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5881  hypothetical protein  36.08 
 
 		 114 aa  60.5  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.336106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3168  hypothetical protein  34.78 
 
 		 99 aa  60.1  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.801099  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4170  hypothetical protein  39.77 
 
 		 100 aa  60.1  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1367  hypothetical protein  36 
 
 		 107 aa  60.5  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.948811 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1163  hypothetical protein  34.78 
 
 		 99 aa  58.5  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.450464  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1927  hypothetical protein  37.23 
 
 		 103 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.011093 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>