More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6255 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6255  putative cytochrome P450  100 
 
 
399 aa  798    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.553976  normal  0.0297217 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0173  cytochrome P450  63.41 
 
 
395 aa  496  1e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3157  putative cytochrome P450  60.95 
 
 
401 aa  462  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.192743  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1302  cytochrome P450  59.59 
 
 
400 aa  445  1.0000000000000001e-124  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0166  cytochrome P450  55.05 
 
 
401 aa  436  1e-121  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2740  cytochrome P450  56.39 
 
 
400 aa  422  1e-117  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162122  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1731  cytochrome P450  55.78 
 
 
407 aa  409  1e-113  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8861  hypothetical protein  55.33 
 
 
399 aa  394  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4942  cytochrome P450  54.36 
 
 
436 aa  392  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4832  cytochrome P450  53.22 
 
 
408 aa  392  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.362244  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1075  cytochrome P450  54.45 
 
 
400 aa  385  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3146  cytochrome P450  55.71 
 
 
410 aa  379  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.853074  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1637  cytochrome P450  51.61 
 
 
400 aa  380  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146914  normal  0.0804397 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5423  putative cytochrome P450  53.28 
 
 
430 aa  377  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105829  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4689  cytochrome P450  51.73 
 
 
402 aa  377  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0545  cytochrome P450  51.03 
 
 
408 aa  378  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1599  cytochrome P450  52.24 
 
 
399 aa  371  1e-101  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.658435 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1961  cytochrome P450  51.13 
 
 
399 aa  362  8e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00170835  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1260  cytochrome P450  52.52 
 
 
421 aa  359  4e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000262244 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22760  cytochrome P450  49.88 
 
 
409 aa  356  5e-97  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.984145 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3662  cytochrome P450  51.79 
 
 
414 aa  353  2.9999999999999997e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1111  cytochrome P450  53.37 
 
 
345 aa  350  3e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20408  normal  0.31292 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1952  cytochrome P450  49.01 
 
 
409 aa  350  3e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5009  putative cytochrome P450  54.19 
 
 
357 aa  349  6e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.14633 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7070  putative cytochrome P450  46.78 
 
 
408 aa  346  4e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0518  cytochrome P450  52.04 
 
 
406 aa  343  2e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0530  cytochrome P450  52.04 
 
 
406 aa  343  2e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0508  cytochrome P450  52.04 
 
 
406 aa  343  2e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.642311  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1904  cytochrome P450  49.08 
 
 
400 aa  340  2.9999999999999998e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0311856  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1245  cytochrome P450  46.37 
 
 
397 aa  339  5e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0231454  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4313  cytochrome P450  48.2 
 
 
400 aa  336  5e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0682  cytochrome P450  51.26 
 
 
406 aa  332  9e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.482648 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0225  cytochrome P450  50.64 
 
 
406 aa  330  2e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401292  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2894  cytochrome P450  47.01 
 
 
407 aa  328  7e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1843  cytochrome P450  46.78 
 
 
403 aa  328  1.0000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1521  cytochrome P450  43.91 
 
 
407 aa  325  1e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1544  cytochrome P450  43.91 
 
 
407 aa  325  1e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4934  putative cytochrome P450  46.65 
 
 
405 aa  323  3e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3276  cytochrome P450  44.58 
 
 
407 aa  322  5e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.684608  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4428  cytochrome P450  45.54 
 
 
401 aa  317  2e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.144119 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2418  cytochrome P450  46.13 
 
 
409 aa  316  5e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0896304  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2538  cytochrome P450  43.38 
 
 
408 aa  311  2e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107795  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4234  cytochrome P450  45.1 
 
 
409 aa  310  4e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.118496  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4555  putative cytochrome P450  52.68 
 
 
394 aa  309  5e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268858  normal  0.410272 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4429  cytochrome P450  44.69 
 
 
413 aa  303  3.0000000000000004e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2582  cytochrome P450  43.89 
 
 
404 aa  302  8.000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.668596 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26970  cytochrome P450  44.7 
 
 
405 aa  301  1e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.836676  normal  0.413718 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2614  cytochrome P450  46.06 
 
 
400 aa  300  2e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3767  cytochrome P450  44.39 
 
 
412 aa  293  4e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.319516  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3840  cytochrome P450  44.39 
 
 
412 aa  293  4e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4932  cytochrome P450  44.09 
 
 
423 aa  292  6e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.847622  normal  0.613377 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4419  cytochrome P450  46.1 
 
 
397 aa  291  1e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.499307  normal  0.465051 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2103  cytochrome P450  41.48 
 
 
415 aa  291  2e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3779  cytochrome P450  44.12 
 
 
412 aa  290  3e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1339  cytochrome P450  43.04 
 
 
416 aa  289  7e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4201  cytochrome P450  42.16 
 
 
421 aa  287  2e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4267  cytochrome P450  42.16 
 
 
421 aa  287  2e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.476691  normal  0.954738 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4428  cytochrome P450  42.16 
 
 
421 aa  287  2e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.392257  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3277  cytochrome P450  44.56 
 
 
405 aa  286  4e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.810975  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5801  cytochrome P450  45.39 
 
 
395 aa  284  2.0000000000000002e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0291832  normal  0.365285 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1407  cytochrome P450  43.6 
 
 
388 aa  283  3.0000000000000004e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2535  cytochrome P450  44.99 
 
 
423 aa  281  1e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369164  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3475  cytochrome P450  43.4 
 
 
398 aa  281  2e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000451038  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1037  cytochrome P450  42.68 
 
 
409 aa  280  4e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.066208  normal  0.0434723 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  43.58 
 
 
398 aa  277  2e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  40.99 
 
 
405 aa  267  2e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33480  cytochrome P450  41.04 
 
 
406 aa  267  2e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.220478 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3470  cytochrome P450  43.78 
 
 
404 aa  267  2.9999999999999995e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0620803  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2024  cytochrome P450  39.65 
 
 
424 aa  266  5.999999999999999e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00720801  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5317  cytochrome P450  44.62 
 
 
395 aa  264  3e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3241  cytochrome P450  40.66 
 
 
415 aa  262  8.999999999999999e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0945  putative cytochrome P450  41.19 
 
 
410 aa  261  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  42.01 
 
 
394 aa  260  3e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  41.54 
 
 
417 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2715  cytochrome P450  38.64 
 
 
393 aa  254  3e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.41734  normal  0.475475 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  43.33 
 
 
412 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2787  cytochrome P450  36.92 
 
 
411 aa  246  6e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.141532  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  37.65 
 
 
411 aa  243  5e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2770  cytochrome P450  41.6 
 
 
395 aa  242  9e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00247392 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5774  cytochrome P450  40 
 
 
375 aa  241  2e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  39.07 
 
 
400 aa  240  4e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7474  cytochrome P-450  41.27 
 
 
402 aa  240  4e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.884361  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  41.3 
 
 
406 aa  239  8e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  38.34 
 
 
410 aa  237  3e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2105  cytochrome P450  35.98 
 
 
407 aa  235  8e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.34341  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4384  cytochrome P450  38.95 
 
 
400 aa  234  1.0000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  39.69 
 
 
411 aa  235  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  41.26 
 
 
402 aa  234  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2746  cytochrome P450  39.3 
 
 
391 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.136535  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  39.59 
 
 
408 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  38.05 
 
 
400 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3692  cytochrome P450  38.92 
 
 
397 aa  233  5e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2524  cytochrome P450  39.95 
 
 
405 aa  233  6e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4178  cytochrome P450  37.99 
 
 
399 aa  231  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608924  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4927  putative cytochrome P450  36.5 
 
 
404 aa  230  4e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0738351  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3162  cytochrome P450  39.28 
 
 
404 aa  229  6e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.411247  hitchhiker  0.000117397 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  40.38 
 
 
412 aa  229  7e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3008  cytochrome P450  37.81 
 
 
401 aa  227  2e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  35.16 
 
 
420 aa  228  2e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  35.08 
 
 
411 aa  223  3e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>