55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6011 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6011  membrane protein-like protein  100 
 
 		 406 aa  804    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0111505  normal  0.791396 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1978  hypothetical protein  65.27 
 
 		 492 aa  361  2e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1996  putative integral membrane protein  45.54 
 
 		 442 aa  309  5.9999999999999995e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2216  membrane protein-like protein  50.13 
 
 		 397 aa  260  2e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000105763  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2972  putative integral membrane protein  47.08 
 
 		 428 aa  257  3e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0323  hypothetical protein  36.56 
 
 		 442 aa  183  4.0000000000000006e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.168214  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35570  predicted membrane protein  36.52 
 
 		 369 aa  183  5.0000000000000004e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00968721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0319  membrane protein-like protein  37.75 
 
 		 502 aa  176  6e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0495235  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0276  membrane protein-like protein  39.19 
 
 		 502 aa  173  5e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0292908 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1985  membrane protein  36.46 
 
 		 470 aa  172  1e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.775986  normal  0.0143914 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3033  membrane protein  39.63 
 
 		 388 aa  167  4e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08850  predicted membrane protein  35.14 
 
 		 390 aa  158  1e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0749641  normal  0.0331265 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3357  hypothetical protein  32.98 
 
 		 399 aa  155  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.410286 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3024  hypothetical protein  33.05 
 
 		 392 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00601193  normal  0.11527 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3055  hypothetical protein  32.49 
 
 		 392 aa  153  5e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3009  hypothetical protein  32.49 
 
 		 392 aa  153  5e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.477214  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1365  putative integral membrane protein  37.72 
 
 		 377 aa  153  5e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3562  hypothetical protein  33.05 
 
 		 399 aa  152  7e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.118202  normal  0.328074 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3715  hypothetical protein  41.81 
 
 		 369 aa  151  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.376902  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2268  hypothetical protein  35.67 
 
 		 366 aa  148  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.37562  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13920  predicted membrane protein  36.03 
 
 		 437 aa  148  2.0000000000000003e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0156682  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2005  putative integral membrane protein  31.64 
 
 		 425 aa  147  3e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000213441 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12520  predicted membrane protein  29.89 
 
 		 468 aa  140  3.9999999999999997e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.360296  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5989  membrane protein-like protein  34.93 
 
 		 445 aa  135  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112909 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2583  putative integral membrane protein  32.23 
 
 		 327 aa  113  6e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.003396 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3589  hypothetical protein  30.26 
 
 		 313 aa  99.4  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4278  membrane protein-like protein  29.51 
 
 		 404 aa  96.3  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.277261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1254  hypothetical protein  30.25 
 
 		 347 aa  85.9  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1820  membrane protein-like protein  33.52 
 
 		 411 aa  79.7  0.00000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.335053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2739  membrane protein-like protein  32.6 
 
 		 408 aa  77.4  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02140  predicted membrane protein  31.64 
 
 		 205 aa  69.7  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0746  membrane protein  31.23 
 
 		 389 aa  63.9  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0976  hypothetical protein  29.91 
 
 		 229 aa  63.5  0.000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0255663  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1250  hypothetical protein  31.01 
 
 		 228 aa  61.2  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.361549  normal  0.274152 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0448  hypothetical protein  25.93 
 
 		 252 aa  60.8  0.00000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1522  membrane protein-like protein  29.56 
 
 		 374 aa  60.1  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1722  membrane protein-like protein  32.86 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0829  FHA domain containing protein  28.66 
 
 		 439 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00203514 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1066  hypothetical protein  28.35 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00537874  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0500  hypothetical protein  31.18 
 
 		 219 aa  57  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3987  membrane protein-like protein  29.44 
 
 		 397 aa  56.6  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.203091  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0633  hypothetical protein  31.88 
 
 		 267 aa  56.2  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000160183  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0448  hypothetical protein  26.98 
 
 		 225 aa  55.1  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3275  hypothetical protein  31.44 
 
 		 332 aa  53.5  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.880784  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1256  hypothetical protein  30.46 
 
 		 407 aa  51.6  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2176  hypothetical protein  29.49 
 
 		 224 aa  52.4  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04240  predicted membrane protein  34.48 
 
 		 329 aa  50.8  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0185  hypothetical protein  34.52 
 
 		 269 aa  49.3  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1689  YpdC  28.57 
 
 		 224 aa  48.9  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0307  FHA domain-containing protein  26.92 
 
 		 444 aa  47.8  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1238  membrane protein  31.67 
 
 		 382 aa  47  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.375166  normal  0.0948074 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0328  membrane protein-like protein  28.57 
 
 		 216 aa  46.6  0.0007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00221731  hitchhiker  0.00778453 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3270  membrane protein-like protein  28.57 
 
 		 337 aa  46.6  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2611  TPR repeat-containing protein  25.17 
 
 		 915 aa  44.3  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05830  predicted membrane protein  25.42 
 
 		 226 aa  43.9  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.42901  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>