More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5784 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_5784  Membrane protein related to metalloendopeptidase- like protein  100 
 
 
306 aa  615  1e-175  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.159447  normal  0.0159463 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3390  Membrane protein related to metalloendopeptidase- like protein  84.96 
 
 
342 aa  444  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.770035 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4707  Peptidase M23  62.82 
 
 
294 aa  333  2e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.440213  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3107  Peptidase M23  49.26 
 
 
304 aa  226  4e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.25342  normal  0.558977 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5785  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  82.46 
 
 
477 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.204427  normal  0.0325548 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3389  Negative regulator of beta-lactamase expression- like protein  84.91 
 
 
480 aa  192  8e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2500  peptidase M23B  39.91 
 
 
506 aa  112  6e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0374787 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6031  hypothetical protein  42 
 
 
269 aa  111  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.415177  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6355  Serine/threonine protein kinase-like protein  49.53 
 
 
599 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.555336  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6024  Peptidase M23  40 
 
 
194 aa  99.8  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.700284  normal  0.880043 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3026  Peptidase M23  41.46 
 
 
433 aa  98.6  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8081  Serine/threonine protein kinase-like protein  57.78 
 
 
769 aa  97.8  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.887421  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8080  Serine/threonine protein kinase-like protein  57.78 
 
 
726 aa  97.1  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1381  peptidase M23B  39.58 
 
 
491 aa  93.2  5e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.897006  normal  0.0374787 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4392  hypothetical protein  42.98 
 
 
201 aa  88.2  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2410  hypothetical protein  48.51 
 
 
137 aa  85.1  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.114407 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2409  hypothetical protein  47.57 
 
 
139 aa  83.6  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.115934 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2410  peptidoglycan-binding LysM  46 
 
 
295 aa  80.1  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000688679  unclonable  0.000000112748 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  46.08 
 
 
314 aa  79  0.00000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5539  hypothetical protein  47.27 
 
 
133 aa  78.6  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2194  Peptidase M23  49.43 
 
 
412 aa  78.6  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000181252  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2411  hypothetical protein  47.73 
 
 
138 aa  76.6  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0662721 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  47.42 
 
 
376 aa  76.3  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  44.33 
 
 
372 aa  75.9  0.0000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5297  hypothetical protein  49.5 
 
 
152 aa  74.7  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.60592  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  46.39 
 
 
468 aa  72.8  0.000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0255  peptidase M23B  33.56 
 
 
305 aa  72.8  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0280705 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1119  peptidase M23B  40 
 
 
669 aa  71.2  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3489  peptidase M23B  41.49 
 
 
288 aa  70.5  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.20898 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3112  peptidase M23B  40.54 
 
 
633 aa  70.1  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.233689 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1809  peptidase M23  35.71 
 
 
414 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00301021 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  45.54 
 
 
305 aa  69.3  0.00000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2752  Peptidase M23  44.68 
 
 
482 aa  68.9  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.76088  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6051  Peptidase M23  38.13 
 
 
382 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.72546  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0305  peptidase M23  37.04 
 
 
294 aa  68.6  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0127827  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3167  Peptidase M23  33.57 
 
 
391 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2235  peptidase M23B  42.86 
 
 
288 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000416895  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2121  Peptidase M23  40.62 
 
 
262 aa  67.4  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5846  peptidase M23B  41.58 
 
 
415 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0025  peptidase M23B  42.86 
 
 
402 aa  67.4  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.025775 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2579  peptidase M23B  44.87 
 
 
384 aa  67.4  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2401  peptidase M23B  34.69 
 
 
297 aa  67  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2244  peptidase M23B  40.65 
 
 
1048 aa  67  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0030  Peptidase M23  42.31 
 
 
445 aa  66.6  0.0000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  47.67 
 
 
379 aa  66.6  0.0000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2264  peptidase M23B  43.01 
 
 
450 aa  66.2  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.971907  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3506  peptidase M23B  44.71 
 
 
741 aa  66.2  0.0000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000124744  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  47.56 
 
 
430 aa  66.2  0.0000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2607  peptidase M23B  39.18 
 
 
581 aa  65.9  0.0000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0475  peptidase M23B  39.45 
 
 
464 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0764227  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1006  Peptidase M23  41.75 
 
 
324 aa  65.1  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2159  Peptidase M23  37.96 
 
 
299 aa  65.1  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.409272  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2983  peptidase M23B  31.47 
 
 
392 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  36.56 
 
 
282 aa  65.5  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3209  Peptidase M23  31.47 
 
 
392 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.626752  normal  0.571204 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1788  Peptidase M23  44.33 
 
 
402 aa  64.7  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1127  peptidase M23B  45.26 
 
 
468 aa  64.3  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000608337  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3003  peptidase M23B  43.75 
 
 
457 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.070332 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3690  peptidase M23B  39.13 
 
 
328 aa  64.3  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  42.71 
 
 
455 aa  64.7  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  43.53 
 
 
399 aa  64.7  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0505  peptidase M23B  36.88 
 
 
465 aa  64.7  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0656  peptidase M23B  41.82 
 
 
490 aa  64.3  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45264  normal  0.700073 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  37.19 
 
 
491 aa  64.7  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0849  M24/M37 family peptidase  45.74 
 
 
462 aa  64.7  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0168749  normal  0.445111 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2733  Peptidase M23  41.67 
 
 
456 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0799  Peptidase M23  43.33 
 
 
294 aa  63.9  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00788388  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0287  Peptidase M23  34.96 
 
 
297 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2447  peptidase M23B  43.75 
 
 
459 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2119  Peptidase M23  35.43 
 
 
323 aa  64.3  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0803  Peptidase M23  41.84 
 
 
292 aa  64.3  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0616  peptidase M23B  34.87 
 
 
319 aa  63.9  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137898  hitchhiker  0.00000225062 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1541  peptidase M23  39.82 
 
 
425 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1518  peptidase M23B  39.82 
 
 
425 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0826  Peptidase M23  40.86 
 
 
281 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  40.43 
 
 
375 aa  63.5  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0251  M23 peptidase domain protein  41.38 
 
 
341 aa  63.5  0.000000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  43.01 
 
 
452 aa  63.5  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0798  Peptidase M23  40.86 
 
 
281 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0681  M24/M37 family peptidase  40.21 
 
 
577 aa  63.2  0.000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6410  peptidase M23B  41.18 
 
 
491 aa  63.5  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101162  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0609  Peptidase M23  44.58 
 
 
412 aa  63.2  0.000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.01787e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0752  peptidoglycan-binding peptidase M23B  43.01 
 
 
291 aa  63.2  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.897589  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0061  peptidase M23B  37.62 
 
 
387 aa  63.2  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0758  Peptidase M23  37.3 
 
 
290 aa  63.2  0.000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1618  peptidase M23B  41.41 
 
 
412 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278524  normal  0.127445 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0673  M24/M37 family peptidase  40.21 
 
 
577 aa  63.2  0.000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.38498  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  41.94 
 
 
375 aa  63.2  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0655  putative membrane associated metallopeptidases  40.96 
 
 
337 aa  63.2  0.000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.964421  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0912  Peptidase M23  43.75 
 
 
276 aa  63.2  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.677753 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3816  peptidase M23B  43.75 
 
 
283 aa  63.2  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0203  enterotoxin, putative  46.07 
 
 
603 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  44.19 
 
 
309 aa  62.8  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  47.06 
 
 
569 aa  62.8  0.000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0795  peptidase M23B  40.34 
 
 
316 aa  62.8  0.000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.244316 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0263  peptidase, M23/M37 family  46.07 
 
 
603 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0304388 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3948  peptidase M23B  42.86 
 
 
311 aa  62.8  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.703848  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0286  peptidase M23B  41.94 
 
 
374 aa  62.8  0.000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  41.94 
 
 
374 aa  62.8  0.000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2849  peptidase M23B  39.58 
 
 
455 aa  62.8  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.649835  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>