38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3228 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3228  hypothetical protein  100 
 
 		 485 aa  926    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1909  FG-GAP repeat-containing protein  55.79 
 
 		 458 aa  335  9e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.121674 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3991  FG-GAP repeat protein  33.26 
 
 		 500 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.751773  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0907  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  32.93 
 
 		 502 aa  111  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.26698 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0477  FG-GAP repeat protein  31.33 
 
 		 466 aa  109  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00503985 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0908  hypothetical protein  30.79 
 
 		 482 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.346028 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0906  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  33.93 
 
 		 493 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.40669 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3560  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  31.79 
 
 		 472 aa  87  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2050  FG-GAP repeat protein  30.12 
 
 		 1437 aa  82.4  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3145  FG-GAP repeat protein  30.7 
 
 		 1346 aa  75.9  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3146  FG-GAP repeat protein  30.13 
 
 		 1337 aa  69.7  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2527  FG-GAP repeat protein  26.93 
 
 		 1433 aa  68.9  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000205902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3148  FG-GAP repeat protein  26.48 
 
 		 1348 aa  66.6  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.589686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2092  Integrins alpha chain  29.84 
 
 		 621 aa  64.3  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0373824  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4195  FG-GAP repeat protein  26.1 
 
 		 749 aa  63.5  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.003825  normal  0.0840228 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.71 
 
 		 11716 aa  62.4  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1337  Integrins alpha chain  30.5 
 
 		 1434 aa  58.5  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.153084  normal  0.903463 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1762  Integrins alpha chain  29.62 
 
 		 640 aa  57.8  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000197793  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.02 
 
 		 2507 aa  56.2  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2093  Integrins alpha chain  29.65 
 
 		 702 aa  54.7  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.120289  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4196  FG-GAP repeat protein  28.52 
 
 		 752 aa  54.7  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000719971  normal  0.263746 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0138  FG-GAP repeat protein  30.7 
 
 		 937 aa  54.3  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.247842 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8620  hypothetical protein  32.62 
 
 		 458 aa  53.5  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1540  putative lipoprotein  25.62 
 
 		 404 aa  51.2  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402667  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5731  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  30.19 
 
 		 1073 aa  51.2  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4585  FG-GAP repeat-containing protein  29.81 
 
 		 503 aa  49.7  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000887674  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2273  FG-GAP repeat protein  32.34 
 
 		 1827 aa  49.3  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  26.42 
 
 		 1126 aa  48.1  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1222  FG-GAP repeat protein  29.62 
 
 		 885 aa  47.8  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.93 
 
 		 1340 aa  47.4  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4549  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.9 
 
 		 690 aa  47.8  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2201  cable pili-associated 22 kDa adhesin protein  25.26 
 
 		 2911 aa  46.6  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.266239  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2063  type I secretion target repeat-containing protein  25.52 
 
 		 3204 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  32.79 
 
 		 830 aa  45.4  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.68 
 
 		 1118 aa  44.7  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  26.33 
 
 		 1490 aa  44.3  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2038  FG-GAP  27.57 
 
 		 690 aa  44.3  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0466844 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.53 
 
 		 1225 aa  43.1  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>