More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2905 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1430  amidase  76.09 
 
 		 466 aa  664    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.904351 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2905  Amidase  100 
 
 		 463 aa  919    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2860  amidase  60.26 
 
 		 477 aa  554  1e-156  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1254  amidase  59.83 
 
 		 472 aa  540  9.999999999999999e-153  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0238  amidase  60.35 
 
 		 475 aa  535  1e-151  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3400  Amidase  58.13 
 
 		 472 aa  526  1e-148  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.602142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20980  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  57.24 
 
 		 479 aa  471  1.0000000000000001e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.705121  normal  0.164362 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4989  Amidase  57.05 
 
 		 472 aa  426  1e-118  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4870  Amidase  52.58 
 
 		 473 aa  423  1e-117  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2583  amidase  52.75 
 
 		 490 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2709  amidase  52.31 
 
 		 490 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5611  amidase  49.15 
 
 		 494 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.967064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3678  amidase  49.15 
 
 		 494 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4689  amidase  49.15 
 
 		 494 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.292379  normal  0.198691 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2170  Amidase  47.94 
 
 		 487 aa  392  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4547  amidase  49.26 
 
 		 494 aa  385  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.193224 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4083  amidase  48.84 
 
 		 494 aa  385  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1131  amidase  48.26 
 
 		 494 aa  382  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.28334 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4003  amidase  48.29 
 
 		 494 aa  379  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582745  normal  0.212631 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4912  amidase  47.16 
 
 		 496 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1493  amidase  53.38 
 
 		 468 aa  371  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.710832  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56450  amidase  46.74 
 
 		 494 aa  361  1e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.677311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3629  amidase  49.2 
 
 		 477 aa  360  2e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.848783 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2877  putative amidotransferase  46.09 
 
 		 473 aa  355  7.999999999999999e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133365  normal  0.0420813 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1838  amidase  47.27 
 
 		 477 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.942234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0983  amidase  46.67 
 
 		 485 aa  352  8.999999999999999e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1671  amidase  46.58 
 
 		 482 aa  349  7e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.677063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1293  amidase  44.66 
 
 		 485 aa  347  3e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0666673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0285  amidase  47.77 
 
 		 485 aa  346  6e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.145916  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2751  amidase  46.28 
 
 		 485 aa  340  2e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306922 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1934  Amidase  46.36 
 
 		 477 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.000185189  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1453  Amidase  43.01 
 
 		 494 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.830679  normal  0.199782 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1486  amidase  46.41 
 
 		 497 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.44531  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1411  Amidase  43.23 
 
 		 491 aa  335  7.999999999999999e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.440545 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2551  amidase  45.53 
 
 		 485 aa  332  7.000000000000001e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2260  amidase  42.89 
 
 		 507 aa  332  8e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.172416  normal  0.824676 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2609  amidase  45.88 
 
 		 485 aa  332  1e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.369685 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2569  amidase family protein  43.11 
 
 		 507 aa  330  2e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.111289  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1252  amidase  45.51 
 
 		 484 aa  331  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0302  amidase  45.51 
 
 		 484 aa  330  3e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.551995  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1320  amidase  45.51 
 
 		 497 aa  330  3e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.257142  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0990  amidase  45.51 
 
 		 484 aa  330  3e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0577  amidase  45.51 
 
 		 484 aa  330  3e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2509  amidase  45.51 
 
 		 546 aa  330  4e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124724  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3826  amidase  43.96 
 
 		 509 aa  328  1.0000000000000001e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.124732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3120  amidase  47.51 
 
 		 521 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.766945 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1324  amidase  45.51 
 
 		 484 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.668427  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0497  Amidase  46.97 
 
 		 481 aa  324  2e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.112236  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0825  Amidase  45.26 
 
 		 480 aa  320  3e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4797  putative amidase  45.85 
 
 		 498 aa  320  3e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.199104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4073  amidase  42.86 
 
 		 556 aa  317  3e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4787  amidase  44.89 
 
 		 505 aa  317  4e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.383486 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2402  amidase  45.33 
 
 		 492 aa  314  2.9999999999999996e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.574141  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2464  amidase  44.42 
 
 		 494 aa  312  7.999999999999999e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0230  amidase  45.29 
 
 		 498 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.817663  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0709  Amidase  44.69 
 
 		 507 aa  305  1.0000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1681  amidase  46.9 
 
 		 480 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.536449 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1103  amidase  41.58 
 
 		 472 aa  300  5e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4143  amidase  43.47 
 
 		 486 aa  299  9e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2430  amidase  41.85 
 
 		 522 aa  296  8e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.656573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2205  Amidase  43.97 
 
 		 473 aa  293  5e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.904932  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1465  amidase  43.38 
 
 		 535 aa  292  7e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.741427 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6043  Amidase  43.52 
 
 		 471 aa  291  1e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.420135  normal  0.212505 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1626  Amidase  41.63 
 
 		 516 aa  290  5.0000000000000004e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.816774  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5322  amidase  41.85 
 
 		 481 aa  289  7e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.348723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2248  amidase  41.63 
 
 		 516 aa  289  7e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5467  amidase  42.57 
 
 		 508 aa  287  4e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0261101 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1658  amidase  41.91 
 
 		 507 aa  286  5e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2827  amidase  41.19 
 
 		 495 aa  281  1e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.865048  normal  0.150322 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4617  amidase  42.7 
 
 		 506 aa  281  2e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.130864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3083  amidase  41.7 
 
 		 463 aa  280  4e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0269706 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3827  amidase  35.53 
 
 		 495 aa  278  1e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.550794 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2243  amidase  40.47 
 
 		 463 aa  274  3e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00714372 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2532  amidase  41.95 
 
 		 463 aa  270  2.9999999999999997e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.123616 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3866  Amidase  38.48 
 
 		 480 aa  269  8.999999999999999e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1335  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  35.29 
 
 		 486 aa  269  1e-70  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1117  Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit and amidase  35.1 
 
 		 486 aa  268  2e-70  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1146  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.74 
 
 		 486 aa  256  5e-67  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2915  Amidase  39.28 
 
 		 495 aa  256  7e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0870  amidase  42.76 
 
 		 459 aa  248  1e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.555977 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1154  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  37.32 
 
 		 485 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1754  putative amidase  39.31 
 
 		 471 aa  245  9.999999999999999e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.674752  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0487  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.24 
 
 		 485 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0613  putative amidase  40.27 
 
 		 469 aa  243  7e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0287  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  35.98 
 
 		 486 aa  241  2e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000251975  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1770  amidase  35.88 
 
 		 475 aa  241  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.484438  normal  0.665122 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0653  putative amidase  40.04 
 
 		 469 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.247147 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30110  putative amidase  39.27 
 
 		 469 aa  238  1e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00374017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2009  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  37.78 
 
 		 487 aa  238  1e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5054  amidase  39.12 
 
 		 458 aa  239  1e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.903998 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0041  Amidase  37.67 
 
 		 483 aa  238  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0659  putative amidase  40.22 
 
 		 469 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5623  Amidase  36.19 
 
 		 492 aa  236  5.0000000000000005e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0559  Amidase  38.63 
 
 		 461 aa  236  6e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2094  Amidase  36.36 
 
 		 499 aa  236  7e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.403841  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0761  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.32 
 
 		 486 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4260  amidase  39 
 
 		 471 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.016839  hitchhiker  0.000222937 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3192  amidase family protein  37.88 
 
 		 475 aa  233  6e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0540  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.99 
 
 		 488 aa  231  2e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.732053  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1975  amidase  38.79 
 
 		 470 aa  231  2e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>