204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2041 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2041  putative transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 213 aa  415  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3179  MerR family transcriptional regulator  64.29 
 
 		 235 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.531372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3466  transcriptional regulator, MerR family  48.33 
 
 		 210 aa  186  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0193337  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1430  transcriptional regulator, MerR family  40.29 
 
 		 210 aa  145  6e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.130007  normal  0.485128 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05650  predicted transcriptional regulator  41.06 
 
 		 217 aa  135  6.0000000000000005e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1748  transcriptional regulator, MerR family  40.28 
 
 		 208 aa  123  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.17422  normal  0.0209835 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2399  transcriptional regulator, MerR family  43.12 
 
 		 209 aa  122  5e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000562399  decreased coverage  0.00011903 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1388  transcriptional regulator, MerR family  36.62 
 
 		 221 aa  116  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.902771  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2692  regulatory protein, MerR  40.74 
 
 		 210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0457116  normal  0.169515 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0557  MerR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000848982 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1547  transcriptional regulator, MerR family  41.55 
 
 		 239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1131  transcriptional regulator, MerR family  43.75 
 
 		 204 aa  106  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0349381  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0017  transcriptional regulator, MerR family  41.1 
 
 		 222 aa  104  8e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0210  putative transcriptional regulator, MerR family  35.68 
 
 		 215 aa  99.4  4e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.024863  hitchhiker  0.00385009 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0102  transcriptional regulator  37.38 
 
 		 210 aa  98.6  6e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.246242  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2613  transcriptional regulator, MerR family  31.48 
 
 		 207 aa  77.4  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00726257 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2904  transcriptional regulator  50.68 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1547  MerR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 242 aa  58.5  0.00000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1566  MerR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 229 aa  57.8  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000201032  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1600  TetR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 288 aa  57.8  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3230  transcriptional regulator, MerR family  34.25 
 
 		 249 aa  57.8  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.129557  normal  0.789887 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1311  MerR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0993  MerR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.335093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4072  transcriptional regulator, MerR family  38.64 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.44146 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1444  transcriptional regulator, MerR family  38.36 
 
 		 243 aa  55.5  0.0000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0102884  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1026  MerR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 140 aa  53.9  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.120689  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3456  MerR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 149 aa  53.9  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0478  regulatory protein MerR  51.02 
 
 		 205 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.608919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3788  MerR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 144 aa  52.4  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.318416  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1790  transcriptional regulator  35.23 
 
 		 141 aa  52  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.269282  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1851  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 162 aa  52  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.138506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2352  MerR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 152 aa  52.4  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0437  MerR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 161 aa  52  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3209  MerR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 138 aa  52  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5351  transcriptional regulator, MerR family  35.29 
 
 		 144 aa  51.6  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0379309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2343  MerR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 146 aa  51.6  0.000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4116  transcriptional regulator, MerR family  35.56 
 
 		 133 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0028  transcriptional regulator, MerR family  45.1 
 
 		 143 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.234521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1336  MerR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 146 aa  51.2  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.200551  normal  0.195494 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2256  MerR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 144 aa  50.4  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0186  MerR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 250 aa  50.4  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0070729  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16670  putative transcriptional regulator CadR  43.14 
 
 		 156 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2399  transcriptional regulator, MerR family  34.88 
 
 		 132 aa  50.1  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000424023  normal  0.796089 
 
 
-
 
NC_004310  BR2017  MerR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 140 aa  49.3  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0123  MerR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 143 aa  49.3  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.329923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0113  MerR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 143 aa  49.3  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1941  MerR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 140 aa  49.3  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1449  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  43.14 
 
 		 156 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5283  transcriptional regulator, MerR family  30.68 
 
 		 143 aa  48.9  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1642  transcriptional regulator, MerR family  30.68 
 
 		 143 aa  48.9  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1241  MerR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 144 aa  48.9  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1678  MerR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 132 aa  48.9  0.00006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2975  MerR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 143 aa  48.5  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.501139  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0151  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  34.25 
 
 		 143 aa  48.5  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.636208  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3979  MerR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 174 aa  48.5  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00581953  normal  0.426596 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3334  MerR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 143 aa  48.5  0.00007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1564  MerR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 143 aa  48.5  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3947  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  34.25 
 
 		 143 aa  48.5  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4020  transcriptional regulator CadR  34.25 
 
 		 143 aa  48.5  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3037  MerR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 143 aa  48.5  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4438  MerR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 143 aa  48.5  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2300  MerR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 134 aa  48.1  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.639917  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4622  transcriptional regulator, MerR family  36.36 
 
 		 144 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.821242  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3291  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  34.25 
 
 		 143 aa  47.8  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2152  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 137 aa  47.8  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.845816  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3339  MerR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 157 aa  48.1  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.88053  normal  0.266963 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1504  regulatory protein, MerR  35.62 
 
 		 141 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5946  MerR family transcriptional regulator PbrR  31.88 
 
 		 145 aa  47.8  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.543608 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2932  MerR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 143 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.327003  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2809  putative transcriptional regulator, MerR family  34.72 
 
 		 186 aa  48.1  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1596  transcriptional regulator, MerR family  43.84 
 
 		 237 aa  47.8  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0123  MerR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 143 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.169164  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4536  transcriptional regulator, MerR family  41.67 
 
 		 146 aa  47.4  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.228678  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35600  predicted transcriptional regulator  41.82 
 
 		 319 aa  47.8  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.172761  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5579  transcriptional regulator, MerR family  36.36 
 
 		 144 aa  47  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3303  MerR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 143 aa  47.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10880  predicted transcriptional regulator  36.11 
 
 		 145 aa  47  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0478  MerR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 146 aa  47.4  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0137  MerR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 143 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3461  transcriptional regulator, MerR family protein  31.82 
 
 		 146 aa  47.4  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4323  MerR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 146 aa  47.4  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0211  MerR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 140 aa  47  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0667  transcriptional regulator, MerR family  39.19 
 
 		 249 aa  47.4  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.201436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1816  transcriptional regulator, MerR family  42 
 
 		 144 aa  47.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.228936 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0920  MerR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 141 aa  47  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.320526  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1155  transcriptional regulator, MerR family  36.23 
 
 		 128 aa  46.6  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0258201  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2686  MerR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 172 aa  46.6  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4217  MerR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 137 aa  46.6  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1402  MerR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 133 aa  46.6  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87391  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1407  MerR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 134 aa  46.6  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1494  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  28.48 
 
 		 165 aa  46.6  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.163233 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4834  transcriptional regulator, MerR family  34.57 
 
 		 144 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3299  MerR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 149 aa  46.2  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1967  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 141 aa  46.2  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.775323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3892  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 149 aa  46.2  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00526993  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1373  MerR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 159 aa  45.8  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.366441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1129  MerR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 131 aa  45.8  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.560457  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2075  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 304 aa  45.8  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.491392 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5322  transcriptional regulator, MerR family  35.82 
 
 		 320 aa  45.8  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4400  transcriptional regulator, MerR family  35.09 
 
 		 303 aa  45.4  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.462564  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>