More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1832 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1832  Signal peptidase I-like protein  100 
 
 
289 aa  582  1.0000000000000001e-165  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0647051 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0984  signal peptidase I  67.23 
 
 
291 aa  392  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.376271 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9015  Signal peptidase I-like protein  75.19 
 
 
269 aa  375  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3418  signal peptidase I  61.38 
 
 
360 aa  356  2.9999999999999997e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0229  signal peptidase I  59.73 
 
 
291 aa  282  5.000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0667  signal peptidase I  53.23 
 
 
338 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.607468  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4002  signal peptidase I  50.96 
 
 
313 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0985  signal peptidase I  52.94 
 
 
209 aa  221  8e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.60179  normal  0.210082 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1556  signal peptidase I  50.38 
 
 
311 aa  216  4e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.329256  normal  0.0665058 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1518  signal peptidase I  49.59 
 
 
469 aa  213  3.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.87268  normal  0.0182553 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1153  signal peptidase I  54.04 
 
 
434 aa  209  5e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.573938  normal  0.0315154 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1200  signal peptidase I  48.88 
 
 
213 aa  208  1e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.167613  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1311  signal peptidase I  48.88 
 
 
213 aa  207  2e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1833  signal peptidase I  51.64 
 
 
220 aa  201  8e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0351614 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11110  signal peptidase I  47.5 
 
 
268 aa  196  4.0000000000000005e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.056722  normal  0.175156 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09800  signal peptidase I  40.83 
 
 
341 aa  195  6e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599041  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3589  signal peptidase I  48.24 
 
 
352 aa  194  2e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1172  signal peptidase I  48.21 
 
 
267 aa  188  1e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1310  signal peptidase I  45.64 
 
 
289 aa  188  1e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5921  signal peptidase I  45.02 
 
 
288 aa  186  3e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0282682  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2188  signal peptidase I  51.57 
 
 
230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0349531  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2186  signal peptidase I  47.62 
 
 
304 aa  184  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.100122  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2187  signal peptidase I  47.06 
 
 
261 aa  183  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0439967  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23700  signal peptidase I  44.98 
 
 
279 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.412828  normal  0.215042 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1199  signal peptidase I  47.3 
 
 
290 aa  183  4.0000000000000006e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.526786  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5920  signal peptidase I  42.21 
 
 
299 aa  180  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0083042  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0990  signal peptidase I  42.8 
 
 
284 aa  178  7e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000142727  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1403  signal peptidase I  48.62 
 
 
219 aa  175  8e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.880656  normal  0.0120837 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2218  signal peptidase I  45.5 
 
 
225 aa  174  9.999999999999999e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000177112 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1475  signal peptidase I  45.33 
 
 
290 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.393591  normal  0.0414721 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3131  signal peptidase I  42.92 
 
 
272 aa  171  1e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000239425  normal  0.113898 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2890  signal peptidase I  47.67 
 
 
251 aa  170  3e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.527092  normal  0.396669 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1517  signal peptidase I  42.8 
 
 
298 aa  168  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489263  normal  0.0166712 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2477  signal peptidase I  42.92 
 
 
304 aa  166  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0881706  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2478  signal peptidase I  44.74 
 
 
225 aa  160  3e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0470838  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1404  signal peptidase I  48.37 
 
 
254 aa  159  5e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.012571 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2535  signal peptidase I  43.23 
 
 
247 aa  157  2e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.699875  normal  0.317865 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3254  signal peptidase I  40.07 
 
 
267 aa  156  4e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10040  signal peptidase I  40.74 
 
 
266 aa  154  2e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.17522  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2217  signal peptidase I  42.41 
 
 
290 aa  153  4e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000553626 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12917  signal peptidase I lepB (leader peptidase I)  42.26 
 
 
294 aa  149  4e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.710177 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2193  signal peptidase I  41.74 
 
 
286 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.107001  normal  0.241649 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0509  signal peptidase I  40.57 
 
 
216 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.82955  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4540  signal peptidase I  42.01 
 
 
243 aa  147  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0613872  normal  0.498524 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1951  signal peptidase I  38.43 
 
 
284 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.743818 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1971  signal peptidase I  38.43 
 
 
284 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0145685  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4169  signal peptidase I  39.63 
 
 
284 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2017  signal peptidase I  38.43 
 
 
284 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.682192 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1023  signal peptidase I  38.5 
 
 
285 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.114866  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09210  signal peptidase I  40.41 
 
 
199 aa  135  9.999999999999999e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0732618  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0349  signal peptidase I  40.39 
 
 
262 aa  135  9.999999999999999e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2091  signal peptidase I  39.73 
 
 
309 aa  133  3e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.367241  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10030  signal peptidase I  38.83 
 
 
192 aa  125  1e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.328546  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09200  signal peptidase I  37.39 
 
 
247 aa  122  9.999999999999999e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.537704  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1631  signal peptidase I  40.53 
 
 
288 aa  118  9.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0972  signal peptidase I  37.79 
 
 
184 aa  118  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000604372  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4691  signal peptidase I  38.24 
 
 
214 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4420  signal peptidase I  40 
 
 
200 aa  112  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4484  signal peptidase I  40 
 
 
200 aa  112  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.130088 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0179  signal peptidase I  36.36 
 
 
342 aa  112  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0662  signal peptidase I  36.84 
 
 
174 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00185516  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1661  signal peptidase I  37 
 
 
220 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0195  signal peptidase I  36.02 
 
 
192 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.597616  normal  0.0662896 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0530  signal peptidase I  35.59 
 
 
197 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0200  signal peptidase I  38.19 
 
 
193 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1226  signal peptidase I  37.1 
 
 
190 aa  107  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1410  signal peptidase I  37.02 
 
 
173 aa  107  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0618865  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0250  signal peptidase I  35.29 
 
 
197 aa  106  4e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.904614  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0931  thylakoidal processing peptidase  34.84 
 
 
190 aa  106  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.778333  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1621  signal peptidase I  34.1 
 
 
216 aa  103  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.617556  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0487  thylakoidal processing peptidase  35.91 
 
 
220 aa  103  5e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0584817 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0536  signal peptidase I  38.94 
 
 
221 aa  103  5e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.844954  normal  0.883395 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1149  Signal peptidase I  34.29 
 
 
181 aa  102  9e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.867763  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2504  signal peptidase I  32.59 
 
 
219 aa  101  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000062636  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1383  signal peptidase I  35.75 
 
 
188 aa  100  3e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00010466  normal  0.416306 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2330  signal peptidase I  33.19 
 
 
221 aa  100  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000787918  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1617  signal peptidase I  34.93 
 
 
219 aa  100  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00286894  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12270  signal peptidase I  34.16 
 
 
173 aa  99.4  7e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000081948  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1355  signal peptidase I  36.59 
 
 
171 aa  99  9e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.58594  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1202  signal peptidase I  33.18 
 
 
186 aa  99  9e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000715638  normal  0.167973 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1094  signal peptidase I  33.48 
 
 
183 aa  98.2  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000597115  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0918  signal peptidase I  35.89 
 
 
271 aa  97.8  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0121  thylakoidal processing peptidase  33.19 
 
 
215 aa  97.4  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2328  signal peptidase I  34.25 
 
 
225 aa  97.4  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05490  signal peptidase I  36.41 
 
 
250 aa  95.9  7e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1532  signal peptidase I  31.67 
 
 
187 aa  95.9  7e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00110114  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3662  signal peptidase I  31.82 
 
 
183 aa  95.5  8e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000188983  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0598  signal peptidase I  32.89 
 
 
214 aa  95.5  8e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1882  signal peptidase I  33.33 
 
 
225 aa  95.5  9e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0715  signal peptidase I  33.18 
 
 
233 aa  95.1  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00052809  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05151  Signal peptidase I  33.82 
 
 
238 aa  94.7  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.715932  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2491  signal peptidase I  32.27 
 
 
183 aa  94.7  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000161769  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1659  peptidase S26A, signal peptidase I  33.48 
 
 
221 aa  94  3e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0699  peptidase S26A, signal peptidase I  32.03 
 
 
235 aa  94  3e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0691424  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2049  signal peptidase I  30.66 
 
 
185 aa  94  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000784744  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3852  signal peptidase I S  30.91 
 
 
183 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.78284e-62 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11010  signal peptidase I  35.29 
 
 
189 aa  93.2  4e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0396418  hitchhiker  0.0000000342389 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2079  thylakoidal processing peptidase  38.02 
 
 
188 aa  92.8  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2249  signal peptidase I  35.53 
 
 
199 aa  93.2  5e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3886  signal peptidase I S  30.91 
 
 
183 aa  92.8  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000194308  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>