146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1777 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1777  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  359  1e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.354573 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0784  transcriptional regulator, PadR-like family  30.65 
 
 		 222 aa  80.1  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4202  transcriptional regulator, PadR-like family  35.56 
 
 		 197 aa  78.2  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.457407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1531  transcriptional regulator PadR family protein  32.96 
 
 		 218 aa  77  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4876  transcriptional regulator, PadR-like family  30.73 
 
 		 226 aa  74.7  0.0000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1446  transcriptional regulator, PadR-like family  31.49 
 
 		 208 aa  74.3  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1537  PadR-like family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 181 aa  73.2  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00708005 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0117  PadR family transcriptional regulator  32 
 
 		 204 aa  70.9  0.000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.219562  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0184  PadR-like family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 179 aa  67.8  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0503  transcriptional regulator, PadR-like family  28.17 
 
 		 179 aa  64.7  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100232  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1578  PadR-like family transcriptional regulator  22.67 
 
 		 185 aa  64.3  0.0000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.59882  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0876  PadR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 179 aa  63.9  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.184962  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1786  transcriptional regulator, PadR-like family  24.58 
 
 		 186 aa  63.2  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.335801 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1727  PadR-like family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 179 aa  60.1  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.765397 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4677  PadR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3222  transcriptional regulator, PadR-like family  29.51 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1163  transcriptional regulator, PadR-like family  28.37 
 
 		 191 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.984047 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0098  transcriptional regulator, PadR family  26.74 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.846374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4747  transcriptional regulator PadR family protein  33.64 
 
 		 252 aa  55.5  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10046  hypothetical protein  33.64 
 
 		 180 aa  55.1  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1887  transcriptional regulator PadR family protein  22.09 
 
 		 232 aa  54.7  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1330  PadR-like family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 240 aa  54.3  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.855689  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1910  PadR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 174 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4755  transcriptional regulator, PadR-like family  24.42 
 
 		 196 aa  53.9  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.208471  hitchhiker  0.00173659 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0796  transcriptional regulator, PadR-like family  40.51 
 
 		 195 aa  53.9  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3110  transcriptional regulator, PadR-like family  24.14 
 
 		 325 aa  52.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000271029  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3045  transcriptional regulator, PadR-like family  31.78 
 
 		 187 aa  53.5  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0118397 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1669  PadR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 179 aa  52.4  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.107785  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1645  transcriptional regulator  35.8 
 
 		 179 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1318  transcriptional regulator, PadR-like family  32.77 
 
 		 185 aa  52.8  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1946  transcriptional regulator, PadR family  35.8 
 
 		 179 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2053  transcriptional regulator, PadR-like family  36.14 
 
 		 180 aa  52.8  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000846941 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5462  PadR-like family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 249 aa  52  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802601 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3512  transcriptional repressor PadR  34.57 
 
 		 179 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3185  transcriptional regulator  21.74 
 
 		 193 aa  51.6  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0506611  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3170  transcriptional regulator, PadR family domain protein  21.74 
 
 		 193 aa  52  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8023  transcriptional regulator protein-like protein  40.51 
 
 		 178 aa  51.6  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2526  PadR-like family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 183 aa  50.4  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0713427  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8052  transcriptional regulator protein-like protein  35.62 
 
 		 175 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440354  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1345  transcriptional regulator, PadR-like family  39.44 
 
 		 190 aa  50.8  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0813  transcriptional regulator, PadR-like family  29.06 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3006  PadR family transcriptional regulator  23.84 
 
 		 187 aa  50.1  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.536861  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6039  PadR-like family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 181 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.258534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1133  transcriptional repressor PadR  23.95 
 
 		 185 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.53987  normal  0.874315 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2974  PadR family transcriptional regulator  23.84 
 
 		 213 aa  49.3  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.412017  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0152  putative PadR transcriptional regulator  23.84 
 
 		 218 aa  49.3  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.762671  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3335  PadR family transcriptional regulator  23.84 
 
 		 213 aa  49.3  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1565  PadR family transcriptional regulator  23.84 
 
 		 213 aa  49.3  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3948  PadR family transcriptional regulator  23.84 
 
 		 213 aa  49.3  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4021  PadR family transcriptional regulator  23.84 
 
 		 213 aa  49.3  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3036  PadR family transcriptional regulator  23.84 
 
 		 213 aa  49.3  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0172  PadR-like family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 242 aa  48.9  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.786766 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00046  transcriptional regulator  25.99 
 
 		 201 aa  49.3  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1076  PadR-like family transcriptional regulator  40 
 
 		 182 aa  49.3  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.973287 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4125  hypothetical protein  25.83 
 
 		 185 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0396692  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2019  transcriptional regulator, PadR-like family  24.39 
 
 		 160 aa  48.9  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.41981 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3759  transcriptional regulator  25 
 
 		 185 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.779947  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4106  transcriptional repressor PadR  25 
 
 		 185 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.322832  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1331  PadR-like family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 187 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.673499  normal  0.512456 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2108  transcriptional regulator, PadR-like family  29.47 
 
 		 251 aa  48.5  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.48804 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3835  transcriptional regulator, PadR-like family  30.16 
 
 		 263 aa  48.1  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0380451  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0838  transcriptional regulator, PadR-like family  24.43 
 
 		 305 aa  47.8  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37830  transcriptional regulator, PadR family  30.47 
 
 		 227 aa  47.8  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3830  PadR-like family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 185 aa  47.8  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.037852  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1257  transcriptional regulator  38.96 
 
 		 174 aa  47.8  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.287326 
 
 
-
 
NC_003296  RS05461  hypothetical protein  25.84 
 
 		 178 aa  47.4  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.797488  normal  0.144264 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4892  PadR family transcriptional regulator  23.31 
 
 		 218 aa  47  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0079  PadR-like family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 184 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3549  transcriptional regulator, PadR-like family  24.29 
 
 		 232 aa  47.4  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.353373 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3223  transcriptional regulator, PadR-like family  24.02 
 
 		 215 aa  47  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.465508 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4052  hypothetical protein  25 
 
 		 185 aa  47  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166884  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4870  PadR family transcriptional regulator  35 
 
 		 173 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4959  PadR family transcriptional regulator  35 
 
 		 173 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5461  PadR-like family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 175 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399504 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5238  PadR family transcriptional regulator  35 
 
 		 173 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0868  PadR-like family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 181 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525718  normal  0.842124 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0144  transcriptional regulator, PadR-like family  30.77 
 
 		 179 aa  46.6  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0154267  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4818  transcriptional regulator, PadR-like family  29.34 
 
 		 179 aa  46.6  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0225  transcriptional regulator, PadR-like family  37.04 
 
 		 187 aa  46.6  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3741  transcriptional regulator, PadR-like family  29.34 
 
 		 179 aa  46.6  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5920  transcriptional regulator, PadR-like family  34.15 
 
 		 198 aa  46.6  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3292  PadR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 210 aa  46.2  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1748  transcriptional regulator, PadR-like family  33.7 
 
 		 217 aa  45.8  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000246986  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3472  transcriptional regulator, PadR-like family  31.62 
 
 		 174 aa  45.8  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.287641  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0957  transcriptional regulator, PadR-like family  26.29 
 
 		 204 aa  46.2  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0586102  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4102  transcriptional regulator, PadR-like family  36.36 
 
 		 277 aa  45.8  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.615501 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2527  transcriptional regulator, PadR-like family  28.46 
 
 		 202 aa  46.2  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3510  transcriptional regulator, PadR-like family  31.39 
 
 		 198 aa  45.4  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7032  transcriptional regulator, PadR-like family  30.36 
 
 		 181 aa  45.4  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5903  transcriptional regulator, PadR-like family  36 
 
 		 316 aa  45.1  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33122  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0887  transcriptional regulator, PadR-like family  22.35 
 
 		 206 aa  44.7  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.84074  normal  0.410025 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3967  PadR-like family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 152 aa  44.7  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1365  transcriptional regulator, PadR-like family  36.84 
 
 		 183 aa  44.7  0.0006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3911  hypothetical protein  24.17 
 
 		 185 aa  44.7  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000121326  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3743  transcriptional regulator  24.17 
 
 		 185 aa  44.7  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000898433  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4217  hypothetical protein  24.17 
 
 		 185 aa  44.7  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000647114  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2223  hypothetical protein  25.42 
 
 		 179 aa  44.7  0.0007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000756416  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4019  hypothetical protein  24.17 
 
 		 185 aa  44.7  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1415  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 194 aa  44.7  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0975835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6747  transcriptional regulator protein-like protein  29.03 
 
 		 250 aa  44.3  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>