More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1371 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1371  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  100 
 
 
279 aa  550  1e-155  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0742  type 11 methyltransferase  77.56 
 
 
266 aa  390  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.166057 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4270  methyltransferase type 11  35 
 
 
279 aa  75.9  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0237  Methyltransferase type 11  26.61 
 
 
248 aa  75.5  0.0000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6874  Methyltransferase type 11  35.03 
 
 
260 aa  72.8  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.413969  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3989  Methyltransferase type 11  37.23 
 
 
249 aa  71.6  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.169635  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1474  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  36.77 
 
 
255 aa  68.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.760771  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0420  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 
335 aa  68.9  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.849842 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3889  methyltransferase type 11  30.3 
 
 
281 aa  67.4  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.972662 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1607  Methyltransferase type 11  37.36 
 
 
238 aa  67  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0427  methyltransferase type 11  37.31 
 
 
255 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0100064  normal  0.299487 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1168  Methyltransferase type 11  36.51 
 
 
267 aa  63.9  0.000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0849  methyltransferase type 11  29.08 
 
 
283 aa  63.2  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.712211  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4218  methyltransferase type 11  40.2 
 
 
261 aa  62.8  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3941  methyltransferase type 11  32.85 
 
 
237 aa  63.2  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  39.42 
 
 
225 aa  62.8  0.000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0039  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
309 aa  62.8  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0241  methyltransferase type 11  32.79 
 
 
255 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.114576 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  38.83 
 
 
194 aa  62.8  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.33 
 
 
238 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.33 
 
 
236 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0189  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  27.33 
 
 
275 aa  61.6  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1103  methyltransferase type 11  34.04 
 
 
237 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292057  hitchhiker  0.000229506 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4266  methyltransferase type 11  38.33 
 
 
256 aa  61.2  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.985163  normal  0.26538 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3425  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  31.94 
 
 
258 aa  61.2  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129288 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  29.47 
 
 
258 aa  60.5  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4394  methyltransferase type 11  35.11 
 
 
265 aa  60.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0807  type 11 methyltransferase  35 
 
 
245 aa  60.5  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.887141  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0208  methyltransferase type 11  37.78 
 
 
252 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2830  methylase  32.26 
 
 
238 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.036188  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02290  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  43.86 
 
 
209 aa  60.1  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.457573  normal  0.610905 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  25.7 
 
 
293 aa  60.1  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  36.45 
 
 
258 aa  59.7  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1285  hypothetical protein  38.71 
 
 
249 aa  59.3  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2850  methylase  31.18 
 
 
235 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00782865  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2481  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  29.32 
 
 
235 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.817194 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0264  Methyltransferase type 11  34.06 
 
 
252 aa  58.5  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.767056 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2546  Methyltransferase type 11  33.98 
 
 
244 aa  58.9  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0272722 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2809  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  32.32 
 
 
235 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0218  methyltransferase type 11  38.41 
 
 
252 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.679298  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1843  Methyltransferase type 11  36.22 
 
 
209 aa  58.5  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1127  Methyltransferase type 11  35.24 
 
 
246 aa  58.5  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0228  methyltransferase type 11  38.41 
 
 
252 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.237973  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  34.23 
 
 
1106 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.09 
 
 
201 aa  57.8  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10226  methyltransferase  33.33 
 
 
254 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  36.54 
 
 
240 aa  57.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3701  Methyltransferase type 11  35.05 
 
 
242 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.260893 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4778  Methyltransferase type 11  35.05 
 
 
242 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4696  methyltransferase type 11  38.38 
 
 
256 aa  57  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.219462 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2999  methyltransferase type 11  32.59 
 
 
246 aa  57  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0921858  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2514  methyltransferase type 11  34.04 
 
 
359 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.775917 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3743  methyltransferase type 11  30.88 
 
 
331 aa  57  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0377  Methyltransferase type 11  32.35 
 
 
225 aa  56.6  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.790599  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13046  hypothetical protein  36.7 
 
 
274 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0765338  hitchhiker  0.00655804 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5589  Methyltransferase type 11  37.62 
 
 
275 aa  56.2  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  33.08 
 
 
305 aa  56.2  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  25.56 
 
 
213 aa  56.2  0.0000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  38.46 
 
 
634 aa  55.8  0.0000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3047  Methyltransferase type 11  33.66 
 
 
244 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0374295  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2465  hypothetical protein  35.04 
 
 
246 aa  55.5  0.0000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.16743  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  33.98 
 
 
200 aa  55.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0484  putative methyltransferase  31.86 
 
 
240 aa  55.5  0.0000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  33.98 
 
 
200 aa  55.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.21 
 
 
236 aa  55.5  0.0000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  37.62 
 
 
215 aa  55.1  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0883  Methyltransferase type 11  34.88 
 
 
282 aa  55.1  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.049134 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1664  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.58 
 
 
230 aa  55.5  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  35.2 
 
 
296 aa  55.1  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1968  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.14 
 
 
698 aa  55.1  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0944  hypothetical protein  34 
 
 
242 aa  55.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.162173  normal  0.410696 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2762  Methyltransferase type 11  38.38 
 
 
265 aa  55.1  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.179649  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  37.14 
 
 
236 aa  55.1  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0272  Methyltransferase type 11  35.21 
 
 
258 aa  55.5  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4077  hypothetical protein  22.99 
 
 
229 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0194  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.27 
 
 
253 aa  54.3  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.920302  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  32.67 
 
 
199 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0994  methyltransferase type 11  29.29 
 
 
245 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.295346  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2596  biotin biosynthesis protein bioC  32.99 
 
 
265 aa  53.9  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.093326  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1658  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.95 
 
 
230 aa  53.5  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0427  hypothetical protein  36.84 
 
 
244 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2110  methyltransferase type 11  36.73 
 
 
266 aa  53.9  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.594236 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1690  Methyltransferase type 11  34.91 
 
 
285 aa  53.9  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0193071 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  38.24 
 
 
222 aa  53.5  0.000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1592  methyltransferase type 11  31.78 
 
 
225 aa  53.1  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.367784  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00761  hypothetical protein  33.67 
 
 
246 aa  53.1  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286204  normal  0.107855 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1349  methyltransferase type 11  37.96 
 
 
581 aa  53.1  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00108025  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0858  biotin synthesis protein BioC  34.02 
 
 
275 aa  53.1  0.000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3858  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  28.76 
 
 
260 aa  53.1  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000301378 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0312  Methyltransferase type 11  35.77 
 
 
232 aa  53.1  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  35.42 
 
 
275 aa  53.1  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1224  methyltransferase type 11  31.93 
 
 
206 aa  52.8  0.000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  34 
 
 
205 aa  52.8  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4427  methyltransferase type 11  36.36 
 
 
273 aa  52.8  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  38.04 
 
 
268 aa  52.8  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4260  methyltransferase type 11  36.04 
 
 
261 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0981  methyltransferase type 11  39.85 
 
 
229 aa  52.8  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1921  23S rRNA methyltransferase A  36.36 
 
 
276 aa  52.8  0.000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000726719  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2386  Methyltransferase type 11  32.58 
 
 
301 aa  52.4  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000258424  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1264  hypothetical protein  22.99 
 
 
229 aa  52.4  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>