145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1928 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_1928  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  100 
 
 		 161 aa  330  6e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.439593  hitchhiker  0.00175211 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1893  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  73.79 
 
 		 159 aa  234  3e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2073  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.163094  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18410  predicted transcriptional regulator  29.87 
 
 		 152 aa  67  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2093  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 144 aa  62  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0872269  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0676  hypothetical protein  29.77 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1606  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  31.43 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1726  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  29.69 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.992938 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2863  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26060  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  31.88 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.523636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1756  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4634  rrf2 family protein  29.41 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4403  rrf2 family protein  29.41 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4243  Rrf2 family protein; transcriptional regulator  29.41 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4255  Rrf2 family protein; transcriptional regulator  29.41 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4743  rrf2 family protein  29.41 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4636  rrf2 family protein  29.41 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0619  rrf2 family protein  29.41 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4616  rrf2 family protein  29.41 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4620  rrf2 family protein  29.41 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00405  hypothetical protein  30.99 
 
 		 143 aa  57  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00113675  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2816  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  30 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1746  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.488716  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4003  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 177 aa  55.1  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3208  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4336  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2124  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0939  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  30.28 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1447  RRF2 family protein  30.37 
 
 		 138 aa  52.8  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0587227  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1445  iron-responsive transcriptional regulator  34.78 
 
 		 153 aa  52.4  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0328  iron-responsive transcriptional regulator  36.56 
 
 		 154 aa  52  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.069835 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4329  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 147 aa  51.2  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5965  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  30.7 
 
 		 151 aa  51.2  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0284344 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1784  Rrf2 family protein  31.88 
 
 		 153 aa  50.8  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.121065  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1505  Rrf2 family protein  31.88 
 
 		 153 aa  50.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.080544  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1174  Rrf2 family protein  31.88 
 
 		 153 aa  50.8  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.246229  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1372  putative transcriptional regulator  31.88 
 
 		 153 aa  50.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.102116  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1376  putative transcriptional regulator  31.88 
 
 		 153 aa  50.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.135782  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0457  Rrf2 family protein  31.88 
 
 		 153 aa  50.8  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1422  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 156 aa  50.8  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.968203 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0801  hypothetical protein  27.34 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2649  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  28.87 
 
 		 151 aa  50.4  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000442413  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2862  Rrf2 family protein  30.94 
 
 		 154 aa  50.1  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.246618  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1056  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0389  iron-responsive transcriptional regulator  34.04 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00187363  normal  0.229909 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2417  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.229432 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0695  Rrf2 family protein  33.33 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000561607  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3617  iron-responsive transcriptional regulator  33.7 
 
 		 153 aa  49.7  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.973931  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2098  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 151 aa  49.7  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.607265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0725  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30 
 
 		 151 aa  48.5  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.241075  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1205  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30 
 
 		 151 aa  48.5  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2165  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 152 aa  48.5  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00710337  normal  0.480622 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3442  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  41.07 
 
 		 152 aa  48.1  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.11487  hitchhiker  0.00712317 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20720  rrf2 family protein, putative transcriptional regulator  32.93 
 
 		 169 aa  48.1  0.00006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0421  iron-responsive transcriptional regulator  32.98 
 
 		 160 aa  47.8  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0531604  hitchhiker  0.00267682 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1088  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 151 aa  47.8  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.683076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0838  iron-responsive transcriptional regulator  34.04 
 
 		 156 aa  47.8  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1088  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 151 aa  47.8  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3037  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  28.17 
 
 		 140 aa  47.8  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0850205  normal  0.0637493 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7110  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  29.2 
 
 		 151 aa  47.4  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147621  normal  0.1046 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4541  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 161 aa  47.4  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.417251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1178  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 151 aa  47.4  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000716661  normal  0.224139 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0743  hypothetical protein  29.91 
 
 		 150 aa  47.4  0.00009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.798727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3895  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  45.61 
 
 		 151 aa  47.4  0.00009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.146711  normal  0.812213 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1800  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 150 aa  47.4  0.00009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0562  iron-responsive transcriptional regulator  31.52 
 
 		 153 aa  46.6  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.23721  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2051  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 138 aa  47  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.482177 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3492  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 150 aa  47  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0528  iron-responsive transcriptional regulator  31.52 
 
 		 153 aa  47  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0848  transcriptional regulator superfamily  27.41 
 
 		 137 aa  47  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.264832  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2769  transcriptional repressor NsrR  30.7 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4313  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30 
 
 		 151 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000750143  normal  0.208214 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2585  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 171 aa  46.2  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.867635 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1225  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 148 aa  46.2  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0259707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1690  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 147 aa  46.6  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0968234  normal  0.880736 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0970  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 154 aa  46.6  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.794962 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2591  transcriptional regulator  27.36 
 
 		 156 aa  46.2  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374583 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3647  transcriptional repressor NsrR  28.57 
 
 		 141 aa  45.4  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4008  protein of unknown function UPF0074  27.61 
 
 		 187 aa  45.4  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3286  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  28.43 
 
 		 159 aa  45.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3608  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  31.46 
 
 		 159 aa  45.4  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0693  transcriptional repressor NsrR  28.57 
 
 		 154 aa  45.1  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2591  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  29.52 
 
 		 150 aa  45.1  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3792  transcriptional repressor NsrR  28.57 
 
 		 154 aa  45.1  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0680  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  25 
 
 		 140 aa  45.1  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00302729  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2406  hypothetical protein  32.37 
 
 		 148 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.888596  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2401  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 152 aa  44.7  0.0006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1268  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  31.82 
 
 		 137 aa  44.3  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000462831  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0854  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 151 aa  44.3  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0962468 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0579  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 156 aa  44.3  0.0007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000125855  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2975  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 184 aa  44.3  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.672436  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3015  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  31.82 
 
 		 136 aa  44.3  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0320  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 180 aa  44.3  0.0007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0695521  normal  0.0912799 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1478  transcriptional regulator family protein  26.92 
 
 		 172 aa  44.3  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113614  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0351  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  25.18 
 
 		 137 aa  43.9  0.0008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000160691  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1736  RRF2 family protein  26.32 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.582231  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1931  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000501375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1917  rrf2 family protein  26.32 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0431103  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3572  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 159 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0421402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3948  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.915994  normal  0.554541 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>