More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3576 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_3576  histidine kinase A domain-containing protein  100 
 
 		 406 aa  845    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0692  histidine kinase A domain-containing protein  79.95 
 
 		 404 aa  681    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4327  histidine kinase A domain-containing protein  53.27 
 
 		 415 aa  448  1e-125  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3797  ATPase domain-containing protein  53.04 
 
 		 413 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4195  histidine kinase A domain-containing protein  53.27 
 
 		 415 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4622  sensor histidine kinase  52.3 
 
 		 413 aa  437  1e-121  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4006  histidine kinase A domain-containing protein  56.07 
 
 		 413 aa  437  1e-121  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1973  histidine kinase  27.64 
 
 		 422 aa  130  6e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.73664 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3675  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 418 aa  123  5e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2061  putative two-component sensor  29.14 
 
 		 431 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.574753  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2252  histidine kinase  28.47 
 
 		 410 aa  109  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2810  histidine kinase  30.04 
 
 		 425 aa  100  5e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24340  putative two-component sensor  31.72 
 
 		 431 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.166321  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2523  sensor histidine kinase  25.97 
 
 		 435 aa  95.1  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.311676  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4638  sensor histidine kinase  28.14 
 
 		 430 aa  89.7  9e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2297  Signal transduction histidine kinase-like  24.8 
 
 		 446 aa  88.2  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0247505  hitchhiker  0.000082991 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3318  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.47 
 
 		 420 aa  87  5e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3439  Signal transduction histidine kinase-like  25.23 
 
 		 424 aa  85.1  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000359307 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4253  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.01 
 
 		 422 aa  84  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000017519 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05571  sensory transduction protein kinase  27.88 
 
 		 413 aa  84.3  0.000000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0711  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.44 
 
 		 422 aa  84  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353371 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2374  sensor histidine kinase  27.21 
 
 		 434 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.171494  normal  0.151024 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2720  sensor histidine kinase  24.5 
 
 		 423 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.894758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003061  two-component system sensor protein  26.67 
 
 		 429 aa  79.7  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04467  two-component system (histidine kinase) sensor protein requried for AvrXa21 activity H (raxH)  26.64 
 
 		 420 aa  77.4  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02793  histidine kinase  25.38 
 
 		 426 aa  77.4  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001594  two-component system sensor protein  27.59 
 
 		 413 aa  77  0.0000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000479105  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0334  histidine kinase  26.51 
 
 		 418 aa  76.3  0.0000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000559138  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2444  Signal transduction histidine kinase-like  24.19 
 
 		 455 aa  75.9  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.215818 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2642  sensor histidine kinase  26.28 
 
 		 416 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.244154  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6258  two component sensor kinase  25.09 
 
 		 440 aa  75.5  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0553015  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1725  two component sensor histidine kinase  24.64 
 
 		 420 aa  74.3  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000120171  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2991  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.93 
 
 		 429 aa  73.6  0.000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0597631 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04658  two-component system sensor protein  22.1 
 
 		 405 aa  72.8  0.000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0314695  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2189  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.72 
 
 		 454 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1163  Signal transduction histidine kinase sensor  22.19 
 
 		 437 aa  70.9  0.00000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3631  histidine kinase  23.79 
 
 		 449 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17790  sensory histidine protein kinase, two-component, ColS  26.1 
 
 		 421 aa  70.1  0.00000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.334576  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1243  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  21.13 
 
 		 438 aa  70.1  0.00000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.472913 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2660  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.4 
 
 		 421 aa  68.9  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.204639 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1866  sensor histidine kinase  20.31 
 
 		 421 aa  68.2  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.506111  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  26.05 
 
 		 477 aa  68.2  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3010  histidine kinase A domain-containing protein  27.06 
 
 		 420 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.728657  normal  0.501785 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7593  histidine kinase  24.9 
 
 		 608 aa  67  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0630387 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3180  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.07 
 
 		 455 aa  66.6  0.0000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0840  Signal transduction histidine kinase-like protein  23.94 
 
 		 370 aa  66.6  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2105  two-component system, sensor protein  24.27 
 
 		 445 aa  65.5  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1930  histidine kinase  27.9 
 
 		 434 aa  64.7  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.824341  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0002  ATP-binding region ATPase domain protein  25.24 
 
 		 592 aa  64.7  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2198  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.99 
 
 		 467 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2222  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.81 
 
 		 487 aa  64.7  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.225964  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2130  histidine kinase  25.93 
 
 		 411 aa  64.3  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2477  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.28 
 
 		 422 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.339832  normal  0.341718 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24130  signal transduction histidine kinase  24.11 
 
 		 362 aa  64.3  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0242619  decreased coverage  0.00839844 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.56 
 
 		 464 aa  63.5  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.093144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02305  two-component system sensor protein  25.42 
 
 		 418 aa  63.5  0.000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.61 
 
 		 433 aa  63.2  0.000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1098  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.7 
 
 		 442 aa  62.8  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.524433 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2610  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  24.09 
 
 		 421 aa  62.8  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.69998 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4497  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  21.39 
 
 		 424 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000269755 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2595  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.02 
 
 		 441 aa  62.8  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.580815  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0619  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.42 
 
 		 430 aa  62.4  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.869359  normal  0.27324 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1046  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.44 
 
 		 444 aa  62.4  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1030  histidine kinase  27.95 
 
 		 415 aa  62  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.836788 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4069  sensor histidine kinase  24.11 
 
 		 429 aa  62  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00769633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0904  sensor histidine kinase  24.22 
 
 		 454 aa  62  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.616336  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3964  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.7 
 
 		 444 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.415671  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4943  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.4 
 
 		 378 aa  62  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4373  sensor histidine kinase ColS  24.55 
 
 		 429 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2065  putative periplasmic sensor signal transduction histidine kinase, QseC  23.7 
 
 		 467 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.278967 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6232  histidine kinase  23.83 
 
 		 459 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.44 
 
 		 445 aa  60.8  0.00000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0159551  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4485  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.21 
 
 		 436 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.960944 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0941  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.21 
 
 		 436 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0902  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.21 
 
 		 447 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0417  putative sensor kinase protein  25.91 
 
 		 391 aa  60.5  0.00000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4951  putative two-component sensor  21.62 
 
 		 426 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0818  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.93 
 
 		 413 aa  60.1  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.423553  normal  0.73839 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3121  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.38 
 
 		 457 aa  60.1  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.933036  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0970  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.85 
 
 		 436 aa  59.7  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0878793 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56940  putative two-component sensor  24.64 
 
 		 426 aa  60.1  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0259  Signal transduction histidine kinase-like protein  24.88 
 
 		 460 aa  59.3  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0785  sensor histidine kinase  23.95 
 
 		 453 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.190623  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0558  sensor histidine kinase  23.95 
 
 		 453 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1623  sensor histidine kinase  23.95 
 
 		 453 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0767878  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6107  two component sensor kinase  24.14 
 
 		 467 aa  59.3  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6028  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.8 
 
 		 450 aa  59.3  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0315018 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0784  histidine kinase  20.33 
 
 		 408 aa  59.3  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0431535  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1076  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.19 
 
 		 444 aa  58.9  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.72241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2073  sensor histidine kinase  23.95 
 
 		 453 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0670  sensor histidine kinase  23.95 
 
 		 453 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.539179  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1009  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23 
 
 		 455 aa  59.3  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0251  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.53 
 
 		 449 aa  59.7  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00216243  hitchhiker  0.000495811 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0700  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  25.91 
 
 		 433 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0653  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.81 
 
 		 423 aa  58.5  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3770  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.22 
 
 		 449 aa  58.9  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00735278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0023  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.96 
 
 		 455 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2626  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.32 
 
 		 406 aa  58.9  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.640199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0489  sensor histidine kinase  23.21 
 
 		 722 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.620999  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0496  two component sensor histidine kinase  23.71 
 
 		 481 aa  57.8  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>