90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3081 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_3081  hypothetical protein  100 
 
 		 304 aa  597  1e-169  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3584  hypothetical protein  79.64 
 
 		 306 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0998298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3410  hypothetical protein  79.28 
 
 		 307 aa  435  1e-121  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.708924  hitchhiker  0.00480919 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2845  hypothetical protein  82.5 
 
 		 308 aa  433  1e-120  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.244787 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3538  hypothetical protein  70.9 
 
 		 308 aa  411  1e-114  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.149446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1041  protein of unknown function DUF6 transmembrane  70.9 
 
 		 308 aa  410  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0132992  hitchhiker  0.00000125365 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2972  hypothetical protein  70.43 
 
 		 311 aa  409  1e-113  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3320  hypothetical protein  70.9 
 
 		 308 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.507234  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3412  hypothetical protein  70.23 
 
 		 308 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000352453  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1125  integral membrane domain-containing protein  69.57 
 
 		 306 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0956  hypothetical protein  70.57 
 
 		 306 aa  397  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0958  hypothetical protein  70.57 
 
 		 306 aa  397  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.62942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0994  hypothetical protein  70.23 
 
 		 306 aa  395  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0772792  normal  0.692299 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2512  integral membrane domain-containing protein  71.92 
 
 		 303 aa  389  1e-107  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.106417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001929  permease  52.78 
 
 		 302 aa  280  3e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00560  permease  51.33 
 
 		 302 aa  277  2e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2825  hypothetical protein  51.55 
 
 		 301 aa  267  1e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.693217  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2435  hypothetical protein  50.83 
 
 		 303 aa  267  2e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2994  integral membrane protein  48.46 
 
 		 303 aa  264  1e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0384  hypothetical protein  49.31 
 
 		 302 aa  256  4e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.128804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1143  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.71 
 
 		 292 aa  241  7.999999999999999e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0271281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3467  hypothetical protein  41.58 
 
 		 298 aa  241  1e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0804  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.79 
 
 		 299 aa  225  9e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.297153  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1802  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.55 
 
 		 365 aa  223  2e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0303  hypothetical protein  47.37 
 
 		 287 aa  217  2e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.193883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2587  hypothetical protein  27.69 
 
 		 284 aa  60.5  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0304  hypothetical protein  27.31 
 
 		 290 aa  57.4  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.219486  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.1 
 
 		 295 aa  57  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.151305 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5123  hypothetical protein  26.34 
 
 		 304 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.142445  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.45 
 
 		 296 aa  53.1  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0848809 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3079  hypothetical protein  26.86 
 
 		 296 aa  52.4  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.334626  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3690  hypothetical protein  25.52 
 
 		 288 aa  52  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3144  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.86 
 
 		 281 aa  51.2  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000163961  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4998  hypothetical protein  26.98 
 
 		 300 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.390809  normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01032  Transporter involved in threonine and homoserine efflux  23.87 
 
 		 290 aa  51.2  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.614417  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4039  Premeases of the drub/metabolic transporter protein  29.14 
 
 		 294 aa  50.8  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1734  drug/metabolite exporter family protein  25.26 
 
 		 301 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000184981  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1777  EamA family protein  25.26 
 
 		 301 aa  50.1  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00180942  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1951  transporter, EamA family  25.26 
 
 		 301 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000452263 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1756  drug/metabolite exporter family protein  25.26 
 
 		 301 aa  50.1  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1915  eama family protein  25.26 
 
 		 301 aa  50.1  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0191779  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0506  hypothetical protein  26.48 
 
 		 290 aa  49.3  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0252698 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2060  hypothetical protein  28.2 
 
 		 294 aa  49.3  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  hitchhiker  0.00448812 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1919  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  24.03 
 
 		 301 aa  49.3  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.208347  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1789  hypothetical protein  26.09 
 
 		 301 aa  48.9  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000223486  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3424  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  24.74 
 
 		 301 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000803671 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3580  hypothetical protein  25.42 
 
 		 294 aa  48.5  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.122357  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5404  putative transporter  30.37 
 
 		 301 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.532448 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0450  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25 
 
 		 294 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.267531  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1343  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.08 
 
 		 294 aa  48.1  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4391  putative transporter  30.37 
 
 		 301 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.568191 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03778  hypothetical protein  30.37 
 
 		 301 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4072  hypothetical protein  30.37 
 
 		 301 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4042  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.37 
 
 		 301 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4367  hypothetical protein  25.36 
 
 		 318 aa  47.4  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4177  putative transporter  30.37 
 
 		 301 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03829  predicted permease  30.37 
 
 		 301 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1999  EamA family protein  23.67 
 
 		 301 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.099067  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5668  hypothetical protein  25 
 
 		 297 aa  47.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4483  putative transporter  30.37 
 
 		 301 aa  47  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001333  hypothetical protein  28.21 
 
 		 301 aa  47  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000132961  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4430  putative transporter  30.41 
 
 		 304 aa  47  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0310  integral membrane protein  27.27 
 
 		 306 aa  46.6  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3062  hypothetical protein  24.62 
 
 		 288 aa  46.6  0.0006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.161297  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2020  transporter, EamA family  23.9 
 
 		 283 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000240822  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4189  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.38 
 
 		 313 aa  45.4  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0732  hypothetical protein  25.7 
 
 		 343 aa  45.4  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0646  hypothetical protein  24.84 
 
 		 290 aa  44.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1925  hypothetical protein  28.12 
 
 		 315 aa  44.3  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4560  hypothetical protein  24.1 
 
 		 312 aa  44.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00353788  normal  0.103037 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0857  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.81 
 
 		 285 aa  45.1  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  4.28203e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0694  hypothetical protein  26.06 
 
 		 313 aa  44.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0080  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.61 
 
 		 328 aa  44.3  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.109193 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05223  hypothetical protein  26.15 
 
 		 305 aa  44.3  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4102  hypothetical protein  32.82 
 
 		 302 aa  44.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.576037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6084  hypothetical protein  25.2 
 
 		 307 aa  44.3  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2554  hypothetical protein  27.17 
 
 		 296 aa  44.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6429  hypothetical protein  25.2 
 
 		 307 aa  44.3  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2084  hypothetical protein  22.79 
 
 		 307 aa  43.9  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1011  hypothetical protein  22.63 
 
 		 298 aa  44.3  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0158427  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0907  hypothetical protein  26.57 
 
 		 307 aa  43.5  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4075  hypothetical protein  26.74 
 
 		 294 aa  43.5  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  24.09 
 
 		 313 aa  43.1  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  22.7 
 
 		 305 aa  43.1  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1560  hypothetical protein  27.78 
 
 		 282 aa  43.1  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112464 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0163  hypothetical protein  25.34 
 
 		 317 aa  42.7  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.397417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0579  hypothetical protein  27.08 
 
 		 294 aa  42.7  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2944  hypothetical protein  29.94 
 
 		 311 aa  42.7  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0954249 
 
 
-
 
NC_004310  BR1001  hypothetical protein  22.9 
 
 		 307 aa  42.4  0.009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.42 
 
 		 300 aa  42.4  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124016  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>