96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4879 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4879  ANTAR domain-containing protein  100 
 
 		 230 aa  458  9.999999999999999e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.450036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3147  hypothetical protein  41.82 
 
 		 224 aa  136  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0659267  normal  0.203339 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0224  GAF domain protein  44.25 
 
 		 274 aa  133  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0122769  hitchhiker  0.00130008 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2806  hypothetical protein  41.67 
 
 		 239 aa  129  4.0000000000000003e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5620  ANTAR domain-containing protein  39.27 
 
 		 235 aa  125  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.611556  normal  0.726497 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5220  putative GAF sensor protein  37.77 
 
 		 235 aa  124  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5329  ANTAR domain-containing protein  37.98 
 
 		 207 aa  115  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.456341  normal  0.298512 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5241  ANTAR  37.98 
 
 		 207 aa  115  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1048  ANTAR domain-containing protein  36.06 
 
 		 207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3801  ANTAR domain-containing protein  36.95 
 
 		 235 aa  103  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1754  ANTAR domain protein with unknown sensor  33.48 
 
 		 279 aa  89.7  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00308691  normal  0.111394 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3800  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.32 
 
 		 237 aa  84.7  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5240  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  34.36 
 
 		 249 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5328  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  34.36 
 
 		 249 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.882574  normal  0.306486 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3463  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.98 
 
 		 247 aa  77.4  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3146  ANTAR domain protein with unknown sensor  28.29 
 
 		 248 aa  77  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.417059  normal  0.203339 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4880  ANTAR domain-containing protein with unknown sensor  29.95 
 
 		 252 aa  76.3  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1988  ANTAR domain protein with unknown sensor  29.87 
 
 		 268 aa  75.1  0.0000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000129104  normal  0.216039 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1049  putative GAF sensor protein  30.8 
 
 		 252 aa  75.1  0.0000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0223  response regulator receiver and ANTAR domain protein  30.33 
 
 		 237 aa  75.1  0.0000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0512355  hitchhiker  0.00413709 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1669  ANTAR domain protein with unknown sensor  30.8 
 
 		 245 aa  72.8  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.371485 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2793  GAF domain protein  30.69 
 
 		 255 aa  72.8  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.118942  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2804  GAF domain protein  29.59 
 
 		 265 aa  72.4  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.546836  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2805  ANTAR domain protein with unknown sensor  31.61 
 
 		 258 aa  70.1  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.977167  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4493  hypothetical protein  29.11 
 
 		 252 aa  70.5  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0681296  normal  0.0584861 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5219  putative GAF sensor protein  32.9 
 
 		 260 aa  68.9  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3041  ANTAR domain protein with unknown sensor  29.58 
 
 		 253 aa  66.6  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0494925  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0255  putative GAF sensor protein  32.16 
 
 		 234 aa  65.5  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0416  ANTAR domain protein with unknown sensor  30.04 
 
 		 250 aa  65.5  0.0000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0251  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28 
 
 		 233 aa  65.1  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.731542 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5619  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.9 
 
 		 236 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.644035  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4477  response regulator receiver and ANTAR domain protein  29.9 
 
 		 245 aa  63.2  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0401437  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3254  ANTAR domain protein with unknown sensor  29.31 
 
 		 243 aa  62.8  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4298  ANTAR domain protein  30.41 
 
 		 251 aa  62.4  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.105151  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5618  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.36 
 
 		 266 aa  62  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.499136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4760  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.05 
 
 		 227 aa  61.6  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.186395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4379  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.05 
 
 		 227 aa  61.6  0.000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.752612  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4466  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.05 
 
 		 227 aa  61.6  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.981866  normal  0.0335822 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9006  hypothetical protein  28.49 
 
 		 235 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.782569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3170  putative GAF sensor protein  27.41 
 
 		 246 aa  61.2  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.678761  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1117  hypothetical protein  29.77 
 
 		 251 aa  61.6  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.134019  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5218  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.44 
 
 		 266 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0199  ANTAR domain protein  28 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19880  putative RNA-binding protein  28.27 
 
 		 246 aa  59.7  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.341339  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17120  putative RNA-binding protein  29.02 
 
 		 237 aa  58.2  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4299  ANTAR domain protein with unknown sensor  32.69 
 
 		 249 aa  58.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0271  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.08 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.240254 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0329  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.8 
 
 		 239 aa  57  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2469  hypothetical protein  33.7 
 
 		 246 aa  57.4  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.984121  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0261  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.08 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.169615  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2006  response regulator receiver and ANTAR domain protein  28 
 
 		 249 aa  56.2  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1050  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.24 
 
 		 266 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2152  ANTAR domain protein with unknown sensor  25.73 
 
 		 244 aa  55.5  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000502711  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2787  hypothetical protein  32.57 
 
 		 245 aa  55.5  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.958299  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2311  ANTAR domain protein with unknown sensor  27.88 
 
 		 250 aa  55.5  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4968  ANTAR domain protein with unknown sensor  28.65 
 
 		 236 aa  54.7  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11950  response regulator with putative antiterminator output domain  28.57 
 
 		 246 aa  54.3  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4213  putative GAF sensor protein  24.76 
 
 		 264 aa  54.7  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.172358  normal  0.253818 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2431  putative GAF sensor protein  24.76 
 
 		 259 aa  53.9  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3742  putative PAS/PAC sensor protein  32.5 
 
 		 417 aa  53.1  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.159414  normal  0.0141768 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0865  ANTAR domain protein with unknown sensor  31.55 
 
 		 251 aa  53.5  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0831  response regulator receiver and ANTAR domain protein  26.32 
 
 		 235 aa  53.5  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1809  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.29 
 
 		 228 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.165658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3435  ANTAR domain protein with unknown sensor  26.29 
 
 		 243 aa  53.1  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.274405  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3559  ANTAR domain protein with unknown sensor  30.59 
 
 		 265 aa  52.8  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000369232  hitchhiker  0.00495072 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0293  hypothetical protein  27.27 
 
 		 249 aa  52.8  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3104  hypothetical protein  31.51 
 
 		 238 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3171  putative GAF sensor protein  23.81 
 
 		 245 aa  51.6  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.144795  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1566  ANTAR domain protein with unknown sensor  25.25 
 
 		 242 aa  50.4  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4938  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.71 
 
 		 228 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0182005 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0345  ANTAR domain protein with unknown sensor  28.04 
 
 		 256 aa  50.4  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1924  ANTAR domain-containing protein  26.11 
 
 		 248 aa  48.9  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.684386  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0336  ANTAR domain protein with unknown sensor  29.41 
 
 		 276 aa  48.1  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0082  ANTAR domain protein with unknown sensor  22.73 
 
 		 270 aa  47.4  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.265172  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5205  ANTAR domain protein with unknown sensor  28.43 
 
 		 253 aa  47  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.536596  normal  0.563697 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0653  ANTAR domain protein with unknown sensor  25.81 
 
 		 255 aa  47  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3737  diguanylate cyclase  30.4 
 
 		 396 aa  47  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0128619  hitchhiker  0.00624598 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17130  ANTAR/GAF domain-containing protein  31.01 
 
 		 233 aa  47  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.430765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2607  ANTAR domain protein with unknown sensor  27.18 
 
 		 243 aa  46.2  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3173  putative GAF sensor protein  27.71 
 
 		 244 aa  46.2  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.149823  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3633  ANTAR domain protein with unknown sensor  26.42 
 
 		 241 aa  45.8  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.633789  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2276  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  23.27 
 
 		 253 aa  45.4  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.511511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3842  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.86 
 
 		 262 aa  45.4  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0552121 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0097  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.99 
 
 		 1224 aa  45.1  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.105547 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2284  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  23.27 
 
 		 253 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.24255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2237  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  23.27 
 
 		 253 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0253  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  24.88 
 
 		 246 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.138257 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0243  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  24.88 
 
 		 246 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1570  ANTAR domain protein with unknown sensor  24.26 
 
 		 246 aa  43.1  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2297  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.69 
 
 		 246 aa  43.5  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.501788  hitchhiker  0.00570166 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2200  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  36.89 
 
 		 637 aa  42.7  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04610  ANTAR/GAF domain-containing protein  29.03 
 
 		 240 aa  43.1  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2459  response regulator receiver and ANTAR domain protein  25.87 
 
 		 302 aa  42.4  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0279  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.7 
 
 		 245 aa  42.4  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3068  hypothetical protein  27.54 
 
 		 248 aa  42  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.332552  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0363  ANTAR domain-containing protein  22.16 
 
 		 248 aa  42  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>