77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4741 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_4741  hypothetical protein  100 
 
 
392 aa  760    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.400946  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3529  protein of unknown function DUF418  57.22 
 
 
398 aa  393  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.296308  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4293  protein of unknown function DUF418  50.9 
 
 
390 aa  283  3.0000000000000004e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8135  hypothetical protein  45.5 
 
 
397 aa  278  1e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.026592  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2581  hypothetical protein  41.03 
 
 
388 aa  249  7e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.365833  normal  0.0605789 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0035  hypothetical protein  41.03 
 
 
402 aa  216  4e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0072  hypothetical protein  43.2 
 
 
380 aa  207  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484765  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1668  protein of unknown function DUF418  39.9 
 
 
420 aa  197  3e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.620816  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1416  protein of unknown function DUF405  40.21 
 
 
407 aa  197  3e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.548338  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0984  protein of unknown function DUF418  40.53 
 
 
387 aa  192  7e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0392587  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2152  hypothetical protein  36.53 
 
 
393 aa  189  7e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.391046 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1461  hypothetical protein  38.24 
 
 
401 aa  188  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.586682  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1415  protein of unknown function DUF405  40.21 
 
 
399 aa  187  2e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.845184  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0719  protein of unknown function DUF418  42.01 
 
 
405 aa  186  5e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.699875  normal  0.0836204 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0622  hypothetical protein  37.17 
 
 
439 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1670  hypothetical protein  35.94 
 
 
405 aa  180  4e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.704713  normal  0.19338 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1078  protein of unknown function DUF418  39.35 
 
 
384 aa  175  9.999999999999999e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1236  hypothetical protein  36.23 
 
 
399 aa  168  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3111  protein of unknown function DUF418  39.25 
 
 
443 aa  168  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.414343  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1063  protein of unknown function DUF405  37.63 
 
 
472 aa  168  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.397871 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3780  hypothetical protein  38.44 
 
 
401 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.769148 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4159  hypothetical protein  40.89 
 
 
401 aa  166  5.9999999999999996e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.776458  decreased coverage  0.000152397 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3607  protein of unknown function DUF418  34.98 
 
 
407 aa  164  2.0000000000000002e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.526186  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24880  predicted membrane protein  37.88 
 
 
432 aa  164  3e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0615892  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0505  protein of unknown function DUF418  36.09 
 
 
407 aa  162  8.000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000344824 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15990  predicted membrane protein  37.56 
 
 
414 aa  145  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.76161  normal  0.230384 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07880  predicted membrane protein  29.87 
 
 
407 aa  97.1  5e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30910  predicted membrane protein  27.95 
 
 
392 aa  82  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0455  hypothetical protein  28.78 
 
 
415 aa  82.4  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.222068  hitchhiker  0.00425561 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0683  protein of unknown function DUF405  25.67 
 
 
387 aa  79.7  0.00000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4423  hypothetical protein  26.37 
 
 
417 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00407884  normal  0.808497 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2066  protein of unknown function DUF418  24.87 
 
 
404 aa  72  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0837783  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1499  protein of unknown function DUF405  27.04 
 
 
388 aa  69.7  0.00000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2327  hypothetical protein  30.24 
 
 
388 aa  68.6  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0285  protein of unknown function DUF418  25 
 
 
409 aa  66.2  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00200  predicted membrane protein  28.01 
 
 
397 aa  65.1  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.220914 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0117  membrane protein  20.82 
 
 
381 aa  64.7  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000725343  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2840  hypothetical protein  26.81 
 
 
414 aa  64.3  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.110654 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0015  hypothetical protein  21.08 
 
 
381 aa  62.8  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.428508  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1561  hypothetical protein  37.91 
 
 
393 aa  62.4  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2115  protein of unknown function DUF418  24.86 
 
 
412 aa  62.8  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0252  protein of unknown function DUF405  27.7 
 
 
410 aa  61.6  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.680617 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2290  protein of unknown function DUF405  27.68 
 
 
391 aa  60.8  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.578329  normal  0.0235381 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3078  hypothetical protein  22.72 
 
 
411 aa  60.1  0.00000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3230  hypothetical protein  30.23 
 
 
411 aa  60.1  0.00000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3571  protein of unknown function DUF418  25.7 
 
 
405 aa  59.7  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.983337  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2355  protein of unknown function DUF405  25.85 
 
 
364 aa  58.5  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3087  hypothetical protein  29.65 
 
 
411 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1289  protein of unknown function DUF405  29.65 
 
 
401 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.34904 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1671  hypothetical protein  26.54 
 
 
395 aa  57.8  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.219787  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2885  protein of unknown function DUF405  24.58 
 
 
414 aa  57  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.802913  normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0179  hypothetical protein  21.54 
 
 
381 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000571802  hitchhiker  1.74871e-35 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3043  hypothetical protein  23.94 
 
 
382 aa  55.1  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2799  hypothetical protein  28.57 
 
 
414 aa  55.1  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4097  hypothetical protein  21.7 
 
 
399 aa  55.1  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1661  transport protein  23.68 
 
 
430 aa  54.7  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.414626  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2404  hypothetical protein  40 
 
 
382 aa  53.9  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.334101  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2882  hypothetical protein  29.71 
 
 
414 aa  52.8  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1608  hypothetical protein  22.59 
 
 
430 aa  52  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0178  hypothetical protein  21.79 
 
 
381 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4804  transmembrane protein  22.31 
 
 
312 aa  52  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000142062  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1203  hypothetical protein  23.38 
 
 
398 aa  51.2  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1396  hypothetical protein  28.49 
 
 
399 aa  50.4  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2305  hypothetical protein  31.18 
 
 
391 aa  50.4  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2978  hypothetical protein  28.66 
 
 
414 aa  50.1  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0076  protein of unknown function DUF418  27.86 
 
 
416 aa  48.9  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.477208  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0746  protein of unknown function DUF405  27.34 
 
 
204 aa  49.3  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.685935 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1888  hypothetical protein  25.66 
 
 
389 aa  47.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5273  hypothetical protein  21.21 
 
 
312 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2752  hypothetical protein  34.83 
 
 
385 aa  47  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.915358  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0691  hypothetical protein  35.11 
 
 
381 aa  44.7  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2860  protein of unknown function DUF418  26.02 
 
 
415 aa  44.7  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01909  transport protein  24.65 
 
 
409 aa  44.3  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.694528  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0666  protein of unknown function DUF405  23.29 
 
 
362 aa  44.7  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000167692  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1066  hypothetical protein  26.8 
 
 
401 aa  44.7  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0190  hypothetical protein  29.17 
 
 
428 aa  44.3  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.55784  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1538  protein of unknown function DUF405  25.67 
 
 
406 aa  43.5  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>