66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4684 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4684  regulatory protein, MarR  100 
 
 		 157 aa  321  3e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.261368  normal  0.0600861 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4580  regulatory protein, MarR  39.6 
 
 		 157 aa  125  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0088  regulatory protein, MarR  43.36 
 
 		 158 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10692  hypothetical protein  40 
 
 		 165 aa  114  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2900  MarR regulatory protein  38 
 
 		 160 aa  110  6e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.348168  normal  0.115809 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4465  regulatory protein, MarR  38.3 
 
 		 164 aa  105  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0167  hypothetical protein  37.69 
 
 		 165 aa  90.1  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0176  hypothetical protein  31.29 
 
 		 153 aa  86.3  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.750866  hitchhiker  0.00561367 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2201  transcriptional regulator, TrmB  38.64 
 
 		 159 aa  86.3  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.648434  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2247  transcriptional regulator, TrmB  38.64 
 
 		 159 aa  86.3  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0777  transcriptional regulator, TrmB  36.17 
 
 		 153 aa  86.3  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.162484  normal  0.537638 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2190  transcriptional regulator, TrmB  38.64 
 
 		 159 aa  86.3  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.235216  normal  0.0245413 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3656  regulatory protein, MarR  32.47 
 
 		 179 aa  85.1  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1562  regulatory protein, MarR  30 
 
 		 159 aa  84.3  6e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5169  regulatory protein ArsR  35.61 
 
 		 152 aa  80.5  0.000000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.207945  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4698  hypothetical protein  32.21 
 
 		 152 aa  80.1  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26116  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2926  regulatory protein, MarR  33.56 
 
 		 163 aa  79.7  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0167  hypothetical protein  28.57 
 
 		 153 aa  78.6  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.287681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1000  hypothetical protein  29.22 
 
 		 169 aa  75.9  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.642132 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3663  hypothetical protein  28.68 
 
 		 152 aa  76.3  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.173975  normal  0.574334 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5388  hypothetical protein  32.41 
 
 		 172 aa  74.7  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.44132 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5391  hypothetical protein  28.95 
 
 		 155 aa  69.3  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.470124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0969  hypothetical protein  34.94 
 
 		 153 aa  67.4  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.563081  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0102  hypothetical protein  26.21 
 
 		 161 aa  66.6  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.870138  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2452  hypothetical protein  29.53 
 
 		 168 aa  65.1  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000738344  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0584  regulatory protein, MarR  30.71 
 
 		 155 aa  63.9  0.0000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36940  predicted transcriptional regulator  26.95 
 
 		 169 aa  60.8  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.830889  normal  0.068604 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5280  ArsR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.840921  normal  0.204126 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2806  hypothetical protein  23.72 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.681505 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17010  predicted transcriptional regulator  30.22 
 
 		 175 aa  57  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.491454 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5635  hypothetical protein  27.21 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0365755 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2558  transcriptional regulator TrmB  29.94 
 
 		 156 aa  52  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1462  hypothetical protein  29.17 
 
 		 155 aa  51.6  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5901  transcriptional regulator, ArsR family  34.21 
 
 		 180 aa  50.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.660241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0441  hypothetical protein  30.08 
 
 		 194 aa  49.3  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.388606  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2203  hypothetical protein  28.57 
 
 		 150 aa  48.9  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.138665  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0507  hypothetical protein  31.93 
 
 		 178 aa  48.9  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1511  hypothetical protein  27.78 
 
 		 163 aa  48.5  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.523376  decreased coverage  0.00417665 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3330  putative transcriptional regulator  29.46 
 
 		 191 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.216044  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2633  transcriptional regulator protein-like protein  32.61 
 
 		 184 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4930  putative transcriptional regulator  30.23 
 
 		 192 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.653338  hitchhiker  0.000469457 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0579  helix-turn-helix, type 11  34.29 
 
 		 191 aa  48.1  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.556285  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03482  Helix-turn-helix, type 11  37.14 
 
 		 183 aa  48.1  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1076  hypothetical protein  27.94 
 
 		 239 aa  47  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2135  hypothetical protein  28.79 
 
 		 147 aa  47  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.421336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0033  hypothetical protein  26.57 
 
 		 241 aa  44.7  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.629454 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3538  hypothetical protein  27.82 
 
 		 194 aa  44.3  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.306741  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7088  conserved hypothetical protein; putative transcriptional regulatory protein  34.48 
 
 		 168 aa  43.9  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.195583  normal  0.688965 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0501  transcriptional regulator, MarR family  27.97 
 
 		 253 aa  43.9  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  27.97 
 
 		 157 aa  43.5  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  27.97 
 
 		 157 aa  43.5  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0397  transcriptional regulator, ArsR family  31.25 
 
 		 193 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0396  transcriptional regulator, ArsR family  32.53 
 
 		 193 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4326  putative transcriptional regulator  27.91 
 
 		 190 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0368  regulatory protein, ArsR  31.25 
 
 		 193 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.370147  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4118  hypothetical protein  32.86 
 
 		 217 aa  42.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2400  ArsR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 198 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.651579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0589  putative transcriptional regulator  36.14 
 
 		 175 aa  42.4  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.373592  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10078  hypothetical protein  26.58 
 
 		 165 aa  41.6  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.866988  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6466  hypothetical protein  34.52 
 
 		 316 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.893622  normal  0.0778626 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2572  ArsR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 185 aa  41.2  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1369  transcriptional regulators-like protein  33.33 
 
 		 171 aa  41.2  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0611668  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3836  hypothetical protein  34.29 
 
 		 181 aa  41.2  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.902876  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4210  regulatory protein, ArsR  33.73 
 
 		 191 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.204887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1397  transcriptional regulator, TrmB  31.46 
 
 		 131 aa  40.4  0.009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000176396 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0493  hypothetical protein  31.43 
 
 		 207 aa  40.4  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>