48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2878 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2878  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  100 
 
 		 161 aa  328  3e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.505096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0747  cupin-like protein  45.91 
 
 		 169 aa  148  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1878  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  38.41 
 
 		 158 aa  117  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0087666  normal  0.0137906 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2141  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37 
 
 		 159 aa  67.4  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0144  cupin 2 domain-containing protein  29.2 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0760  cupin 2 domain-containing protein  29.46 
 
 		 178 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26011  normal  0.519438 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1228  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.71 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.066401  normal  0.685252 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1709  cupin 2, barrel  33.33 
 
 		 163 aa  57.8  0.00000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.448021 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0604  cupin 2, barrel  29.06 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.398371  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0617  cupin 2 domain-containing protein  29.06 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5299  hypothetical protein  30.58 
 
 		 166 aa  57.4  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0595  cupin 2 domain-containing protein  29.06 
 
 		 165 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3405  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.67 
 
 		 156 aa  57  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3197  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.23 
 
 		 191 aa  57  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229687  normal  0.39078 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5660  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.84 
 
 		 170 aa  54.7  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.215719 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0483  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.2 
 
 		 172 aa  53.9  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.319109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3363  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.58 
 
 		 181 aa  52  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.331871 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0105  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.67 
 
 		 204 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0102  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.67 
 
 		 204 aa  50.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.66506 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0633  cupin 2 domain-containing protein  29.81 
 
 		 158 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.643791  normal  0.229137 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3908  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 186 aa  49.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.399642  normal  0.0760956 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.43 
 
 		 192 aa  49.7  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0565  hypothetical protein  27.66 
 
 		 155 aa  48.9  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.916683  normal  0.52627 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6348  cupin 2 domain-containing protein  30.4 
 
 		 163 aa  47.8  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0950  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.82 
 
 		 389 aa  47.8  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2309  hypothetical protein  28.57 
 
 		 139 aa  47.8  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.5332  hitchhiker  0.00622303 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.8 
 
 		 149 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.657648 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2964  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.96 
 
 		 160 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.75352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0109  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.63 
 
 		 377 aa  46.6  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.146013 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3189  cupin 2, barrel  35.9 
 
 		 190 aa  46.6  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00000805068  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0425  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.39 
 
 		 110 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0839073  hitchhiker  0.0000787974 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6233  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.52 
 
 		 163 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.398434  normal  0.379299 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_11002  dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G07350)  29.57 
 
 		 355 aa  45.1  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.627949  normal  0.657367 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3191  cupin 2, barrel  25.86 
 
 		 179 aa  45.1  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000053457  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4108  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.68 
 
 		 165 aa  44.3  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1923  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.85 
 
 		 145 aa  44.3  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0356258  normal  0.456316 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0439  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.38 
 
 		 110 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.395009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5062  hypothetical protein  26.67 
 
 		 157 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.421326  normal  0.406339 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2884  XRE family transcriptional regulator  23.16 
 
 		 181 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0819457  normal  0.480487 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4562  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.93 
 
 		 153 aa  43.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0454  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.85 
 
 		 356 aa  42.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2898  XRE family transcriptional regulator  23.16 
 
 		 181 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2806  XRE family transcriptional regulator  23.16 
 
 		 181 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.675672 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3153  cupin 2 domain-containing protein  31.03 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2969  cupin 2  35.14 
 
 		 171 aa  43.1  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0204  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.59 
 
 		 160 aa  42  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2387  XRE family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 181 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5012  hypothetical protein  32.1 
 
 		 155 aa  40.4  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0120588  normal  0.173507 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>