More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2111 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2111  thiamine-monophosphate kinase  100 
 
 
317 aa  620  1e-177  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.373276  normal  0.178161 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1275  thiamine monophosphate kinase  67.19 
 
 
317 aa  365  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.532695  normal  0.860211 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1165  thiamine monophosphate kinase  66.88 
 
 
317 aa  334  1e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000347409 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8005  Thiamine-phosphate kinase  57.88 
 
 
318 aa  332  6e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0986  thiamine monophosphate kinase  53.49 
 
 
375 aa  326  3e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.243699  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3288  thiamine monophosphate kinase  54.49 
 
 
316 aa  326  3e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.13566  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3747  thiamine monophosphate kinase  57.23 
 
 
344 aa  325  5e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.635061  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1584  thiamine monophosphate kinase  62.2 
 
 
300 aa  318  6e-86  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.407521  normal  0.0322048 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09190  thiamine-phosphate kinase  60.7 
 
 
322 aa  315  5e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.268775  normal  0.793617 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1488  thiamine-monophosphate kinase  54.49 
 
 
305 aa  315  7e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0719227  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0204  thiamine-monophosphate kinase  54.57 
 
 
330 aa  308  8e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5985  thiamine-monophosphate kinase  58.33 
 
 
321 aa  306  2.0000000000000002e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3443  thiamine-monophosphate kinase  54.6 
 
 
315 aa  302  4.0000000000000003e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.549222  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0643  thiamine monophosphate kinase  58.13 
 
 
329 aa  300  2e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4040  thiamine-monophosphate kinase  57.54 
 
 
328 aa  261  8.999999999999999e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.139533  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2151  thiamine monophosphate kinase  53.46 
 
 
320 aa  261  2e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4216  thiamine monophosphate kinase  52.83 
 
 
322 aa  256  3e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.115261  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2789  thiamine-monophosphate kinase  58.7 
 
 
294 aa  256  3e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  0.0905665 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11180  thiamine-phosphate kinase  50.63 
 
 
332 aa  255  6e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0310468  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1366  thiamine-monophosphate kinase  51.95 
 
 
314 aa  253  3e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.192549  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12992  thiamine monophosphate kinase  49.22 
 
 
333 aa  239  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000372497  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1597  thiamine-monophosphate kinase  51.1 
 
 
346 aa  236  3e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.219582  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2283  thiamine-monophosphate kinase  47.49 
 
 
341 aa  236  3e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.127979  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2308  thiamine-monophosphate kinase  50.31 
 
 
327 aa  223  3e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000127742  hitchhiker  0.00320399 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1678  thiamine-monophosphate kinase  43.6 
 
 
355 aa  223  3e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.032246  hitchhiker  0.0057053 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8038  thiamine-monophosphate kinase  42.13 
 
 
370 aa  216  5e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2839  thiamine-monophosphate kinase  47.95 
 
 
341 aa  214  1.9999999999999998e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1912  thiamine monophosphate kinase  49.21 
 
 
318 aa  209  4e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.629642  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1932  thiamine monophosphate kinase  49.21 
 
 
318 aa  209  4e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1978  thiamine monophosphate kinase  49.21 
 
 
318 aa  209  4e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.721142  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0146  thiamine-monophosphate kinase  39.82 
 
 
339 aa  191  1e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.134022  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0646  thiamine-monophosphate kinase  38.97 
 
 
334 aa  188  1e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2512  thiamine-monophosphate kinase  42.51 
 
 
341 aa  188  1e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.112077  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3206  thiamine-monophosphate kinase  45.02 
 
 
361 aa  186  4e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0692  thiamine-monophosphate kinase  39.21 
 
 
327 aa  183  3e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384986  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0368  thiamine-monophosphate kinase  42.41 
 
 
323 aa  182  5.0000000000000004e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0619  thiamine-monophosphate kinase  37.65 
 
 
323 aa  176  6e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  5.18956e-35 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0085  thiamine-monophosphate kinase  33.02 
 
 
314 aa  175  9e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000254711  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10790  thiamine-monophosphate kinase  44.79 
 
 
327 aa  174  1.9999999999999998e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.322383 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2071  thiamine-monophosphate kinase  39.58 
 
 
343 aa  171  1e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0605  thiamine-monophosphate kinase  37.54 
 
 
324 aa  169  4e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.926757  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3194  thiamine monophosphate kinase  38.53 
 
 
328 aa  169  7e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18480  thiamine-monophosphate kinase  40.92 
 
 
372 aa  168  1e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.04788  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2394  thiamine-monophosphate kinase  37.5 
 
 
344 aa  161  2e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1027  thiamine-monophosphate kinase  31.3 
 
 
344 aa  161  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0548176  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2805  thiamine-monophosphate kinase  37.2 
 
 
331 aa  159  6e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.707056  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0605  thiamine-monophosphate kinase  37.89 
 
 
323 aa  159  7e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.655619  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0791  thiamine-monophosphate kinase  32.99 
 
 
348 aa  158  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0014  thiamine-monophosphate kinase  33.91 
 
 
346 aa  158  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2521  thiamine-phosphate kinase (thiamin-monophosphate kinase)  34.02 
 
 
346 aa  158  1e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2249  thiamine-monophosphate kinase  43.2 
 
 
335 aa  156  5.0000000000000005e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000928711 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2889  thiamine-monophosphate kinase  36.52 
 
 
334 aa  155  9e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202219  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3114  thiamine monophosphate kinase  38.63 
 
 
329 aa  154  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1149  thiamine-monophosphate kinase  35.71 
 
 
318 aa  154  2e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.017464  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3255  thiamine monophosphate kinase  38.63 
 
 
329 aa  154  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.05609  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3213  thiamine-monophosphate kinase  36.92 
 
 
329 aa  153  4e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.330996  hitchhiker  0.00000000031057 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3166  thiamine monophosphate kinase  38.63 
 
 
329 aa  153  4e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0528  thiamine-monophosphate kinase  30.77 
 
 
315 aa  150  2e-35  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0398  thiamine-monophosphate kinase  33.56 
 
 
350 aa  150  2e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1075  thiamine monophosphate kinase  34.66 
 
 
327 aa  150  3e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.255519  hitchhiker  0.000417977 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0336  thiamine-monophosphate kinase  32.58 
 
 
355 aa  150  3e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1021  thiamine-phosphate kinase  38.71 
 
 
333 aa  150  3e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0674633  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0028  thiamine-monophosphate kinase  38.13 
 
 
329 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04400  putative thiamine-monophosphate kinase  33.33 
 
 
352 aa  147  2.0000000000000003e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0163  thiamine-monophosphate kinase  37.93 
 
 
338 aa  146  4.0000000000000006e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.959025  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2317  thiamine monophosphate kinase  33.82 
 
 
332 aa  146  6e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1693  thiamine-monophosphate kinase  35.61 
 
 
340 aa  145  6e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0213115  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4475  thiamine-monophosphate kinase  39.56 
 
 
329 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.599379  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3282  thiamine monophosphate kinase  35.08 
 
 
326 aa  144  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2283  thiamine-monophosphate kinase  40.61 
 
 
372 aa  142  5e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0153463 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2602  thiamine-monophosphate kinase  36.79 
 
 
333 aa  142  7e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0259397  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4456  thiamine-monophosphate kinase  39.2 
 
 
329 aa  142  8e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4465  thiamine-monophosphate kinase  41.45 
 
 
325 aa  139  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.269077  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0505  thiamine-monophosphate kinase  29.75 
 
 
314 aa  139  7.999999999999999e-32  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0139572  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0847  thiamine-monophosphate kinase  33.65 
 
 
315 aa  139  7.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.532066  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2773  thiamine-monophosphate kinase  36.82 
 
 
323 aa  138  1e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00271748  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0812  thiamine-monophosphate kinase  33.33 
 
 
346 aa  138  1e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1874  thiamine-monophosphate kinase  30.18 
 
 
320 aa  137  2e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3153  thiamine-monophosphate kinase  36.82 
 
 
323 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000108532  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2612  thiamine-monophosphate kinase  31.3 
 
 
363 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1216  thiamine-monophosphate kinase  36.82 
 
 
323 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000120227  normal  0.180356 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3155  thiamine-monophosphate kinase  36.82 
 
 
323 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000840757  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1192  thiamine-monophosphate kinase  34.25 
 
 
323 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0510899  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1928  thiamine-monophosphate kinase  32.49 
 
 
354 aa  136  4e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1157  thiamine-monophosphate kinase  37.46 
 
 
337 aa  136  5e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470435  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1167  thiamine-monophosphate kinase  32.52 
 
 
319 aa  136  5e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00022874  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1028  thiamine monophosphate kinase  34.46 
 
 
326 aa  136  5e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3298  thiamine-monophosphate kinase  36.82 
 
 
323 aa  136  5e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000889615  decreased coverage  0.000117497 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0711  thiamine-monophosphate kinase  40.07 
 
 
321 aa  136  5e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2017  thiamine-monophosphate kinase  37.54 
 
 
337 aa  135  6.0000000000000005e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0358  thiamine-monophosphate kinase  30.42 
 
 
355 aa  135  7.000000000000001e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00127511  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0477  thiamine-monophosphate kinase  31.27 
 
 
306 aa  135  7.000000000000001e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5192  thiamine-monophosphate kinase  33.22 
 
 
339 aa  135  9e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0637  thiamine monophosphate kinase  32.76 
 
 
346 aa  135  9.999999999999999e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.216101 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0258  thiamine-monophosphate kinase  30.51 
 
 
355 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.451362  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0460  thiamine monophosphate kinase  37.5 
 
 
326 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3852  thiamine monophosphate kinase  35.47 
 
 
317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0521  thiamine monophosphate kinase  37.5 
 
 
326 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2839  thiamine monophosphate kinase  32.25 
 
 
344 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0832  thiamine-monophosphate kinase  30.97 
 
 
335 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000411831  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>