More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4973 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4973  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 		 360 aa  735    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.132387 
 
 
-
 
NC_004310  BR0241  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  78.59 
 
 		 359 aa  587  1e-167  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.803279  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0315  oxidoreductase domain-containing protein  77.18 
 
 		 359 aa  581  1.0000000000000001e-165  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.500067  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0234  putative oxidoreductase protein  69.3 
 
 		 325 aa  500  1e-140  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.391798  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2277  oxidoreductase domain-containing protein  51.29 
 
 		 353 aa  361  9e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3482  oxidoreductase domain protein  44.78 
 
 		 358 aa  303  2.0000000000000002e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4126  oxidoreductase domain-containing protein  42.9 
 
 		 352 aa  290  2e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2752  oxidoreductase domain protein  42.86 
 
 		 359 aa  280  2e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.626941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2547  oxidoreductase domain-containing protein  34.22 
 
 		 360 aa  178  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.476025  normal  0.311461 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0530  oxidoreductase-like protein  33.73 
 
 		 368 aa  135  9e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0597685  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5752  oxidoreductase domain-containing protein  29.34 
 
 		 362 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.156023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3433  oxidoreductase domain-containing protein  29.57 
 
 		 363 aa  107  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.808299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0345  oxidoreductase, NAD-binding  27.68 
 
 		 376 aa  98.6  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0414  oxidoreductase domain-containing protein  27.68 
 
 		 376 aa  98.6  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0322  oxidoreductase domain protein  25.6 
 
 		 356 aa  83.6  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1061  oxidoreductase domain-containing protein  26.67 
 
 		 351 aa  73.9  0.000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1865  oxidoreductase domain protein  29.95 
 
 		 367 aa  73.6  0.000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  23.76 
 
 		 384 aa  69.7  0.00000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4807  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.34 
 
 		 308 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4568  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.6 
 
 		 308 aa  67  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4923  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.6 
 
 		 308 aa  67  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  28.42 
 
 		 385 aa  67  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0455  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  30.6 
 
 		 308 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0435849 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4789  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  30.6 
 
 		 308 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4805  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  30.53 
 
 		 308 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4420  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.6 
 
 		 308 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  25.17 
 
 		 382 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413196 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4403  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.6 
 
 		 308 aa  65.5  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  28.43 
 
 		 349 aa  64.7  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4500  oxidoreductase domain-containing protein  30.6 
 
 		 308 aa  65.1  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1805  oxidoreductase domain protein  30.26 
 
 		 321 aa  64.3  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.759104  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4784  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  30.6 
 
 		 308 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3733  oxidoreductase domain protein  26.44 
 
 		 343 aa  63.9  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  24.31 
 
 		 387 aa  63.5  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2126  oxidoreductase domain protein  23.98 
 
 		 320 aa  63.2  0.000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  24.5 
 
 		 382 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3060  oxidoreductase domain-containing protein  25.29 
 
 		 344 aa  60.8  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0803  oxidoreductase domain protein  26.69 
 
 		 337 aa  60.5  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0126496 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2038  oxidoreductase domain-containing protein  26.76 
 
 		 369 aa  60.8  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.363533  normal  0.488565 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02930  putative oxidoreductase  26.37 
 
 		 347 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00065533 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  28.36 
 
 		 347 aa  59.3  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3811  oxidoreductase domain protein  26.99 
 
 		 358 aa  59.3  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247991  normal  0.0981542 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2082  oxidoreductase domain protein  28.67 
 
 		 321 aa  59.3  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.284324  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1468  oxidoreductase-like  25.14 
 
 		 373 aa  59.3  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.582127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0984  oxidoreductase domain protein  35 
 
 		 335 aa  59.3  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0788377  normal  0.0273723 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1011  oxidoreductase domain protein  28.1 
 
 		 385 aa  58.9  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00895095  normal  0.937142 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  22.71 
 
 		 311 aa  58.9  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4818  oxidoreductase domain protein  31.63 
 
 		 361 aa  58.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.032332  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0009  oxidoreductase domain protein  28.87 
 
 		 355 aa  58.2  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  27.66 
 
 		 359 aa  58.2  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2047  putative oxidoreductase  28.91 
 
 		 309 aa  57.8  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4139  oxidoreductase-like  27.2 
 
 		 357 aa  58.2  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000162598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4018  oxidoreductase domain protein  25.28 
 
 		 365 aa  57.4  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1191  oxidoreductase domain-containing protein  22.82 
 
 		 332 aa  57.4  0.0000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0424624  hitchhiker  0.0000632942 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05780  predicted dehydrogenase  28.9 
 
 		 404 aa  57.4  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  25.37 
 
 		 353 aa  57.4  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1096  oxidoreductase domain-containing protein  30.37 
 
 		 370 aa  57  0.0000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.029157  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1649  oxidoreductase domain protein  25.91 
 
 		 388 aa  56.6  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.58008  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2273  oxidoreductase domain protein  26.92 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3330  oxidoreductase domain protein  24.06 
 
 		 339 aa  56.6  0.0000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0129274  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  24.89 
 
 		 377 aa  56.6  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4014  oxidoreductase domain protein  27.63 
 
 		 680 aa  56.2  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.876961 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  26.84 
 
 		 386 aa  56.2  0.0000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2927  putative dehydrogenase  26.34 
 
 		 337 aa  56.2  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.311728  hitchhiker  0.00000297483 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  27.62 
 
 		 350 aa  56.2  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1201  oxidoreductase-like  30.14 
 
 		 374 aa  56.2  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3468  oxidoreductase domain protein  22.1 
 
 		 345 aa  56.2  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0434  oxidoreductase domain-containing protein  25.12 
 
 		 356 aa  55.5  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3639  oxidoreductase domain-containing protein  23.41 
 
 		 373 aa  55.8  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.671652  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2441  oxidoreductase domain-containing protein  25.5 
 
 		 361 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.142653 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0136  oxidoreductase domain-containing protein  21.13 
 
 		 348 aa  55.5  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000686096 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1578  oxidoreductase-like protein  27.59 
 
 		 327 aa  54.7  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.0063536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1242  oxidoreductase domain-containing protein  31.88 
 
 		 328 aa  55.1  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.225329  normal  0.0194042 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0657  oxidoreductase domain protein  26.92 
 
 		 320 aa  54.7  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.488554  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1489  oxidoreductase domain protein  28.93 
 
 		 377 aa  55.1  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.414033  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2274  oxidoreductase domain protein  23.93 
 
 		 362 aa  54.3  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 		 363 aa  54.7  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1241  oxidoreductase domain protein  31.03 
 
 		 375 aa  54.3  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.101149 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1238  oxidoreductase domain protein  30.26 
 
 		 393 aa  53.9  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2148  oxidoreductase domain-containing protein  24.72 
 
 		 350 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.896351  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1531  oxidoreductase domain protein  29.92 
 
 		 326 aa  53.9  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3447  oxidoreductase domain-containing protein  25.38 
 
 		 321 aa  53.9  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2141  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 369 aa  53.5  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3940  oxidoreductase-like  25.26 
 
 		 330 aa  53.5  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.554966 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1468  oxidoreductase domain protein  26.74 
 
 		 316 aa  53.5  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.435768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  26.67 
 
 		 381 aa  53.5  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  31.09 
 
 		 353 aa  53.1  0.000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4490  oxidoreductase-like  30.73 
 
 		 345 aa  53.1  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.724338  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  27.65 
 
 		 359 aa  53.1  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  27.65 
 
 		 359 aa  53.1  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2855  oxidoreductase domain protein  27.32 
 
 		 375 aa  52.8  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0639382  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4755  oxidoreductase domain protein  23.22 
 
 		 344 aa  53.1  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00177574  normal  0.507858 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4658  oxidoreductase domain protein  23.38 
 
 		 344 aa  53.1  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.383619  normal  0.607328 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  23.21 
 
 		 312 aa  52.8  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  23.29 
 
 		 360 aa  52.8  0.000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  29.08 
 
 		 347 aa  52.8  0.000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  23.29 
 
 		 360 aa  52.8  0.000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  28.93 
 
 		 340 aa  52.8  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1266  hypothetical protein  28.68 
 
 		 307 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.881879  normal  0.136128 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2203  oxidoreductase family protein  28.68 
 
 		 307 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0142686 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>