More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1857 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1857  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 		 241 aa  481  1e-135  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.899807  normal  0.28447 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0869  pentapeptide repeat protein  67.13 
 
 		 233 aa  298  6e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0841759  normal  0.943651 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0997  pentapeptide repeat protein  66.18 
 
 		 237 aa  285  4e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5902  hypothetical protein  54.34 
 
 		 241 aa  250  1e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6262  pentapeptide repeat-containing protein  37.64 
 
 		 408 aa  105  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.104366  normal  0.857591 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  37.7 
 
 		 416 aa  98.6  9e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2185  pentapeptide repeat-containing protein  33.52 
 
 		 361 aa  92.4  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.225539 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  35.98 
 
 		 312 aa  91.7  9e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6284  pentapeptide repeat-containing protein  36.79 
 
 		 381 aa  89.4  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  33.33 
 
 		 381 aa  86.7  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  34.67 
 
 		 433 aa  85.1  9e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4278  pentapeptide repeat-containing protein  36.36 
 
 		 411 aa  84  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0535647  normal  0.226875 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  31.22 
 
 		 734 aa  80.5  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  34.65 
 
 		 449 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4098  pentapeptide repeat-containing protein  30.69 
 
 		 710 aa  79  0.00000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.202207 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3557  pentapeptide repeat protein  38.33 
 
 		 175 aa  76.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.951665  normal  0.239792 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  34 
 
 		 332 aa  76.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4082  pentapeptide repeat-containing protein  34.22 
 
 		 189 aa  75.9  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.492464 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  35.33 
 
 		 452 aa  75.9  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  32.73 
 
 		 401 aa  75.9  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  32.73 
 
 		 401 aa  75.9  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2559  pentapeptide repeat-containing protein  33.14 
 
 		 163 aa  75.5  0.0000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  33.85 
 
 		 493 aa  75.1  0.0000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0246  pentapeptide repeat protein  36.81 
 
 		 215 aa  74.7  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.858337  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  34.19 
 
 		 389 aa  74.3  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  34.46 
 
 		 267 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  40.26 
 
 		 214 aa  74.3  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  32.81 
 
 		 184 aa  73.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  36.42 
 
 		 1033 aa  73.6  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0211  pentapeptide repeat-containing protein  31.82 
 
 		 219 aa  73.2  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0521  pentapeptide repeat-containing protein  35.59 
 
 		 418 aa  73.2  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  29.83 
 
 		 489 aa  72.8  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  34.13 
 
 		 343 aa  72.8  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  34.13 
 
 		 343 aa  72.8  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  34.41 
 
 		 309 aa  72.8  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2556  pentapeptide repeat protein  36.25 
 
 		 776 aa  72.4  0.000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.684592 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  32.35 
 
 		 336 aa  72.4  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  32.35 
 
 		 336 aa  72.4  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1585  pentapeptide repeat-containing protein  34.97 
 
 		 237 aa  72  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000106738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2361  pentapeptide repeat protein  33.68 
 
 		 450 aa  72  0.000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  31.86 
 
 		 286 aa  71.6  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  35.14 
 
 		 320 aa  71.6  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1383  pentapeptide repeat protein  31.87 
 
 		 327 aa  71.6  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.100104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1950  pentapeptide repeat protein  35.4 
 
 		 199 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  32.22 
 
 		 567 aa  71.2  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  33.77 
 
 		 333 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0554  pentapeptide repeat protein  37.23 
 
 		 203 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 		 576 aa  70.9  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1260  pentapeptide repeat-containing protein  34.42 
 
 		 162 aa  70.5  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.911966  hitchhiker  0.00173599 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5734  pentapeptide repeat protein  30.18 
 
 		 266 aa  70.1  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  35.22 
 
 		 745 aa  70.5  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1286  hypothetical protein  32.66 
 
 		 412 aa  69.7  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  33.73 
 
 		 319 aa  69.7  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1977  pentapeptide repeat protein  34.36 
 
 		 199 aa  69.7  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0435241 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  32.72 
 
 		 234 aa  69.3  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  34.24 
 
 		 441 aa  68.9  0.00000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1012  pentapeptide repeat protein  37.12 
 
 		 309 aa  68.9  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0736311 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  37.31 
 
 		 517 aa  68.9  0.00000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0025  pentapeptide repeat-containing protein  31.65 
 
 		 348 aa  68.6  0.00000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1334  pentapeptide repeat protein  35.37 
 
 		 190 aa  68.6  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.877693 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1703  pentapeptide repeat protein  31.25 
 
 		 295 aa  68.6  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.279305  normal  0.0241547 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3775  pentapeptide repeat-containing protein  33.12 
 
 		 227 aa  68.6  0.00000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  30.62 
 
 		 340 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  38.99 
 
 		 521 aa  68.2  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0256  pentapeptide repeat protein  35.44 
 
 		 442 aa  68.2  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.306319  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1544  RDD domain-containing protein  29.09 
 
 		 706 aa  68.2  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  31.58 
 
 		 351 aa  67.4  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0684  pentapeptide repeat-containing protein  32.45 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  34.97 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  31.72 
 
 		 386 aa  66.6  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  34.04 
 
 		 1191 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  31.05 
 
 		 440 aa  66.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  33.71 
 
 		 268 aa  66.2  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4216  pentapeptide repeat-containing protein  35.98 
 
 		 485 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0428969  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  34.25 
 
 		 245 aa  65.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  32.11 
 
 		 493 aa  65.9  0.0000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4520  pentapeptide repeat protein  31.58 
 
 		 273 aa  65.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0577  hypothetical protein  29.1 
 
 		 961 aa  65.1  0.0000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2608  pentapeptide repeat-containing protein  38 
 
 		 259 aa  65.1  0.0000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0605  pentapeptide repeat-containing protein  30.14 
 
 		 727 aa  64.7  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000848072  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  34.19 
 
 		 264 aa  64.7  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0562  pentapeptide repeat protein  35.1 
 
 		 315 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4190  pentapeptide repeat-containing protein  35.29 
 
 		 356 aa  63.9  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0545  pentapeptide repeat protein  35.1 
 
 		 315 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1060  pentapeptide repeat-containing protein  36.43 
 
 		 157 aa  64.3  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0113174  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1275  pentapeptide repeat protein  31.33 
 
 		 213 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5010  pentapeptide repeat protein  33.58 
 
 		 204 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5070  pentapeptide repeat protein  32.86 
 
 		 174 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  35.94 
 
 		 291 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0024  pentapeptide repeat-containing protein  24.37 
 
 		 949 aa  64.3  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  35.94 
 
 		 291 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1610  pentapeptide repeat protein  35.61 
 
 		 408 aa  63.5  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000228674  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4286  pentapeptide repeat-containing protein  36.81 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0433008 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1785  pentapeptide repeat-containing protein  32.57 
 
 		 250 aa  63.5  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  37.5 
 
 		 225 aa  63.2  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1211  pentapeptide repeat-containing protein  32.43 
 
 		 419 aa  63.2  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.645913 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  27.08 
 
 		 448 aa  63.2  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3780  pentapeptide repeat protein  31.58 
 
 		 866 aa  63.2  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4964  pentapeptide repeat-containing protein  37.27 
 
 		 250 aa  62.8  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5145  pentapeptide repeat-containing protein  35.38 
 
 		 456 aa  62.4  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>