75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3129 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_3129  PGAP1 family protein  100 
 
 
210 aa  407  1e-113  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01554  hypothetical protein  58.71 
 
 
225 aa  217  1e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.114311  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1690  hypothetical protein  40.39 
 
 
220 aa  146  3e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00126399  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1726  hypothetical protein  37.21 
 
 
249 aa  118  6e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000120818  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0537  cob(I)yrinic acid a,c-diamide adenosyltransferase  39.63 
 
 
393 aa  118  6e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.319517  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0047  hypothetical protein  34.8 
 
 
209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0802  hypothetical protein  36 
 
 
240 aa  112  5e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.946026  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1019  hypothetical protein  29.5 
 
 
204 aa  110  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2238  hypothetical protein  37.98 
 
 
209 aa  105  5e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000571  cob(I)alamin adenosyltransferase  33.17 
 
 
205 aa  100  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05312  cob(I)alamin adenosyltransferase  32.21 
 
 
205 aa  99.4  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0546  acetyltransferase/hydrolase  36.76 
 
 
216 aa  97.1  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.338996  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1762  hypothetical protein  35.03 
 
 
210 aa  93.6  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.88395  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1495  hypothetical protein  33.96 
 
 
221 aa  86.7  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0515  hypothetical protein  37.64 
 
 
209 aa  86.3  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5737  hypothetical protein  33.48 
 
 
245 aa  85.9  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.310215  normal  0.993413 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0272  hypothetical protein  31.19 
 
 
216 aa  79  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.937595  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0301  hypothetical protein  30.73 
 
 
216 aa  75.1  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2975  lipase, putative  28.44 
 
 
254 aa  73.2  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1008  hypothetical protein  34.72 
 
 
221 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.336181  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1332  hypothetical protein  33.64 
 
 
309 aa  71.6  0.000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.844774 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2648  hypothetical protein  24.52 
 
 
207 aa  67.8  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.549613  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0756  hypothetical protein  33.02 
 
 
222 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3532  hypothetical protein  26.03 
 
 
255 aa  65.9  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2914  putative alpha/beta hydrolase  30.14 
 
 
255 aa  64.3  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0274125  normal  0.502699 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3354  acetyltransferases and hydrolases with the alpha/beta hydrolase fold-like  31.75 
 
 
241 aa  62  0.000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0601  lipase, putative  28.44 
 
 
268 aa  59.7  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.505501  normal  0.267926 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0618  hypothetical protein  22.61 
 
 
236 aa  59.3  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1076  PGAP1 family protein  30.66 
 
 
211 aa  58.5  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1164  hypothetical protein  22.71 
 
 
254 aa  57.8  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1159  hypothetical protein  22.71 
 
 
254 aa  57  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1837  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like  41.44 
 
 
334 aa  55.1  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000537235  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1128  hypothetical protein  29.17 
 
 
303 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.361398  normal  0.462935 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2277  hypothetical protein  26.29 
 
 
229 aa  53.1  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1101  hypothetical protein  29.17 
 
 
303 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0795  hypothetical protein  34.58 
 
 
285 aa  51.2  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30208  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1830  alpha/beta hydrolase  43.48 
 
 
270 aa  50.1  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1357  hypothetical protein  37.5 
 
 
283 aa  50.1  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0861154 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2778  hypothetical protein  28.64 
 
 
269 aa  49.3  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3339  hypothetical protein  37.82 
 
 
289 aa  48.5  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0506  PGAP1 family protein  42.73 
 
 
361 aa  48.9  0.00006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221392 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0435  putative lipase transmembrane protein  29.15 
 
 
302 aa  48.5  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3470  PGAP1 family protein  34.09 
 
 
264 aa  47.4  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.595037  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4226  lipase class 2  28.16 
 
 
342 aa  47.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.522667  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0366  PGAP1 family protein  37.96 
 
 
299 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.971571  normal  0.240929 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2233  PGAP1 family protein  33.96 
 
 
338 aa  47  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.341698 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06481  lipase family protein  22.14 
 
 
203 aa  47  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0349  putative lipase transmembrane protein  28.5 
 
 
309 aa  46.6  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4221  putative lipase transmembrane protein  28.72 
 
 
304 aa  47.4  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.617519  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2045  alpha/beta hydrolase fold  42.53 
 
 
275 aa  45.8  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3591  hypothetical protein  35.65 
 
 
269 aa  45.4  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.391737  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1910  PGAP1 family protein  34.58 
 
 
338 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.463878  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0345  hypothetical protein  22.33 
 
 
325 aa  44.3  0.001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06181  lipase family protein  24.46 
 
 
203 aa  44.7  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4293  PGAP1 family protein  27.89 
 
 
263 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000482527  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0282  hypothetical protein  29.95 
 
 
249 aa  44.3  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.347157 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06571  lipase family protein  23.53 
 
 
197 aa  44.7  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2867  hypothetical protein  27.65 
 
 
222 aa  44.3  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0533  PGAP1 family protein  38.68 
 
 
303 aa  44.3  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4222  alpha/beta hydrolase fold protein  38.89 
 
 
248 aa  43.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.97992  normal  0.238083 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0592  lipase family protein  21.62 
 
 
197 aa  43.5  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.320367  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1065  PGAP1 family protein  33.66 
 
 
281 aa  43.1  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2455  lipase, putative  21.26 
 
 
247 aa  43.1  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1647  hypothetical protein  28.28 
 
 
306 aa  42.7  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.559763 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  32.28 
 
 
265 aa  42.7  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5039  lipase, class 2  28.48 
 
 
216 aa  42.7  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.420065 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1358  PGAP1 family protein  36.61 
 
 
286 aa  42.7  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3898  lipase class 2  24.48 
 
 
195 aa  42.4  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1468  alpha/beta hydrolase fold  40.66 
 
 
340 aa  42  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.890362 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0517  PGAP1 family protein  37.74 
 
 
303 aa  41.6  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.678836  normal  0.0127605 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4204  PGAP1 family protein  34.23 
 
 
287 aa  41.6  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.562909  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2652  alpha/beta hydrolase fold protein  34.15 
 
 
268 aa  41.6  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.191504  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3948  lipase class 2  24.48 
 
 
195 aa  41.6  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.759031  hitchhiker  0.00661405 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4177  PGAP1 family protein  34.23 
 
 
287 aa  41.6  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0504  inner-membrane translocator  26.92 
 
 
571 aa  41.6  0.01  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.92013  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>