More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2071 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_2071  PfkB domain protein  100 
 
 
339 aa  667    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.139149  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03455  2-keto-3-deoxygluconate kinase  65.98 
 
 
340 aa  398  9.999999999999999e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3036  PfkB  52.82 
 
 
342 aa  281  2e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3516  ribokinase-like domain-containing protein  47.34 
 
 
336 aa  241  2e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.300255  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2739  ribokinase-like domain-containing protein  39.76 
 
 
343 aa  227  2e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000138473  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0419  PfkB  38.81 
 
 
340 aa  223  4e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2713  PfkB domain protein  35.22 
 
 
340 aa  222  8e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1699  ribokinase-like domain-containing protein  45.97 
 
 
329 aa  221  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2044  PfkB domain protein  33.43 
 
 
340 aa  219  7.999999999999999e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0945186  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0157  KHG/KDPG family aldolase/carbohydrate kinase  37.54 
 
 
590 aa  218  1e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00034655  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4125  PfkB domain protein  38.28 
 
 
331 aa  218  1e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.197329 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1057  PfkB domain protein  39.58 
 
 
330 aa  216  4e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.443238  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11458  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  35.69 
 
 
341 aa  216  5e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.216935  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1160  PfkB domain protein  39.04 
 
 
342 aa  212  7e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2275  PfkB domain protein  39.04 
 
 
342 aa  210  3e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0880  ribokinase-like domain-containing protein  36.75 
 
 
339 aa  205  1e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0857  ribokinase-like domain-containing protein  36.45 
 
 
339 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4261  ribokinase-like domain-containing protein  35.01 
 
 
348 aa  197  2.0000000000000003e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1598  PfkB domain protein  36.61 
 
 
341 aa  194  1e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1379  PfkB domain protein  33.33 
 
 
340 aa  194  2e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0669  ribokinase-like domain-containing protein  33.73 
 
 
343 aa  190  2.9999999999999997e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0342  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  32.56 
 
 
334 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.70493  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2385  PfkB domain protein  31.55 
 
 
342 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1329  2-keto-3-deoxygluconate kinase  32.38 
 
 
342 aa  183  4.0000000000000006e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2644  PfkB  38.14 
 
 
334 aa  181  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0697  2-keto-3-deoxygluconate kinase  29.51 
 
 
341 aa  176  5e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3346  PfkB domain protein  34.93 
 
 
351 aa  174  1.9999999999999998e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0674  PfkB domain protein  30.7 
 
 
337 aa  173  5e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2264  PfkB domain protein  33.02 
 
 
331 aa  173  5e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.123147 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4577  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  33.24 
 
 
338 aa  169  6e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4972  carbohydrate kinase, PfkB family  32.45 
 
 
338 aa  168  9e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4686  ribokinase-like domain-containing protein  31.86 
 
 
338 aa  168  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4596  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  32.94 
 
 
338 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5000  carbohydrate kinase  32.26 
 
 
338 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4737  carbohydrate kinase  32.65 
 
 
338 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5097  carbohydrate kinase  32.65 
 
 
338 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4985  carbohydrate kinase, PfkB family  32.65 
 
 
338 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4957  carbohydrate kinase, PfkB family  32.65 
 
 
338 aa  164  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0442  PfkB domain protein  31.14 
 
 
326 aa  164  3e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4058  PfkB domain protein  31.12 
 
 
338 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0263  carbohydrate kinase, PfkB family  32.06 
 
 
338 aa  161  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.957258  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6831  PfkB domain protein  34.8 
 
 
332 aa  160  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.743211 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2208  PfkB domain protein  35.96 
 
 
366 aa  159  5e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235888  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1380  PfkB domain protein  30.59 
 
 
331 aa  158  1e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000087223  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27180  sugar kinase, ribokinase  34.11 
 
 
372 aa  156  6e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.771219  normal  0.49339 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0398  PfkB family kinase  29.6 
 
 
339 aa  155  1e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0227  ribokinase-like domain-containing protein  29.82 
 
 
344 aa  154  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.068215  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2509  PfkB domain protein  33.62 
 
 
317 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.893739 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2283  PfkB domain protein  34.22 
 
 
321 aa  153  2.9999999999999998e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.196107  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2870  PfkB domain protein  33.43 
 
 
318 aa  152  7e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1246  PfkB domain protein  32.78 
 
 
342 aa  150  4e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463266  normal  0.070655 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3191  PfkB domain protein  29.83 
 
 
366 aa  149  6e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000772988  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3010  PfkB domain protein  35.99 
 
 
365 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.489686  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0394  ribokinase family sugar kinase  29.39 
 
 
339 aa  147  3e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4259  ribokinase-like domain-containing protein  30.52 
 
 
365 aa  144  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0227  ribokinase-like domain-containing protein  34.87 
 
 
353 aa  142  9.999999999999999e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0463  PfkB domain protein  34.43 
 
 
318 aa  138  2e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.949852 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1761  ribokinase-like domain-containing protein  31.1 
 
 
368 aa  135  9e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550108  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1671  PfkB domain protein  25.97 
 
 
338 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0202  PfkB domain protein  35.92 
 
 
359 aa  133  5e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0709042  normal  0.0337983 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1292  PfkB domain protein  37.09 
 
 
317 aa  132  6e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.282801  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3215  PfkB domain protein  29.91 
 
 
317 aa  132  7.999999999999999e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0908  PfkB domain protein  31.87 
 
 
367 aa  131  1.0000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.288989  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  35.8 
 
 
320 aa  132  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2098  PfkB domain protein  29.81 
 
 
360 aa  123  4e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1906  carbohydrate kinase  26.54 
 
 
335 aa  122  9e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2277  PfkB domain protein  31.4 
 
 
332 aa  116  5e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.262567  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1382  PfkB domain protein  36.22 
 
 
326 aa  114  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.299274 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3911  PfkB domain protein  30.15 
 
 
321 aa  109  8.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.27465  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0189  PfkB family carbohydrate kinase  32.01 
 
 
339 aa  108  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0949  ribokinase-like domain-containing protein  31.37 
 
 
301 aa  107  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.206012 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3696  ribokinase-like domain-containing protein  32.09 
 
 
301 aa  106  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.657474  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2132  PfkB domain protein  33.53 
 
 
344 aa  105  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  28.74 
 
 
317 aa  103  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  31.76 
 
 
329 aa  100  3e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4291  PfkB domain protein  34.86 
 
 
342 aa  99.4  7e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.672218 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5491  PfkB domain protein  34.66 
 
 
320 aa  99.4  8e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386009  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0377  PfkB domain protein  28.96 
 
 
319 aa  95.1  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.404819  normal  0.365266 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2438  PfkB domain protein  31.94 
 
 
323 aa  94  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2566  ribokinase-like domain-containing protein  32.78 
 
 
316 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255946  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2067  ribokinase-like domain-containing protein  33.33 
 
 
324 aa  93.2  6e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0314864  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0082  myo-inositol catabolism protein IolC  26.21 
 
 
338 aa  92.8  7e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1865  ribokinase-like domain-containing protein  29.31 
 
 
320 aa  92.8  8e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.314409  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3008  PfkB domain protein  29.71 
 
 
343 aa  92  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.554278  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0169  ribokinase-like domain-containing protein  28.92 
 
 
312 aa  92  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0078  PfkB  31.86 
 
 
318 aa  90.5  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1253  ribokinase-like domain-containing protein  29.57 
 
 
320 aa  90.1  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0781765  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0502  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  26.59 
 
 
320 aa  88.6  1e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3378  PfkB domain protein  31.88 
 
 
316 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0607501 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2278  PfkB domain protein  29.09 
 
 
327 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.741137  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2815  PfkB  32.94 
 
 
314 aa  88.2  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6346  PfkB  29.41 
 
 
330 aa  87.4  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1733  ribokinase-like domain-containing protein  29.41 
 
 
330 aa  87.4  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2296  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  32 
 
 
329 aa  87  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1746  ribokinase-like domain-containing protein  29.41 
 
 
330 aa  87  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.931195 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2380  ribokinase-like domain-containing protein  31.88 
 
 
316 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2096  putative 2-keto-gluconokinase  29.62 
 
 
329 aa  86.3  6e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1654  ribokinase-like domain-containing protein  29.72 
 
 
330 aa  86.7  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.290792  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0756  PfkB domain protein  29.3 
 
 
329 aa  85.9  8e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0819977  normal  0.156556 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2288  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  29.62 
 
 
329 aa  85.9  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>