More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0788 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03756  GTP-binding protein  67.97 
 
 		 607 aa  850    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4115  GTP-binding protein TypA  67.97 
 
 		 607 aa  850    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1007  GTP-binding protein TypA  54.61 
 
 		 614 aa  663    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000478233  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0500  GTP-binding protein TypA  55.68 
 
 		 598 aa  665    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5044  GTP-binding protein TypA  64.65 
 
 		 606 aa  815    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2558  GTP-binding protein TypA  57.86 
 
 		 609 aa  713    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.551008  hitchhiker  0.00829209 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0308  GTP-binding protein TypA  67.32 
 
 		 609 aa  847    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.196053  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2852  GTP-binding protein TypA  67.76 
 
 		 606 aa  868    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011881  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4094  GTP-binding protein TypA  67.86 
 
 		 607 aa  846    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1296  GTP-binding elongation factor protein  64.04 
 
 		 606 aa  782    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.609673  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4003  GTP-binding protein TypA  50.49 
 
 		 614 aa  642    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0449963  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0606  GTP-binding protein TypA  64.22 
 
 		 605 aa  822    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.226291  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0038  GTP-binding protein TypA  52.61 
 
 		 602 aa  640    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.368844  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0312  GTP-binding protein TypA  67.32 
 
 		 603 aa  847    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0948  GTP-binding protein  66.12 
 
 		 602 aa  808    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4408  virulence regulator BipA  67.97 
 
 		 603 aa  858    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0361  GTP-binding protein TypA  64.65 
 
 		 606 aa  811    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3868  GTP-binding protein TypA  50.49 
 
 		 614 aa  642    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3701  GTP-binding protein  50.49 
 
 		 614 aa  642    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000145642  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3716  GTP-binding protein  50.49 
 
 		 614 aa  642    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.134306  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1053  GTP-binding protein TypA  63.55 
 
 		 608 aa  793    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2875  hypothetical protein  65.63 
 
 		 608 aa  831    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2737  hypothetical protein  65.63 
 
 		 608 aa  832    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4815  GTP-binding protein TypA  65.3 
 
 		 606 aa  813    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0339  putative regulatory protein TypA or elongation factor Tu  64.81 
 
 		 615 aa  829    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.597633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1998  GTP-binding protein TypA  58.27 
 
 		 613 aa  728    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.472185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0999  GTP-binding protein TypA  63.55 
 
 		 608 aa  793    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.191284  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2021  GTP-binding protein TypA  62.68 
 
 		 606 aa  770    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487667  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3380  GTP-binding protein TypA  58.77 
 
 		 608 aa  721    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.465428  normal  0.866362 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0772  GTP-binding protein TypA  59.61 
 
 		 610 aa  756    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.260784 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4880  GTP-binding protein TypA  67.65 
 
 		 607 aa  850    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000131447 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1499  GTP-binding protein TypA  63.55 
 
 		 608 aa  793    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.584386  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1923  GTP-binding protein TypA  63.55 
 
 		 608 aa  793    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.289402  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0720  GTP-binding protein TypA  68.09 
 
 		 609 aa  856    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000568805  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0347  GTP-binding protein TypA  64.16 
 
 		 606 aa  803    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1918  putative GTP-binding elongation factor protein  61.58 
 
 		 610 aa  743    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.23891  normal  0.145014 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1211  GTP-binding protein TypA  54.75 
 
 		 602 aa  673    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000229587  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4648  GTP-binding protein TypA  63.34 
 
 		 608 aa  795    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0457537  normal  0.313247 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4098  GTP-binding protein  67.97 
 
 		 607 aa  850    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3553  GTP-binding protein TypA  67.32 
 
 		 607 aa  848    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.718809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4008  GTP-binding protein TypA  54.53 
 
 		 599 aa  654    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000475691  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0028  GTP-binding protein TypA/BipA  67.48 
 
 		 607 aa  845    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3013  GTP-binding protein TypA  55.02 
 
 		 598 aa  661    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00684443  normal  0.862296 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0770  GTP-binding protein TypA  66.12 
 
 		 603 aa  842    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.872449  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0169  GTP-binding protein TypA  61.73 
 
 		 607 aa  801    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4166  GTP-binding protein TypA  50.49 
 
 		 614 aa  642    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00701473  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2658  GTP-binding protein TypA  50.98 
 
 		 614 aa  643    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0030836  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1757  GTP-binding protein TypA/BipA  52.45 
 
 		 602 aa  637    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2316  GTP-binding protein TypA  67.27 
 
 		 609 aa  850    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1770  GTP-binding protein TypA  61.54 
 
 		 603 aa  769    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0712941  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2008  GTP-binding protein TypA  58.25 
 
 		 607 aa  724    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.511019 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0380  GTP-binding protein TypA  64.32 
 
 		 615 aa  825    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000238787  hitchhiker  0.00000136232 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2557  GTP-binding protein TypA  63.71 
 
 		 608 aa  795    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1748  GTP-binding protein TypA  64.04 
 
 		 608 aa  801    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.846744  normal  0.0136263 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0738  GTP-binding protein TypA  65.14 
 
 		 606 aa  832    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00590  GTPase  67.76 
 
 		 609 aa  858    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3915  GTP-binding protein TypA  66.94 
 
 		 609 aa  847    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4918  GTP-binding protein TypA  64.65 
 
 		 606 aa  816    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3483  GTP-binding virulence regulator protein BipA  66.88 
 
 		 607 aa  829    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.325344 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2137  GTP-binding protein TypA  58.25 
 
 		 607 aa  731    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.011912  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0511  regulatory protein TypA  65.19 
 
 		 608 aa  822    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0307  GTP-binding protein TypA  67.32 
 
 		 609 aa  847    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0237117  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1259  GTP-binding protein TypA  59.38 
 
 		 602 aa  725    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.273411 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2429  GTP-binding protein TypA  58.74 
 
 		 607 aa  728    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.456233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2813  GTP-binding protein TypA  63.01 
 
 		 608 aa  796    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.472576 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3455  GTP-binding protein TypA  67.43 
 
 		 603 aa  846    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000132117  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0167  GTP-binding protein TypA  63.55 
 
 		 608 aa  793    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.139003  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0239  GTP-binding protein TypA  63.83 
 
 		 608 aa  801    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0373  GTP-binding protein TypA  64.32 
 
 		 615 aa  830    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0554499  normal  0.0314222 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2024  GTP-binding protein TypA  63.22 
 
 		 607 aa  769    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.213403 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1224  GTP-binding protein TypA  60.1 
 
 		 605 aa  757    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4394  GTP-binding protein  67.97 
 
 		 607 aa  850    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0077  GTP-binding protein TypA  52.45 
 
 		 602 aa  639    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2303  GTP-binding protein TypA  52.21 
 
 		 610 aa  635    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0308778  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1027  GTP-binding protein TypA  63.18 
 
 		 608 aa  792    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1024  GTP-binding protein TypA  65.2 
 
 		 623 aa  836    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5850  GTP-binding protein TypA/BipA  67.27 
 
 		 605 aa  842    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0948932  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3415  virulence regulator BipA  68.19 
 
 		 604 aa  858    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.349187 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1771  GTP-binding protein TypA  63.38 
 
 		 608 aa  793    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.374634  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1748  GTP-binding protein TypA  63.38 
 
 		 608 aa  793    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.623717  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0417  GTP-binding protein  66.23 
 
 		 616 aa  811    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0525699  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0413  GTP-binding protein TypA  67.16 
 
 		 603 aa  848    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0306  GTP-binding protein TypA  68.3 
 
 		 603 aa  861    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.562357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3718  GTP-binding protein TypA  68.3 
 
 		 603 aa  861    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0253074 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0941  GTP-binding protein TypA  67.38 
 
 		 602 aa  852    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0324  GTP-binding protein TypA  66.67 
 
 		 603 aa  843    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000010951  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0339  GTP-binding protein TypA  64.71 
 
 		 608 aa  813    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0649933 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1389  GTP-binding protein TypA  63.5 
 
 		 608 aa  796    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67560  GTP-binding protein TypA/BipA  66.78 
 
 		 605 aa  834    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.24734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2993  GTP-binding protein TypA  57.95 
 
 		 608 aa  719    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0818072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2746  GTP-binding protein TypA  57.75 
 
 		 607 aa  706    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.163334  normal  0.214192 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1063  GTP-binding protein TypA/BipA  65.79 
 
 		 602 aa  804    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4138  GTP-binding protein TypA  65.91 
 
 		 606 aa  821    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.781613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0293  GTP-binding protein TypA  67.05 
 
 		 607 aa  854    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0644132  hitchhiker  0.0000110369 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1507  GTP-binding protein TypA  63.18 
 
 		 608 aa  792    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0153  GTP-binding protein TypA  62.97 
 
 		 605 aa  788    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.143377  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1545  GTP-binding protein TypA  64.81 
 
 		 611 aa  821    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0301  GTP-binding protein TypA  68.14 
 
 		 603 aa  857    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00567265 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0013  GTP-binding protein TypA/BipA  51.88 
 
 		 602 aa  636    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3506  GTP-binding protein TypA  54.5 
 
 		 601 aa  655    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000140002  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>