122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4025 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4025  protein of unknown function DUF453  100 
 
 		 367 aa  734    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.425768  normal  0.0966594 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0328  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  58.24 
 
 		 370 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0480492  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31290  FldA-like protein  57.42 
 
 		 360 aa  388  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5177  protein of unknown function DUF453  54.14 
 
 		 372 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.841395  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0878  hypothetical protein  53.59 
 
 		 372 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.393363 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0988  hypothetical protein  53.87 
 
 		 387 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.375128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3889  hypothetical protein  53.53 
 
 		 365 aa  367  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2090  hypothetical protein  53.97 
 
 		 363 aa  363  2e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3205  hypothetical protein  53.72 
 
 		 361 aa  358  9e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376618 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2033  hypothetical protein  52.53 
 
 		 389 aa  355  6.999999999999999e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2026  hypothetical protein  53.15 
 
 		 370 aa  354  2e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.857271  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2513  hypothetical protein  53.17 
 
 		 361 aa  353  4e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3941  hypothetical protein  51.81 
 
 		 362 aa  349  5e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4451  hypothetical protein  50.54 
 
 		 388 aa  345  5e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0113192 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1360  hypothetical protein  50.55 
 
 		 363 aa  342  7e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.113609 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2818  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  51.38 
 
 		 352 aa  338  9.999999999999999e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0174979  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03236  FldA  50.69 
 
 		 351 aa  335  7e-91  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3706  hypothetical protein  52.29 
 
 		 382 aa  335  7.999999999999999e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0396378 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3209  hypothetical protein  49.45 
 
 		 369 aa  332  5e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3362  protein of unknown function DUF453  49.06 
 
 		 395 aa  315  7e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3577  hypothetical protein  46.54 
 
 		 359 aa  296  5e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.353102  normal  0.06186 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0792  hypothetical protein  44.32 
 
 		 350 aa  295  6e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.533425  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2873  protein of unknown function DUF453  44.32 
 
 		 350 aa  295  8e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0200218  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0796  hypothetical protein  44.32 
 
 		 350 aa  295  8e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.872175  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2893  hypothetical protein  44.32 
 
 		 350 aa  295  8e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.210089 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0873  hypothetical protein  44.32 
 
 		 350 aa  294  1e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2588  hypothetical protein  44.32 
 
 		 350 aa  295  1e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0823  hypothetical protein  44.32 
 
 		 350 aa  294  2e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.581704  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1912  hypothetical protein  43.33 
 
 		 353 aa  292  7e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0107057  normal  0.39316 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1269  hypothetical protein  45.88 
 
 		 361 aa  292  7e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3163  hypothetical protein  45.56 
 
 		 359 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3805  hypothetical protein  44.23 
 
 		 707 aa  284  2.0000000000000002e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.245031  normal  0.613822 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1574  hypothetical protein  44.32 
 
 		 359 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00346083  normal  0.58422 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4551  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  43.41 
 
 		 684 aa  280  3e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2422  hypothetical protein  43.18 
 
 		 698 aa  277  2e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403526 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2055  hypothetical protein  44.9 
 
 		 359 aa  275  8e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3685  hypothetical protein  44.9 
 
 		 370 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0163  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  41.42 
 
 		 394 aa  263  3e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1879  hypothetical protein  37.85 
 
 		 357 aa  253  3e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0299  hypothetical protein  40.83 
 
 		 375 aa  238  2e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.216754 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2156  protein of unknown function DUF453  34.2 
 
 		 378 aa  216  4e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.738715 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3607  hypothetical protein  38.28 
 
 		 402 aa  204  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.538946 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1266  hypothetical protein  36.34 
 
 		 384 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0497  hypothetical protein  34.54 
 
 		 382 aa  179  5.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1048  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  34.38 
 
 		 403 aa  172  9e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0956088  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4989  hypothetical protein  35.17 
 
 		 386 aa  168  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184976 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4311  protein of unknown function DUF453  41.06 
 
 		 381 aa  164  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05387  DUF453 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G00360)  33.33 
 
 		 386 aa  163  4.0000000000000004e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.328727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4264  hypothetical protein  31.85 
 
 		 386 aa  157  3e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.471558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3025  AcnD-accessory protein PrpF  32.24 
 
 		 392 aa  150  3e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1938  AcnD-accessory protein PrpF  34.33 
 
 		 396 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000190692 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003391  PrpF protein involved in 2-methylcitrate cycle  31.74 
 
 		 398 aa  148  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0144  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  32.66 
 
 		 396 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.599836 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1633  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  33.75 
 
 		 400 aa  147  4.0000000000000006e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.886467  normal  0.162569 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02394  hypothetical protein  31.9 
 
 		 395 aa  146  4.0000000000000006e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4839  putative AcnD-accessory protein PrpF  32.58 
 
 		 396 aa  146  5e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.805886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5386  AcnD-accessory protein PrpF  32.58 
 
 		 396 aa  146  6e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5347  PrpF, AcnD-accessory  32.58 
 
 		 396 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5514  putative AcnD-accessory protein PrpF  32.58 
 
 		 396 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.205099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4758  AcnD-accessory protein PrpF  32.58 
 
 		 396 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680432  normal  0.849892 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1867  hypothetical protein  32.58 
 
 		 396 aa  145  9e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1739  AcnD-accessory protein PrpF  32.58 
 
 		 396 aa  145  9e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0876  hypothetical protein  32.58 
 
 		 396 aa  145  9e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.313438  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1163  hypothetical protein  32.58 
 
 		 396 aa  145  9e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0385  AcnD-accessory protein PrpF  32.58 
 
 		 396 aa  145  9e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.957828  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2140  hypothetical protein  32.58 
 
 		 396 aa  145  9e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2081  AcnD-accessory protein PrpF  33.75 
 
 		 400 aa  145  9e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.37249  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2337  hypothetical protein  33.5 
 
 		 396 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.634826  hitchhiker  0.0000401834 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2088  hypothetical protein  33.67 
 
 		 396 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.751396  hitchhiker  0.00406176 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0291  AcnD-accessory protein PrpF  32.58 
 
 		 396 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.369518  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3290  AcnD-accessory protein PrpF  32.33 
 
 		 396 aa  145  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0625802 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3433  putative AcnD-accessory protein PrpF  33.25 
 
 		 396 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0190696  normal  0.395139 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23250  acnD accessory protein  33.33 
 
 		 397 aa  144  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4725  hypothetical protein  33.42 
 
 		 395 aa  143  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.574753  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6709  AcnD-accessory protein PrpF  32.25 
 
 		 391 aa  143  6e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3858  AcnD-accessory protein PrpF  32.58 
 
 		 395 aa  142  8e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.502527 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3972  AcnD-accessory protein PrpF  32.58 
 
 		 395 aa  142  8e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.222737 
 
 
-
 
NC_003296  RS03003  hypothetical protein  32.17 
 
 		 396 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53980  hypothetical protein  33.17 
 
 		 395 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2083  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  31.84 
 
 		 410 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.327922  normal  0.0837253 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3586  AcnD-accessory protein PrpF  32.66 
 
 		 398 aa  140  3.9999999999999997e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.716521  normal  0.0110603 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2186  AcnD-accessory protein PrpF  32 
 
 		 436 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03373  putative AcnD-accessory protein PrpF  31 
 
 		 409 aa  140  4.999999999999999e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2602  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  31.91 
 
 		 392 aa  140  4.999999999999999e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000005222  hitchhiker  0.0000122233 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0163  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  28.15 
 
 		 373 aa  139  7e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1778  AcnD-accessory protein PrpF  32.42 
 
 		 396 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.152698  hitchhiker  0.00100052 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0342  hypothetical protein  31.67 
 
 		 397 aa  138  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1823  putative AcnD-accessory protein PrpF  30.67 
 
 		 389 aa  138  1e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.458437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2300  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  32.67 
 
 		 395 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.763131  normal  0.15946 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6079  AcnD-accessory protein PrpF  32.1 
 
 		 395 aa  136  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.552209 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2319  putative AcnD-accessory protein PrpF  32.76 
 
 		 426 aa  136  5e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2290  hypothetical protein  32.75 
 
 		 396 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.099053  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1811  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  31.76 
 
 		 397 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.232112  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1860  putative AcnD-accessory protein PrpF  30.3 
 
 		 389 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3647  putative AcnD-accessory protein PrpF  31.67 
 
 		 397 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02726  probable AcnD-accessory protein PrpF  31.88 
 
 		 386 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4050  putative AcnD-accessory protein PrpF  31.77 
 
 		 407 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4024  putative AcnD-accessory protein PrpF  30.96 
 
 		 407 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3948  AcnD-accessory protein PrpF  31.2 
 
 		 407 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1667  PrpF, AcnD-accessory  30.63 
 
 		 398 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.870319  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>