134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2665 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2665  Soluble ligand binding domain protein  100 
 
 		 275 aa  553  1e-156  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.436748  normal  0.303362 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6308  Soluble ligand binding domain protein  40.65 
 
 		 276 aa  192  7e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.611613 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0066  polysaccharide export protein  38.43 
 
 		 275 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.200434 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6397  Soluble ligand binding domain protein  32.17 
 
 		 265 aa  147  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.141277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2358  polysaccharide export periplasmic protein  32.73 
 
 		 263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4765  polysaccharide export periplasmic protein  33.58 
 
 		 281 aa  145  9e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00350662  normal  0.271358 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2077  polysaccharide export protein  34.87 
 
 		 260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00598024  normal  0.432742 
 
 
-
 
NC_002950  PG0437  BexD/CtrA/VexA family polysaccharide export protein  34.4 
 
 		 307 aa  134  9.999999999999999e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0250029 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4354  Soluble ligand binding domain protein  35.44 
 
 		 266 aa  134  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.76847 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0727  polysaccharide export protein  31.14 
 
 		 276 aa  131  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.567222  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10728  polysaccharide export outer membrane protein  30.23 
 
 		 283 aa  120  1.9999999999999998e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4088  polysaccharide export protein  31.36 
 
 		 266 aa  119  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.142355 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2287  polysaccharide export protein  29.89 
 
 		 254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0361  polysaccharide export protein  27.04 
 
 		 263 aa  92.8  6e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3890  polysaccharide export system outer membrane protein  32.05 
 
 		 264 aa  90.1  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0845  polysaccharide export protein  27.38 
 
 		 253 aa  89.4  7e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.700264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0879  polysaccharide export outer membrane protein  29.52 
 
 		 250 aa  86.7  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.146875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2882  polysaccharide export protein  27.14 
 
 		 247 aa  75.1  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000309988  normal  0.0604046 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07225  polysaccharide export protein, BexD/CtrA/VexA family protein  30.82 
 
 		 257 aa  67  0.0000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0253  polysaccharide export protein  26.28 
 
 		 367 aa  61.6  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.138137  decreased coverage  0.000559198 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1925  polysaccharide export protein  27.85 
 
 		 372 aa  61.6  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3242  polysaccharide export protein  32.17 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0609  polysaccharide export protein  28.02 
 
 		 358 aa  60.1  0.00000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.278241 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0647  polysaccharide export system, outer membrane component  27.43 
 
 		 358 aa  58.9  0.00000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428631 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2026  polysaccharide export protein  31.89 
 
 		 270 aa  58.2  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6173  polysaccharide export protein  26.17 
 
 		 391 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.371162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5905  polysaccharide export protein  26.17 
 
 		 385 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.438446  normal  0.224196 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1189  polysaccharide export protein  27.07 
 
 		 387 aa  57.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0734  polysaccharide export protein  31.34 
 
 		 192 aa  57.8  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0580696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2909  polysaccharide export protein  32.14 
 
 		 446 aa  57  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.723004  hitchhiker  0.000339784 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3189  polysaccharide export protein  26.75 
 
 		 392 aa  57  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.32554  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3274  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.5 
 
 		 446 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1352  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  28.47 
 
 		 396 aa  57  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3222  polysaccharide biosynthesis/export protein  27.78 
 
 		 400 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7400  polysaccharide export protein  29.17 
 
 		 391 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.471372 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3260  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.63 
 
 		 422 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.14085  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4309  polysaccharide export protein  28.67 
 
 		 495 aa  55.8  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4241  polysaccharide export protein  29.7 
 
 		 417 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.238114 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2273  polysaccharide export protein  29.13 
 
 		 392 aa  54.7  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.534811  normal  0.26202 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4540  polysaccharide export protein  28.35 
 
 		 387 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0169971  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3823  polysaccharide export protein  28.35 
 
 		 387 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5549  polysaccharide export protein  28.35 
 
 		 392 aa  53.9  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1092  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  27.27 
 
 		 386 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4601  polysaccharide export protein  27.66 
 
 		 473 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.930879 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3701  polysaccharide export protein  28.35 
 
 		 392 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3726  polysaccharide export protein  28.35 
 
 		 392 aa  53.9  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489348  normal  0.448229 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0799  polysaccharide export protein  29.93 
 
 		 393 aa  53.5  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1099  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  26.7 
 
 		 386 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0031657  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2613  polysaccharide export protein  26.7 
 
 		 379 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.139508 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2332  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  26.7 
 
 		 386 aa  53.5  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.132677  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00986  predicted exopolysaccharide export protein  26.7 
 
 		 379 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2660  polysaccharide export protein  26.7 
 
 		 379 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00993  hypothetical protein  26.7 
 
 		 379 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1219  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  26.7 
 
 		 379 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1463  putative polysaccharide export protein  28 
 
 		 352 aa  52.4  0.000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.24713e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2133  polysaccharide export protein  25.94 
 
 		 375 aa  51.6  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1118  polysaccharide export protein  26.75 
 
 		 426 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1559  polysaccharide export protein  28.11 
 
 		 392 aa  51.2  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.053083  normal  0.0507525 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4916  polysaccharide export protein  27.27 
 
 		 397 aa  51.2  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.713407  hitchhiker  0.000554375 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1958  polysaccharide export protein  25.13 
 
 		 407 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.676148  normal  0.565154 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1877  polysaccharide export protein  37.14 
 
 		 281 aa  50.8  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6483  polysaccharide export protein  26.11 
 
 		 426 aa  50.8  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.45057 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0619  polysaccharide export protein  23.42 
 
 		 376 aa  50.4  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112684  normal  0.159669 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2734  capsular polysaccharide export protein, putative  29.37 
 
 		 276 aa  50.1  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0365414 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1224  polysaccharide export protein  28.36 
 
 		 191 aa  49.7  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2243  polysaccharide (EPS I) exporter  24.1 
 
 		 407 aa  49.3  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0548899  normal  0.73055 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2894  polysaccharide export protein  26.49 
 
 		 377 aa  49.7  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0993342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1903  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 221 aa  48.9  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1312  polysaccharide export protein  27.61 
 
 		 191 aa  48.9  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2344  polysaccharide biosynthesis/export protein  24.18 
 
 		 379 aa  48.9  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.675285  normal  0.855008 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2458  polysaccharide biosynthesis/export protein  24.18 
 
 		 379 aa  48.9  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0550214 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1795  polysaccharide export outer membrane protein  28.37 
 
 		 264 aa  48.5  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0915  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  26.02 
 
 		 396 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.138032  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0546  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  28.18 
 
 		 396 aa  48.5  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5118  polysaccharide export protein  24.18 
 
 		 348 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.898445  normal  0.024948 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1665  polysaccharide export protein  27.61 
 
 		 189 aa  48.5  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2620  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  26.02 
 
 		 391 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2482  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  26.02 
 
 		 391 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.153813  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2300  polysaccharide biosynthesis/export protein  24.18 
 
 		 348 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.631767  normal  0.480899 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2351  polysaccharide biosynthesis/export protein  24.18 
 
 		 351 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2243  polysaccharide biosynthesis/export protein  24.18 
 
 		 348 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1296  polysaccharide export protein  25.47 
 
 		 378 aa  47.8  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.660258  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1712  polysaccharide export protein  23.66 
 
 		 386 aa  47.4  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.69321  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2254  putative polysaccharide export protein  31.62 
 
 		 385 aa  48.1  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.732758 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02478  polysaccharide export periplasmic protein  38.14 
 
 		 153 aa  47.8  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01968  lipoprotein required for capsular polysaccharide translocation through the outer membrane  25.54 
 
 		 379 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1595  polysaccharide export protein  25.54 
 
 		 379 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.249253  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4169  polysaccharide export protein  22.61 
 
 		 423 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.95415  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4197  polysaccharide export protein  22.61 
 
 		 423 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.937901 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2355  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.54 
 
 		 379 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3036  polysaccharide export protein  25.47 
 
 		 378 aa  47.4  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1579  polysaccharide export protein  25.54 
 
 		 379 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.479279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1000  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.54 
 
 		 379 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3319  polysaccharide export protein  22.61 
 
 		 383 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00116836  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01957  hypothetical protein  25.54 
 
 		 379 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1170  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.54 
 
 		 379 aa  47.4  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2997  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.54 
 
 		 379 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0597184 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4429  polysaccharide export protein  23.35 
 
 		 374 aa  46.6  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.145769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3000  polysaccharide export protein  31.31 
 
 		 186 aa  47  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.912736  normal  0.44921 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30130  Polysaccharide export protein  25.11 
 
 		 379 aa  46.6  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>