298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1729 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1729  Threonine aldolase  100 
 
 		 343 aa  705    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.446616  normal  0.527107 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4745  Threonine aldolase  64.67 
 
 		 339 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.285459 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3290  Threonine aldolase  56.23 
 
 		 344 aa  363  2e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.170768 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6238  Threonine aldolase  52.28 
 
 		 340 aa  351  1e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08076  L-allo-threonine aldolase  51.23 
 
 		 340 aa  342  4e-93  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00986668  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2554  threonine aldolase  49.09 
 
 		 339 aa  302  7.000000000000001e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1115  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  44.67 
 
 		 344 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0105  threonine aldolase  44.48 
 
 		 344 aa  271  1e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0310789  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0449  Threonine aldolase  42.4 
 
 		 343 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000078963  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3043  Threonine aldolase  46.15 
 
 		 339 aa  268  1e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1039  threonine aldolase  41.76 
 
 		 343 aa  268  1e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1081  threonine aldolase  41.76 
 
 		 343 aa  268  1e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3186  Threonine aldolase  46.63 
 
 		 338 aa  267  2e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.685174  normal  0.935882 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5037  Threonine aldolase  45.59 
 
 		 337 aa  264  1e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.258099 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2168  Threonine aldolase  39.82 
 
 		 349 aa  262  6e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19940  threonine aldolase  43.21 
 
 		 343 aa  262  6e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05668  L-allo-threonine aldolase  44.28 
 
 		 334 aa  259  4e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0706  L-allo-threonine aldolase  45 
 
 		 343 aa  258  7e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1686  threonine aldolase  45.45 
 
 		 356 aa  258  1e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.782503 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1451  threonine aldolase  45.99 
 
 		 345 aa  257  2e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0328469  normal  0.0951386 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2367  L-threonine aldolase  44.11 
 
 		 359 aa  255  8e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3444  Threonine aldolase  43.47 
 
 		 359 aa  254  2.0000000000000002e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0251232 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0796  L-threonine aldolase  45.59 
 
 		 340 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.199246  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0206  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  41.74 
 
 		 345 aa  252  8.000000000000001e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1036  threonine aldolase  41.12 
 
 		 344 aa  251  1e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000046  low-specificity L-threonine aldolase  43.99 
 
 		 334 aa  251  1e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3255  threonine aldolase  40.86 
 
 		 348 aa  248  8e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.248349 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3162  L-allo-threonine aldolase  47.09 
 
 		 348 aa  248  1e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3740  threonine aldolase  43.86 
 
 		 343 aa  247  2e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.848875 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1281  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  43.21 
 
 		 348 aa  246  3e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3482  threonine aldolase  42.68 
 
 		 343 aa  246  4e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.022519 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3604  threonine aldolase  45.48 
 
 		 355 aa  246  6e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.51138  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0544  L-threonine aldolase  41.37 
 
 		 341 aa  245  6.999999999999999e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.697655 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2292  threonine aldolase  43.49 
 
 		 337 aa  244  1.9999999999999999e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.899538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_161  threonine aldolase  44.21 
 
 		 344 aa  243  3.9999999999999997e-63  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1282  Threonine aldolase  44.1 
 
 		 357 aa  242  5e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.12103  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3338  L-allo-threonine aldolase  44.21 
 
 		 337 aa  242  7.999999999999999e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3317  Threonine aldolase  45.94 
 
 		 338 aa  242  7.999999999999999e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0218  L-threonine aldolase  43.03 
 
 		 344 aa  241  1e-62  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5968  Threonine aldolase  44.92 
 
 		 335 aa  240  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.904259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0228  Threonine aldolase  42.34 
 
 		 353 aa  241  2e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1208  L-threonine aldolase  44.51 
 
 		 337 aa  239  5e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000586474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1663  L-threonine aldolase  44.18 
 
 		 338 aa  239  5.999999999999999e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.469796  normal  0.726429 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5364  threonine aldolase  43.38 
 
 		 337 aa  238  9e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2053  Threonine aldolase  43.73 
 
 		 349 aa  238  1e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2462  threonine aldolase  43.98 
 
 		 336 aa  238  1e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000261845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6047  Threonine aldolase  40.79 
 
 		 348 aa  236  4e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2673  threonine aldolase  43.79 
 
 		 337 aa  236  4e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000371505  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4817  threonine aldolase  43.29 
 
 		 337 aa  236  4e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3094  L-threonine aldolase  43.47 
 
 		 331 aa  236  4e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.646059  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0178  L-threonine aldolase  43.69 
 
 		 337 aa  236  6e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5386  threonine aldolase  43.69 
 
 		 337 aa  235  6e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5475  threonine aldolase  43.69 
 
 		 337 aa  235  6e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.309073  normal  0.398909 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0699  threonine aldolase  42.55 
 
 		 353 aa  236  6e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1781  Threonine aldolase  42.51 
 
 		 337 aa  235  8e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1448  L-threonine aldolase  43.58 
 
 		 339 aa  235  9e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5192  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  41.98 
 
 		 348 aa  235  9e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.281509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4794  threonine aldolase  43.38 
 
 		 337 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.331333  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1841  threonine aldolase, low-specificity  44.31 
 
 		 334 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3557  threonine aldolase  44.31 
 
 		 334 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.443725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0582  L-allo-threonine aldolase  41.74 
 
 		 366 aa  234  1.0000000000000001e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.519824  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1278  L-threonine aldolase  43.9 
 
 		 337 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000270333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3310  threonine aldolase  43.08 
 
 		 337 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.124779  normal  0.12149 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3480  Threonine aldolase  45.06 
 
 		 339 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000277913 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1207  L-threonine aldolase  43.9 
 
 		 337 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000862399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3169  threonine aldolase  42.23 
 
 		 337 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000533874  unclonable  0.00000438048 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0639  L-threonine aldolase  44.09 
 
 		 354 aa  233  4.0000000000000004e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3011  threonine aldolase  42.11 
 
 		 337 aa  232  5e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000665478  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4651  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  41.52 
 
 		 347 aa  233  5e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.542554 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1352  Threonine aldolase  42.23 
 
 		 337 aa  233  5e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000809376  unclonable  0.00000000000146629 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0162  threonine aldolase  42.37 
 
 		 343 aa  232  6e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.687717  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0734  threonine aldolase  43.11 
 
 		 359 aa  232  6e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0270  L-threonine aldolase  44.38 
 
 		 339 aa  232  7.000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0162  L-threonine aldolase  45.32 
 
 		 367 aa  232  8.000000000000001e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3026  threonine aldolase  43.6 
 
 		 337 aa  232  8.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000104832  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2147  L-allo-threonine aldolase  43.25 
 
 		 461 aa  232  9e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4454  L-threonine aldolase  43.54 
 
 		 370 aa  231  1e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2204  L-threonine aldolase  44 
 
 		 335 aa  230  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.41723 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3793  threonine aldolase  42.77 
 
 		 334 aa  230  3e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.912828 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5114  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  40.91 
 
 		 347 aa  230  3e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.967203  normal  0.703478 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3418  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  44.75 
 
 		 339 aa  229  4e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1347  threonine aldolase  41.72 
 
 		 336 aa  229  5e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000974839  decreased coverage  0.000000417727 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2826  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  39.09 
 
 		 352 aa  229  5e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2205  threonine aldolase  39.66 
 
 		 337 aa  229  7e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250112  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2904  L-threonine aldolase  44.88 
 
 		 334 aa  228  9e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0643317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2345  threonine aldolase  41.69 
 
 		 337 aa  228  1e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0430  low-specificity L-threonine aldolase  42.46 
 
 		 337 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1834  L-allo-threonine aldolase  42.46 
 
 		 337 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0852562  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1776  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  39.63 
 
 		 360 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4076  threonine aldolase  40.46 
 
 		 361 aa  227  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0000453005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0337  low-specificity L-threonine aldolase  42.46 
 
 		 337 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.400783  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0834  L-allo-threonine aldolase  42.46 
 
 		 337 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0108221  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0576  Threonine aldolase  46.57 
 
 		 352 aa  226  3e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1771  L-allo-threonine aldolase  42.46 
 
 		 397 aa  226  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.444188  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1142  threonine aldolase  42.94 
 
 		 338 aa  226  3e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000636367  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1125  L-allo-threonine aldolase  42.46 
 
 		 397 aa  226  4e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.628839  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2098  L-allo-threonine aldolase  42.33 
 
 		 458 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1031  L-threonine aldolase  42.26 
 
 		 333 aa  225  8e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1602  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  39.88 
 
 		 371 aa  225  8e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.932137  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2772  Threonine aldolase  42.56 
 
 		 333 aa  225  9e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.826971  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>