More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1286 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1286  response regulator receiver protein  100 
 
 		 149 aa  305  1.0000000000000001e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5086  response regulator receiver protein  55.88 
 
 		 150 aa  157  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00855008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5222  response regulator receiver protein  34.07 
 
 		 160 aa  85.1  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4150  response regulator receiver protein  35.56 
 
 		 160 aa  81.6  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1229  response regulator receiver protein  30.37 
 
 		 154 aa  76.3  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.22981 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4374  response regulator receiver protein  32.37 
 
 		 155 aa  72  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00391963  normal  0.990358 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0153  response regulator receiver protein  28.46 
 
 		 160 aa  71.2  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.364118  hitchhiker  0.0000231464 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0039  response regulator receiver protein  34.53 
 
 		 149 aa  70.9  0.000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.138289 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0540  response regulator receiver protein  32.35 
 
 		 153 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4269  response regulator receiver protein  32.35 
 
 		 153 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.306283 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2664  response regulator receiver protein  31.82 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.213222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3142  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 164 aa  68.2  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.460947  normal  0.158986 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1795  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.225692 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2205  response regulator receiver protein  30.5 
 
 		 153 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0837995  normal  0.255714 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2794  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 155 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.531019 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0679  response regulator receiver protein  32.56 
 
 		 144 aa  67.4  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.145382  normal  0.0176538 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2451  response regulator receiver  30.3 
 
 		 148 aa  66.2  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.694561  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3060  response regulator receiver protein  29.1 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.527476  hitchhiker  0.00457067 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4005  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.33 
 
 		 696 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2726  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 145 aa  65.9  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1813  response regulator receiver protein  31.39 
 
 		 156 aa  63.5  0.0000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1998  response regulator receiver protein  29.77 
 
 		 140 aa  63.9  0.0000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2131  response regulator receiver protein  31.06 
 
 		 148 aa  63.5  0.0000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.159262  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2409  response regulator receiver protein  28.76 
 
 		 151 aa  63.5  0.0000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4644  response regulator receiver protein  31.03 
 
 		 145 aa  63.5  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0382992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1406  response regulator receiver protein  34.51 
 
 		 121 aa  62.8  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0894387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1811  response regulator receiver protein  30.88 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.121023 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0043  response regulator receiver protein  30.37 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.304768 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0902  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.63 
 
 		 718 aa  63.2  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.651526  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2355  response regulator receiver protein  31.85 
 
 		 153 aa  62  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.484722 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1955  response regulator receiver protein  31.85 
 
 		 153 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.205931  normal  0.0730175 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1283  response regulator receiver protein  31.88 
 
 		 153 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0282174 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2298  response regulator receiver domain-containing protein  29.32 
 
 		 146 aa  62  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.12586  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3340  response regulator receiver protein  31.85 
 
 		 153 aa  62  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3379  response regulator receiver protein  31.91 
 
 		 151 aa  61.6  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.100114  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7209  response regulator receiver protein  28.78 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.768943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1850  response regulator receiver protein  34.78 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.549411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2604  response regulator receiver and unknown domain protein  29.41 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0557258 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4198  response regulator receiver domain-containing protein  28.67 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3542  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.09 
 
 		 590 aa  61.2  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0796  response regulator receiver protein  35.19 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.292352 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1189  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.67 
 
 		 971 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0384  response regulator receiver protein  32.35 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.499029 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02505  putative response regulator  30.43 
 
 		 306 aa  60.5  0.000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0163  response regulator receiver domain-containing protein  27.78 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4452  response regulator receiver domain-containing protein  32.26 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0507  response regulator receiver protein  29.57 
 
 		 299 aa  60.1  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2198  response regulator receiver protein  29.29 
 
 		 152 aa  60.1  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.718868  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3011  response regulator receiver protein  33.09 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0415054  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2360  response regulator receiver protein  31.25 
 
 		 523 aa  59.3  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1757  response regulator receiver  31.88 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.282821  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01274  putative two-component response regulator  30.56 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1899  response regulator receiver protein  30.23 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.727216  normal  0.206125 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2205  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.75 
 
 		 887 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.188088 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1860  two component LuxR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 235 aa  58.2  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2404  response regulator receiver  31.18 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0437246 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0092  response regulator receiver protein  29.41 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2556  DNA-binding transcriptional activator DcuR  29.58 
 
 		 239 aa  58.5  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.109677 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4239  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 126 aa  58.2  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4222  response regulator receiver protein  25.19 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1192  response regulator receiver domain-containing protein  31.82 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0582118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1643  two component LuxR family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 219 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.118638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2566  two component signal transduction response regulator  28.26 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3426  response regulator receiver protein  30.26 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0768314  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0554  response regulator receiver protein  29.2 
 
 		 156 aa  57.4  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0833  response regulator  30.09 
 
 		 389 aa  57.4  0.00000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.106584  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1115  response regulator receiver protein  30.3 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2540  response regulator receiver protein  28.89 
 
 		 150 aa  57  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1869  response regulator receiver protein  25.69 
 
 		 146 aa  57  0.00000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.124922  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3434  response regulator receiver protein  28.78 
 
 		 146 aa  57  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0662678 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2153  response regulator receiver protein  35 
 
 		 167 aa  57  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0689732  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3513  response regulator receiver domain-containing protein  31.39 
 
 		 150 aa  57  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.126367  normal  0.123274 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5179  response regulator receiver protein  26.45 
 
 		 292 aa  57  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.172349 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4229  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 219 aa  57  0.00000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.720334  normal  0.28913 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0847  two component diguanylate cyclase  30.17 
 
 		 327 aa  57  0.00000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3627  response regulator receiver protein  32.11 
 
 		 129 aa  57  0.00000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0857805 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1826  response regulator receiver domain-containing protein  30.37 
 
 		 148 aa  57  0.00000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3486  response regulator receiver protein  27.69 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1055  two component signal transduction response regulator  31.03 
 
 		 734 aa  56.2  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0148851  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3002  putative PAS/PAC sensor protein  35.4 
 
 		 469 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.345319  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5579  response regulator receiver protein  32.22 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2385  response regulator receiver domain-containing protein  25.4 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.849023  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2718  response regulator receiver protein  26.35 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.50209 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2528  response regulator receiver protein  28.28 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4153  response regulator receiver protein  27.27 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0782  response regulator receiver protein  30.5 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00636968  normal  0.0949177 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1597  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.15 
 
 		 860 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.711633  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0449  response regulator receiver protein  36.25 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2840  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 486 aa  55.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3261  response regulator  38.46 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2013  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.09 
 
 		 801 aa  55.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0991  response regulator receiver protein  29.69 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.221744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0539  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.51 
 
 		 816 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.146269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3967  putative response regulator of a two-component system  30.7 
 
 		 335 aa  55.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000645274  normal  0.0110626 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0753  response regulator receiver protein  27.66 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1617  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.15 
 
 		 860 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5389  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  30.91 
 
 		 372 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2532  response regulator receiver protein  24.82 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0981  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.4 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5264  response regulator receiver protein  32.05 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>