102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_28040 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_28040  dihydrofolate reductase  100 
 
 
183 aa  367  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.160923  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0541  bifunctional deaminase-reductase domain protein  54.1 
 
 
185 aa  190  1e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.932074 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4615  bifunctional deaminase-reductase domain protein  53.85 
 
 
193 aa  185  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.308446 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0204  bifunctional deaminase-reductase domain protein  53.3 
 
 
186 aa  179  2e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.171456 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0339  bifunctional deaminase-reductase domain protein  49.45 
 
 
188 aa  164  5.9999999999999996e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.183511 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5832  deaminase-reductase domain-containing protein  45.25 
 
 
187 aa  152  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0230  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  51.93 
 
 
184 aa  152  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.864535  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2749  bifunctional deaminase-reductase domain protein  50.56 
 
 
191 aa  150  8e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0206598 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3417  bifunctional deaminase-reductase domain protein  45.86 
 
 
186 aa  130  7.999999999999999e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3231  deaminase-reductase domain-containing protein  40.86 
 
 
199 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.134555 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5158  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.8 
 
 
187 aa  108  5e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1598  bifunctional deaminase-reductase-like protein  39.34 
 
 
188 aa  106  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.127756  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1622  deaminase-reductase domain-containing protein  39.34 
 
 
188 aa  106  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1568  deaminase-reductase domain-containing protein  38.71 
 
 
188 aa  106  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1407  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.77 
 
 
190 aa  98.6  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.436948  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3158  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.41 
 
 
188 aa  93.6  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3441  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.26 
 
 
188 aa  92.4  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3644  hypothetical protein  38.25 
 
 
190 aa  92  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0435  deaminase-reductase domain-containing protein  33.71 
 
 
190 aa  80.1  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3362  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.95 
 
 
186 aa  79.7  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.543985  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3200  deaminase-reductase domain-containing protein  33.33 
 
 
176 aa  77.8  0.00000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0841  hypothetical protein  32.24 
 
 
189 aa  77  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3987  bifunctional deaminase-reductase-like  31.17 
 
 
177 aa  74.3  0.0000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.68682  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0402  dihydrofolate reductase (DHFR)  27.53 
 
 
185 aa  73.9  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.166347  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0711  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.69 
 
 
176 aa  73.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0366042  normal  0.491773 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25630  dihydrofolate reductase  32.29 
 
 
196 aa  73.9  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.258312 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0878  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.55 
 
 
183 aa  73.2  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00263452 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0489  deaminase-reductase domain-containing protein  31.69 
 
 
176 aa  72  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.684638  normal  0.846398 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1605  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.23 
 
 
187 aa  71.2  0.000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.184387  normal  0.0697027 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2196  bifunctional deaminase-reductase-like  34.39 
 
 
183 aa  68.6  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4567  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.57 
 
 
176 aa  68.2  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.677166 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.44 
 
 
189 aa  67  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.49 
 
 
188 aa  65.9  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840105  normal  0.042227 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2243  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.65 
 
 
184 aa  63.9  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0952608  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1753  dihydrofolate reductase  25.86 
 
 
182 aa  62.8  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2386  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.62 
 
 
192 aa  62.8  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.385756 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1055  deaminase-reductase domain-containing protein  31.75 
 
 
175 aa  59.7  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4299  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.82 
 
 
188 aa  60.1  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293289  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5174  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.05 
 
 
187 aa  60.1  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1417  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.95 
 
 
187 aa  60.1  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291407  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.43 
 
 
187 aa  58.9  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.898411  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4888  deaminase-reductase domain-containing protein  34.95 
 
 
187 aa  58.5  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.600343 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0206  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.48 
 
 
187 aa  57.8  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  31.69 
 
 
183 aa  57  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.49 
 
 
188 aa  57  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4632  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.37 
 
 
183 aa  56.6  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.170903  normal  0.134226 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0235  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.34 
 
 
185 aa  56.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.574714  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3071  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.15 
 
 
188 aa  56.2  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3049  dihydrofolate reductase  22.86 
 
 
177 aa  55.1  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.611041  normal  0.73255 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3320  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.8 
 
 
182 aa  54.7  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1444  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.41 
 
 
209 aa  53.5  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.87184  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4932  deaminase-reductase domain-containing protein  37.75 
 
 
182 aa  53.1  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.916718  normal  0.605792 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1658  hypothetical protein  28.42 
 
 
180 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4283  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.61 
 
 
180 aa  52.4  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.7769  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6952  dihydrofolate reductase  27.37 
 
 
178 aa  51.6  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3264  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.53 
 
 
199 aa  51.6  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.254237 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1507  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  28.73 
 
 
186 aa  51.2  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467899  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6890  putative pyrimidine reductase  29.38 
 
 
179 aa  50.8  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.041344  normal  0.0312743 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1367  deaminase-reductase domain-containing protein  26.96 
 
 
199 aa  50.4  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.474058 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0285  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.14 
 
 
188 aa  50.4  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1348  bifunctional deaminase-reductase-like protein  25.14 
 
 
174 aa  50.1  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6356  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.74 
 
 
177 aa  49.3  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3394  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.26 
 
 
182 aa  48.9  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.836759  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0824  bifunctional deaminase-reductase domain protein  23.18 
 
 
194 aa  48.9  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.308589 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1784  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.98 
 
 
189 aa  48.9  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.577777  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19210  hypothetical protein  27.57 
 
 
180 aa  48.1  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.78523 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4238  deaminase-reductase domain-containing protein  28.57 
 
 
180 aa  48.1  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.472551 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5813  deaminase-reductase domain-containing protein  30.89 
 
 
188 aa  48.1  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3196  bifunctional deaminase-reductase-like  27.72 
 
 
182 aa  47.4  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1408  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.81 
 
 
193 aa  47.4  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.14 
 
 
178 aa  47  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5268  hypothetical protein  28.5 
 
 
194 aa  47  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3264  deaminase-reductase domain-containing protein  27.37 
 
 
180 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.843644  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0483  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.01 
 
 
182 aa  46.6  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5175  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.7 
 
 
219 aa  46.2  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0126564 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11438  bifunctional riboflavin biosynthesis protein ribG: diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase + 5-amino-6-(5-phosphoribosylamino) uracil reductase  30.57 
 
 
339 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00260487  normal  0.1412 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1267  deaminase-reductase domain-containing protein  27.62 
 
 
200 aa  45.4  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.924885  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3753  deaminase-reductase domain-containing protein  28.8 
 
 
182 aa  45.4  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00221324  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1303  deaminase-reductase domain-containing protein  23.94 
 
 
192 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522678  normal  0.528809 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4303  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.87 
 
 
208 aa  45.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.933393  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1391  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.19 
 
 
204 aa  45.4  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.942421  normal  0.0216388 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3191  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.43 
 
 
183 aa  43.9  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1904  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  29.83 
 
 
200 aa  43.9  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0360214  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4641  deaminase-reductase domain-containing protein  33.93 
 
 
199 aa  43.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6617  deaminase-reductase domain-containing protein  28.72 
 
 
188 aa  43.5  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4000  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.54 
 
 
181 aa  43.5  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1734  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.19 
 
 
187 aa  43.1  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.594103  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1817  riboflavin biosynthesis protein RibD  34.02 
 
 
197 aa  43.5  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00433393 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00910  dihydrofolate reductase  28.05 
 
 
183 aa  43.1  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2640  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  27.18 
 
 
187 aa  43.5  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.437336  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.19 
 
 
202 aa  42.7  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.785173  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2088  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30 
 
 
201 aa  42.7  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.810748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1023  bifunctional deaminase-reductase-like protein  28.82 
 
 
178 aa  42.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6250  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.7 
 
 
182 aa  42.4  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0471  deaminase-reductase domain-containing protein  26.26 
 
 
184 aa  42.4  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0146314  normal  0.097517 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.49 
 
 
176 aa  42.4  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4124  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.67 
 
 
181 aa  42  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5731  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  27.41 
 
 
201 aa  41.6  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.617501 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4552  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.35 
 
 
183 aa  41.2  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2386  riboflavin biosynthesis protein RibD  30.13 
 
 
333 aa  41.2  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>