More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_25030 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_1328  ABC transporter related protein  64.85 
 
 		 553 aa  641    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.651131  hitchhiker  0.00125797 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25030  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  100 
 
 		 548 aa  1077    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0889  ABC transporter related  60.22 
 
 		 554 aa  634  1e-180  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1063  ABC transporter related protein  60.86 
 
 		 671 aa  610  1e-173  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2732  ABC transporter related  59.57 
 
 		 552 aa  572  1.0000000000000001e-162  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.107306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4140  ABC transporter related protein  45.74 
 
 		 548 aa  384  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4937  ABC transporter related protein  46.08 
 
 		 566 aa  384  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2154  ABC transporter related protein  45.01 
 
 		 562 aa  375  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.329294 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2616  ABC transporter related  44.71 
 
 		 540 aa  346  6e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22700  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  43.27 
 
 		 600 aa  345  1e-93  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0750  ABC transporter related  39.29 
 
 		 537 aa  263  6.999999999999999e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17540  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  37.93 
 
 		 509 aa  250  4e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.047738  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2588  ABC transporter related protein  38.87 
 
 		 563 aa  238  2e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.338473  hitchhiker  0.00775397 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14250  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  36.36 
 
 		 564 aa  231  3e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0255265  normal  0.0613855 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3277  ABC transporter related  35.98 
 
 		 563 aa  223  8e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2931  ABC transporter related  37.23 
 
 		 561 aa  221  1.9999999999999999e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000604145 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25310  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  34.59 
 
 		 585 aa  219  7e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00340355  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7527  hypothetical protein  38.18 
 
 		 536 aa  218  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.752036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4067  ABC transporter related  36.55 
 
 		 603 aa  211  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01180  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  35.23 
 
 		 583 aa  207  6e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4837  ABC transporter related protein  38.18 
 
 		 551 aa  205  1e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4883  ABC transporter related protein  35.29 
 
 		 546 aa  204  4e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1644  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.74 
 
 		 559 aa  189  9e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1926  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.57 
 
 		 559 aa  189  9e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000896956  normal  0.905041 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4107  ABC transporter related protein  36.41 
 
 		 550 aa  189  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0611048  normal  0.129591 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0909  ABC transporter related  36.98 
 
 		 563 aa  189  1e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2441  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.07 
 
 		 558 aa  189  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00204105  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3350  ABC transporter related  28.8 
 
 		 547 aa  186  7e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1466  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.48 
 
 		 558 aa  182  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000105508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2580  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.54 
 
 		 560 aa  182  2e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.471915  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2991  putative ABC transporter ATP-binding protein  31 
 
 		 559 aa  181  2.9999999999999997e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.187094  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2910  ABC transporter related  31.73 
 
 		 537 aa  181  2.9999999999999997e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.53858 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0768  ABC transporter related  29.32 
 
 		 636 aa  181  2.9999999999999997e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2203  ABC transporter related  31.93 
 
 		 669 aa  180  5.999999999999999e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0893  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.93 
 
 		 560 aa  179  1e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.100195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4779  ABC transporter related  28.95 
 
 		 646 aa  179  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000154774  hitchhiker  0.00318423 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004402  ABC transporter ATP-binding protein  31.34 
 
 		 555 aa  178  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.485845  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6901  ABC transporter, ATP-binding protein  31.55 
 
 		 545 aa  178  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0840  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.87 
 
 		 553 aa  178  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0740  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.34 
 
 		 557 aa  178  3e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1614  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.28 
 
 		 556 aa  178  3e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.682319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0310  ABC transporter related  29.34 
 
 		 649 aa  177  3e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2470  ABC transporter related  28.86 
 
 		 620 aa  177  4e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0276149  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0931  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.84 
 
 		 560 aa  177  5e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3426  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.42 
 
 		 561 aa  177  5e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3883  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.61 
 
 		 559 aa  177  6e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0372  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.16 
 
 		 556 aa  176  8e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1058  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.09 
 
 		 560 aa  176  9e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1361  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.4 
 
 		 561 aa  176  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000127735  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1816  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.64 
 
 		 559 aa  176  9.999999999999999e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.461866  normal  0.0107915 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0904  ABC transporter related  29.96 
 
 		 527 aa  176  9.999999999999999e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.467195  decreased coverage  0.00659199 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2105  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.2 
 
 		 555 aa  176  9.999999999999999e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0493  ABC transporter related  34.28 
 
 		 537 aa  176  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3241  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.46 
 
 		 561 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000308971  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4990  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.65 
 
 		 555 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1024  hypothetical protein  26.29 
 
 		 535 aa  176  9.999999999999999e-43  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3220  ABC transporter related  30.65 
 
 		 653 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000221597  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0758  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.97 
 
 		 557 aa  175  1.9999999999999998e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4939  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.65 
 
 		 555 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0133  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.47 
 
 		 553 aa  175  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0668164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00997  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.53 
 
 		 555 aa  175  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0378  ABC transporter related  26.91 
 
 		 630 aa  175  1.9999999999999998e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1055  ABC transporter related  32.92 
 
 		 542 aa  175  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.242614  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4941  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.65 
 
 		 555 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.963786 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1442  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.73 
 
 		 559 aa  175  1.9999999999999998e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.465539  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0834  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.05 
 
 		 561 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00294599  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1864  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.93 
 
 		 560 aa  175  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.733773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1183  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.39 
 
 		 554 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.976373 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04267  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  31.65 
 
 		 555 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3606  ABC transporter related protein  31.65 
 
 		 555 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0224  ABC transporter, ATP-binding protein  29.14 
 
 		 663 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2242  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.91 
 
 		 553 aa  174  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_200  ABC transporter, ATP-binding protein  29.33 
 
 		 663 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3665  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.65 
 
 		 555 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0144  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.09 
 
 		 553 aa  174  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1265  ABC transporter related  28.83 
 
 		 638 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.870161 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5906  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.65 
 
 		 555 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4627  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.65 
 
 		 555 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0661  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.98 
 
 		 560 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0130  ABC transporter related  28.96 
 
 		 685 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.906602  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04232  hypothetical protein  31.65 
 
 		 555 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3596  ABC transporter related  33.88 
 
 		 527 aa  174  2.9999999999999996e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.737822  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15950  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  32.86 
 
 		 550 aa  174  3.9999999999999995e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1437  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.04 
 
 		 554 aa  174  3.9999999999999995e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0106  ABC transporter related  25.5 
 
 		 544 aa  174  5e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0473  ABC transporter related  31.35 
 
 		 648 aa  173  5.999999999999999e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11685  macrolide ABC transporter ATP-binding protein  31.42 
 
 		 591 aa  173  6.999999999999999e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.819157 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0375  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.4 
 
 		 637 aa  173  7.999999999999999e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0877  ABC transporter related protein  30.56 
 
 		 555 aa  173  7.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1379  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.02 
 
 		 554 aa  173  7.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.621698  hitchhiker  0.000163615 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2424  ABC transporter related  31.76 
 
 		 672 aa  173  9e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0758588 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4905  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.46 
 
 		 555 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4993  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.46 
 
 		 555 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1060  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.11 
 
 		 554 aa  172  1e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.298194  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0229  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.53 
 
 		 555 aa  172  1e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0762  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.78 
 
 		 555 aa  172  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4939  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.46 
 
 		 555 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.909016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3932  putative ABC transporter ATP-binding protein  30 
 
 		 640 aa  172  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3542  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.8 
 
 		 558 aa  172  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.195737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3689  putative ABC transporter ATP-binding protein  30 
 
 		 640 aa  172  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>