40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_10080 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_10080  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  100 
 
 		 544 aa  1103    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1319  extracellular solute-binding protein family 1  65.62 
 
 		 548 aa  706    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.981957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13590  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  52.78 
 
 		 552 aa  539  9.999999999999999e-153  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.080698  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0409  extracellular solute-binding protein family 1  51.48 
 
 		 561 aa  536  1e-151  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.665828  normal  0.0938708 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1769  hypothetical protein  42.88 
 
 		 560 aa  429  1e-119  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0593052  normal  0.250375 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1609  ABC-type sugar transport system periplasmic component  41.61 
 
 		 557 aa  410  1e-113  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.051709  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2170  extracellular solute-binding protein family 1  39.8 
 
 		 532 aa  391  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.76717  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5565  extracellular solute-binding protein family 1  38.05 
 
 		 552 aa  375  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.379464  normal  0.358408 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3336  extracellular solute-binding protein family 1  37.38 
 
 		 537 aa  367  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1293  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  39.41 
 
 		 564 aa  337  2.9999999999999997e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.719816 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4682  extracellular solute-binding protein family 1  37.96 
 
 		 565 aa  328  2.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00316141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4938  ABC-type sugar transport system periplasmic component  34.55 
 
 		 558 aa  296  6e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000971011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6724  extracellular solute-binding protein family 1  33.21 
 
 		 563 aa  242  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1437  extracellular solute-binding protein family 1  31.72 
 
 		 544 aa  203  8e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.402875  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3388  extracellular solute-binding protein family 1  27.93 
 
 		 547 aa  194  4e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5755  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  29.47 
 
 		 544 aa  192  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.813391  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1579  putative lipoprotein precursor LplA  30.42 
 
 		 552 aa  183  6e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05750  hypothetical protein  28.62 
 
 		 568 aa  167  5e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.182981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04170  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.52 
 
 		 547 aa  166  1.0000000000000001e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.401805  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0130  extracellular solute-binding protein family 1  29.06 
 
 		 561 aa  165  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4040  hypothetical protein  26.96 
 
 		 567 aa  154  2.9999999999999998e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29210  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.31 
 
 		 503 aa  87  8e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0775  extracellular solute-binding protein  24.11 
 
 		 523 aa  86.3  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.062981  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3316  extracellular solute-binding protein  23.26 
 
 		 509 aa  79.7  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3114  extracellular solute-binding protein family 1  24.44 
 
 		 510 aa  72.8  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0948  extracellular solute-binding protein family 1  21.04 
 
 		 525 aa  57  0.0000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000245196  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1101  extracellular solute-binding protein family 1  24.65 
 
 		 567 aa  56.2  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2091  extracellular solute-binding protein family 1  24.26 
 
 		 522 aa  56.2  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00542537  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0341  extracellular solute-binding protein  24.44 
 
 		 537 aa  55.8  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  28.64 
 
 		 399 aa  55.1  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2733  extracellular solute-binding protein  22.72 
 
 		 533 aa  51.6  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000105202  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0279  extracellular solute-binding protein family 1  21.93 
 
 		 510 aa  47.4  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.795384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19280  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.46 
 
 		 416 aa  46.2  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.147667  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7725  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  26.61 
 
 		 420 aa  45.4  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1105  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 443 aa  44.7  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.698754  normal  0.0706181 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2696  extracellular solute-binding protein  27.04 
 
 		 420 aa  44.7  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.240659  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4126  extracellular solute-binding protein family 1  27.98 
 
 		 456 aa  44.7  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.738673  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2998  extracellular solute-binding protein family 1  26.78 
 
 		 552 aa  44.3  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.58673  normal  0.432395 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3323  extracellular solute-binding protein family 1  25.18 
 
 		 552 aa  43.5  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.175879  normal  0.023879 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2709  extracellular solute-binding protein family 1  22.93 
 
 		 549 aa  43.5  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>