245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_01290 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_01290  SNF family Na+-dependent transporter  100 
 
 		 520 aa  1014    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0251  sodium:neurotransmitter symporter  65.07 
 
 		 524 aa  632  1e-180  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2015  sodium:neurotransmitter symporter  53.62 
 
 		 514 aa  509  1e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18260  SNF family Na+-dependent transporter  51.93 
 
 		 547 aa  510  1e-143  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.129568  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28780  SNF family Na+-dependent transporter  51.68 
 
 		 547 aa  499  1e-140  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2162  sodium:neurotransmitter symporter  52.24 
 
 		 517 aa  490  1e-137  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.227594  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07970  SNF family Na+-dependent transporter  51.1 
 
 		 553 aa  471  1.0000000000000001e-131  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14380  SNF family Na+-dependent transporter  49.8 
 
 		 505 aa  466  9.999999999999999e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.995834  normal  0.596403 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0709  sodium:neurotransmitter symporter  54.07 
 
 		 525 aa  465  9.999999999999999e-131  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000643751 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2909  sodium:neurotransmitter symporter  49.59 
 
 		 506 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.837075  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3902  sodium:neurotransmitter symporter  48.56 
 
 		 508 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.973236  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3828  sodium-dependent symporter  48.56 
 
 		 508 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000226652  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1714  SNF family sodium-dependent transporter  49.09 
 
 		 502 aa  454  1.0000000000000001e-126  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0207097  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4093  sodium-dependent symporter family protein  48.35 
 
 		 508 aa  450  1e-125  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.292750000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4204  sodium-dependent symporter family protein  48.15 
 
 		 508 aa  449  1e-125  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000242154  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4141  sodium-dependent symporter family protein  48.15 
 
 		 508 aa  449  1e-125  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000962307  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3812  sodium-dependent symporter  48.35 
 
 		 508 aa  450  1e-125  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2770  sodium:neurotransmitter symporter  47.14 
 
 		 508 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000716945  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1057  sodium-dependent symporter family protein  47.74 
 
 		 508 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0180968  normal  0.0662061 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3982  sodium-dependent symporter family protein  48.15 
 
 		 508 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00011184  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4293  sodium-dependent symporter family protein  48.15 
 
 		 508 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.751134  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4181  sodium-dependent symporter family protein  47.74 
 
 		 508 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000726069  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1767  sodium:neurotransmitter symporter  41.99 
 
 		 492 aa  402  1e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2498  sodium:neurotransmitter symporter  42.48 
 
 		 502 aa  396  1e-109  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2254  putative sodium-dependent transporter  40.41 
 
 		 488 aa  368  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1119  sodium:neurotransmitter symporter  39.84 
 
 		 502 aa  365  1e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003007  sodium-dependent transporter  39.43 
 
 		 488 aa  363  4e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1518  sodium:neurotransmitter symporter  41.2 
 
 		 497 aa  363  4e-99  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1598  sodium-dependent transporter  39.46 
 
 		 527 aa  362  8e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3117  sodium:neurotransmitter symporter  39.2 
 
 		 499 aa  362  1e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02896  hypothetical protein  39.05 
 
 		 486 aa  360  5e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3446  putative sodium-dependent transporter  38.79 
 
 		 495 aa  352  8.999999999999999e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0810962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1761  sodium/proline symporter  39.51 
 
 		 498 aa  346  6e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0369895  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1219  sodium:neurotransmitter symporter  40.8 
 
 		 503 aa  345  8.999999999999999e-94  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0491  sodium:neurotransmitter symporter  40.52 
 
 		 503 aa  343  4e-93  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1417  sodium:neurotransmitter symporter  40.8 
 
 		 503 aa  343  4e-93  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3649  sodium:neurotransmitter symporter  39.14 
 
 		 498 aa  341  2e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0144867  decreased coverage  0.00339235 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2896  sodium:neurotransmitter symporter  37.18 
 
 		 503 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.634117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0040  sodium:neurotransmitter symporter  39.34 
 
 		 510 aa  336  5e-91  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18410  sodium:neurotransmitter symporter  38.84 
 
 		 493 aa  330  5.0000000000000004e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000355087  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1202  sodium:neurotransmitter symporter  38.16 
 
 		 494 aa  330  5.0000000000000004e-89  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0233707  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1300  sodium:neurotransmitter symporter  35.66 
 
 		 498 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.538845  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1026  sodium:neurotransmitter symporter  34.67 
 
 		 499 aa  268  1e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000458175  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2977  sodium:neurotransmitter symporter  38.15 
 
 		 493 aa  206  6e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.483313  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1792  sodium:neurotransmitter symporter  34.14 
 
 		 452 aa  200  5e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1316  sodium:neurotransmitter symporter  36.24 
 
 		 431 aa  197  3e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.745347  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003803  putative sodium-dependent transporter  30.79 
 
 		 476 aa  196  1e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0402  SNF family Na(+)-dependent transporter  33.47 
 
 		 468 aa  191  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1105  sodium:neurotransmitter symporter  31.94 
 
 		 453 aa  189  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.050173  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4148  sodium:neurotransmitter symporter  30.86 
 
 		 459 aa  189  1e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.500155  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0030  sodium:neurotransmitter symporter  33.19 
 
 		 449 aa  187  5e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2640  sodium:neurotransmitter symporter  30.87 
 
 		 454 aa  186  9e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0280072  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20910  sodium:neurotransmitter symporter  32.31 
 
 		 437 aa  183  6e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0704  sodium-dependent transporter, putative  27.84 
 
 		 447 aa  181  2.9999999999999997e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0629  sodium-dependent transporter, putative  27.84 
 
 		 447 aa  181  2.9999999999999997e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1949  sodium:neurotransmitter symporter  29.38 
 
 		 455 aa  180  5.999999999999999e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.804307  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1069  putative sodium-dependent transporter  27.84 
 
 		 447 aa  179  1e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.291946  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0909  sodium-dependent transporter (SNF family)  27.86 
 
 		 454 aa  178  3e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.45649  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1999  sodium-dependent transporter  28.76 
 
 		 446 aa  177  4e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00179819  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0541  sodium-dependent transporter  26.48 
 
 		 458 aa  177  5e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2244  putative sodium-dependent transporter  28.54 
 
 		 446 aa  176  7e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.781719999999999e-27 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2266  sodium:neurotransmitter symporter  31.93 
 
 		 455 aa  176  7e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2060  sodium-dependent transporter  28.54 
 
 		 446 aa  176  8e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0130438  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2216  sodium-dependent transporter  28.54 
 
 		 446 aa  176  8e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.577413  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2000  sodium-dependent transporter  28.54 
 
 		 446 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000556879  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2328  putative sodium-dependent transporter  28.32 
 
 		 446 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000364471  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21340  SNF family Na+-dependent transporter  29.22 
 
 		 461 aa  176  9.999999999999999e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00519934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2874  sodium:neurotransmitter symporter  36.29 
 
 		 464 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.673413 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02692  hypothetical protein  30.69 
 
 		 456 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1490  sodium:neurotransmitter symporter  31.69 
 
 		 486 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2975  sodium:neurotransmitter symporter  30.93 
 
 		 488 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3127  putative sodium-dependent transporter  27.89 
 
 		 446 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0292515  normal  0.0156327 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2211  sodium:neurotransmitter symporter  29.98 
 
 		 435 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2041  sodium:neurotransmitter symporter  28.54 
 
 		 446 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1622  sodium:neurotransmitter symporter  27.91 
 
 		 446 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.185224  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2246  sodium-dependent transporter, putative  28.1 
 
 		 446 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.010135  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1611  sodium/neurotransmitter symporter family protein  28.11 
 
 		 457 aa  174  3.9999999999999995e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.195331  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0874  sodium:neurotransmitter symporter  33.25 
 
 		 454 aa  174  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.395268 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2198  putative sodium-dependent transporter  28.1 
 
 		 446 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2371  sodium-dependent symporter family protein  30.39 
 
 		 453 aa  173  5e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000133814  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1580  sodium:neurotransmitter symporter  32.86 
 
 		 518 aa  173  5.999999999999999e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1256  sodium:neurotransmitter symporter  32.27 
 
 		 443 aa  173  6.999999999999999e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00157351  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1066  sodium-dependent transporter  26.34 
 
 		 454 aa  173  7.999999999999999e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.094867  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2054  sodium:neurotransmitter symporter  30.85 
 
 		 452 aa  172  1e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1035  sodium:neurotransmitter symporter  32.41 
 
 		 446 aa  172  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1903  sodium:neurotransmitter symporter  31.54 
 
 		 453 aa  172  1e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1700  sodium:neurotransmitter symporter  31.54 
 
 		 486 aa  172  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0878592 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3091  sodium:neurotransmitter symporter  32.77 
 
 		 457 aa  172  1e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.709672  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2879  sodium:neurotransmitter symporter  29.94 
 
 		 470 aa  171  3e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0267989  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0762  sodium-dependent transporter  30.91 
 
 		 454 aa  169  1e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0994295  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1260  sodium:neurotransmitter symporter  30.98 
 
 		 475 aa  169  1e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000558037  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1704  sodium:neurotransmitter symporter  29.72 
 
 		 450 aa  169  1e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0489471  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0741  sodium:neurotransmitter symporter  32.13 
 
 		 463 aa  169  1e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.649809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2101  sodium:neurotransmitter symporter  34.7 
 
 		 466 aa  169  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284864 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1525  sodium-dependent transporter  29.72 
 
 		 450 aa  168  2e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000897057  decreased coverage  0.00856693 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2570  sodium:neurotransmitter symporter  35.16 
 
 		 443 aa  168  2e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.390192 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24190  SNF family Na+-dependent transporter  30 
 
 		 468 aa  168  2e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2742  sodium:neurotransmitter symporter  30.09 
 
 		 460 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2112  sodium:neurotransmitter symporter  34.93 
 
 		 455 aa  167  5e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0263  sodium:neurotransmitter symporter  33.1 
 
 		 464 aa  167  5e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>