183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_2622 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_2555  hypothetical protein  96.83 
 
 
325 aa  636    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00750734  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2622  hypothetical protein  100 
 
 
319 aa  667    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0144606  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2402  hypothetical protein  95.24 
 
 
325 aa  629  1e-179  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.283143  normal  0.277541 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0115  hypothetical protein  93.33 
 
 
325 aa  617  1e-175  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1546  hypothetical protein  92.7 
 
 
326 aa  615  1e-175  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3040  hypothetical protein  91.43 
 
 
325 aa  613  1e-175  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3447  hypothetical protein  91.43 
 
 
325 aa  613  1e-175  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1547  hypothetical protein  92.38 
 
 
325 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4530  hypothetical protein  92.06 
 
 
325 aa  610  9.999999999999999e-175  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0670  hypothetical protein  92.63 
 
 
325 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3473  hypothetical protein  91.99 
 
 
325 aa  610  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1510  hypothetical protein  92.38 
 
 
325 aa  607  1e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2299  hypothetical protein  91.43 
 
 
325 aa  608  1e-173  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.187044  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1241  hypothetical protein  92.06 
 
 
325 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1511  hypothetical protein  90.79 
 
 
325 aa  604  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0116  hypothetical protein  91.43 
 
 
325 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4547  hypothetical protein  90.16 
 
 
325 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2814  hypothetical protein  90.16 
 
 
325 aa  599  1e-170  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1861  hypothetical protein  90.51 
 
 
329 aa  592  1e-168  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.633128  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1890  hypothetical protein  88.75 
 
 
325 aa  585  1e-166  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1812  hypothetical protein  92.91 
 
 
316 aa  578  1e-164  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0606  hypothetical protein  87.54 
 
 
325 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0957  hypothetical protein  87.38 
 
 
325 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00250015  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1264  hypothetical protein  87.06 
 
 
325 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0135  hypothetical protein  81.23 
 
 
325 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1921  hypothetical protein  80.26 
 
 
325 aa  533  1e-150  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3680  hypothetical protein  80.26 
 
 
325 aa  533  1e-150  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2392  hypothetical protein  78.96 
 
 
325 aa  525  1e-148  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.134929  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0200  hypothetical protein  85.37 
 
 
293 aa  520  1e-146  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1378  hypothetical protein  75.81 
 
 
325 aa  509  1e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000599998 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2958  hypothetical protein  75.08 
 
 
325 aa  509  1e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4299  hypothetical protein  74.28 
 
 
325 aa  502  1e-141  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3773  hypothetical protein  74.19 
 
 
325 aa  502  1e-141  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.149988  hitchhiker  0.00126811 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3627  hypothetical protein  73.31 
 
 
325 aa  494  1e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.92162  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2922  hypothetical protein  73.08 
 
 
325 aa  495  1e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3681  hypothetical protein  73.08 
 
 
323 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4749  hypothetical protein  72.76 
 
 
325 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.291957  hitchhiker  0.000564584 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4465  hypothetical protein  73.55 
 
 
325 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2653  hypothetical protein  73.08 
 
 
326 aa  486  1e-136  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2533  hypothetical protein  76.28 
 
 
326 aa  480  1e-134  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0991372  normal  0.0595118 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0196  hypothetical protein  71.79 
 
 
326 aa  480  1e-134  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.157282 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1610  hypothetical protein  71.52 
 
 
325 aa  475  1e-133  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3087  hypothetical protein  71.52 
 
 
325 aa  477  1e-133  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2785  hypothetical protein  70.87 
 
 
325 aa  473  1e-132  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0143634  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3084  hypothetical protein  71.2 
 
 
325 aa  474  1e-132  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1948  hypothetical protein  69.58 
 
 
326 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.270103  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2414  hypothetical protein  74.68 
 
 
326 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.196776  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0052  hypothetical protein  66.67 
 
 
326 aa  448  1e-125  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.186799 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3323  hypothetical protein  65.71 
 
 
325 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2307  hypothetical protein  66.99 
 
 
326 aa  447  1.0000000000000001e-124  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3091  hypothetical protein  66.35 
 
 
326 aa  443  1e-123  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0496594 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2628  hypothetical protein  63.78 
 
 
326 aa  429  1e-119  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2393  hypothetical protein  85.4 
 
 
238 aa  410  1e-113  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0597783  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3356  hypothetical protein  55.12 
 
 
323 aa  357  9.999999999999999e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.526564  normal  0.864241 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1385  hypothetical protein  56.67 
 
 
327 aa  342  5e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.868466  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1948  hypothetical protein  56.33 
 
 
327 aa  340  2e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.557873  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1848  hypothetical protein  56.33 
 
 
327 aa  338  5e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3465  hypothetical protein  52.68 
 
 
325 aa  336  2.9999999999999997e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0641119 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0499  hypothetical protein  91.38 
 
 
186 aa  335  7e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0907  hypothetical protein  55.81 
 
 
327 aa  335  7.999999999999999e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0248219  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4132  hypothetical protein  54.67 
 
 
327 aa  334  1e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0111  hypothetical protein  54.39 
 
 
325 aa  333  2e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1735  hypothetical protein  55 
 
 
327 aa  333  3e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3074  CheW protein  54.39 
 
 
325 aa  332  4e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.464984  normal  0.367409 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0333  Type I secretion outer membrane protein, TolC  53.38 
 
 
325 aa  332  5e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0672756 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3041  hypothetical protein  91.76 
 
 
198 aa  329  3e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3446  hypothetical protein  91.76 
 
 
198 aa  329  3e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0282  hypothetical protein  52.44 
 
 
325 aa  324  1e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.822944  hitchhiker  0.00000243422 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0281  hypothetical protein  52.44 
 
 
325 aa  320  1.9999999999999998e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000015206 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0607  hypothetical protein  52.12 
 
 
325 aa  318  1e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2943  histidine kinase  52.12 
 
 
325 aa  318  1e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1111  hypothetical protein  51.67 
 
 
327 aa  315  5e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0480419  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1856  hypothetical protein  48.22 
 
 
370 aa  311  1e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3017  hypothetical protein  53.19 
 
 
325 aa  309  5e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0296678 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1436  protein of unknown function DUF1568  55.6 
 
 
341 aa  305  9.000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3113  hypothetical protein  87.5 
 
 
207 aa  295  6e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2838  hypothetical protein  73.91 
 
 
186 aa  295  8e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.579373  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2679  hypothetical protein  50.86 
 
 
336 aa  288  6e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0118762  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3659  hypothetical protein  47.91 
 
 
347 aa  288  7e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3682  hypothetical protein  73.63 
 
 
198 aa  288  1e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2780  hypothetical protein  52.14 
 
 
336 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000960474  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2906  hypothetical protein  51.03 
 
 
329 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.881072 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0856  hypothetical protein  47.12 
 
 
347 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3200  hypothetical protein  45.83 
 
 
344 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.789239 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2840  protein of unknown function DUF1568  46.6 
 
 
345 aa  282  5.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0644633 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0868  hypothetical protein  46.15 
 
 
344 aa  281  7.000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2414  hypothetical protein  46.28 
 
 
341 aa  280  3e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.301389  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0910  hypothetical protein  46.01 
 
 
344 aa  279  4e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1697  hypothetical protein  46.28 
 
 
349 aa  278  1e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1226  protein of unknown function DUF1568  46.6 
 
 
341 aa  276  2e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.353731  hitchhiker  0.000000017845 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1178  hypothetical protein  45.51 
 
 
344 aa  277  2e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0303591  normal  0.0825627 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1945  protein of unknown function DUF1568  46.28 
 
 
341 aa  277  2e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.499337 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2403  hypothetical protein  45.95 
 
 
341 aa  276  4e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.284659  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2480  hypothetical protein  45.19 
 
 
344 aa  273  3e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1126  hypothetical protein  45.19 
 
 
344 aa  273  3e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.776641  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2933  hypothetical protein  44.34 
 
 
345 aa  269  4e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.161086  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01831  hypothetical protein  51.15 
 
 
271 aa  269  5e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1700  protein of unknown function DUF1568  43.34 
 
 
377 aa  268  7e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0414346 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0562  hypothetical protein  44.31 
 
 
370 aa  266  2e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0862774 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02418  hypothetical protein  43.65 
 
 
328 aa  266  2.9999999999999995e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>