47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_1819 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_3233  hypothetical protein  44.44 
 
 		 1129 aa  889    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1132  hypothetical protein  53.66 
 
 		 1174 aa  1176    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00035988 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1081  hypothetical protein  47.81 
 
 		 1107 aa  993    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.202194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2756  hypothetical protein  57.85 
 
 		 1162 aa  1357    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.206504  normal  0.110579 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1326  hypothetical protein  49.74 
 
 		 1141 aa  1065    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.770705  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1709  hypothetical protein  86.22 
 
 		 1154 aa  2029    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.18586  normal  0.0585819 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1819  hypothetical protein  100 
 
 		 1154 aa  2379    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0470618 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2241  hypothetical protein  46.4 
 
 		 731 aa  573  1.0000000000000001e-162  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0974985 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2238  hypothetical protein  46.48 
 
 		 389 aa  336  1e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0102712 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02940  hypothetical protein  23.62 
 
 		 1140 aa  162  4e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.45552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4847  putative restriction enzyme  26.76 
 
 		 1219 aa  157  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000521229  normal  0.767237 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5027  type II restriction enzyme  24.4 
 
 		 1180 aa  156  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.776061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2493  type IIS restriction enzyme  30.77 
 
 		 1183 aa  152  5e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1677  hypothetical protein  29.71 
 
 		 1171 aa  150  1.0000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114545 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0295  type II restriction enzyme  26.46 
 
 		 1167 aa  149  3e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1608  hypothetical protein  29.49 
 
 		 1182 aa  147  2e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.102768 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2107  hypothetical protein  27.96 
 
 		 1270 aa  142  3e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02930  hypothetical protein  23.08 
 
 		 1131 aa  142  3.9999999999999997e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.264298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0339  putative restriction enzyme  29.39 
 
 		 1205 aa  138  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00710778  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0561  hypothetical protein  26.71 
 
 		 1162 aa  135  6e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1895  type IIS restriction enzyme  27.76 
 
 		 612 aa  132  3e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.4814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1156  hypothetical protein  28.63 
 
 		 1324 aa  132  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0601  hypothetical protein  28.03 
 
 		 1497 aa  130  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.548482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1916  hypothetical protein  21.74 
 
 		 1430 aa  130  2.0000000000000002e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2288  type II restriction enzyme  29.49 
 
 		 1160 aa  129  4.0000000000000003e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1235  hypothetical protein  29.11 
 
 		 1484 aa  129  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.616183  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1299  Eco57I restriction endonuclease  23.58 
 
 		 1144 aa  128  6e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0387167  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3731  hypothetical protein  26.6 
 
 		 1174 aa  127  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3080  hypothetical protein  27.79 
 
 		 1425 aa  120  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_260  hypothetical protein  23.6 
 
 		 1359 aa  104  8e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2208  hypothetical protein  29 
 
 		 1218 aa  97.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00220427  normal  0.956264 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1273  hypothetical protein  22.2 
 
 		 1125 aa  80.5  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2038  hypothetical protein  19.64 
 
 		 1241 aa  79  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.769996  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1124  hypothetical protein  23.59 
 
 		 1326 aa  77  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0583  hypothetical protein  26.88 
 
 		 882 aa  62.4  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0997  hypothetical protein  25.89 
 
 		 706 aa  54.3  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2953  putative DNA methylase  37.14 
 
 		 1239 aa  52.4  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.468848  normal  0.142335 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  22.92 
 
 		 1058 aa  52  0.00006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0994  hypothetical protein  23.2 
 
 		 309 aa  51.2  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05210  hypothetical protein  39.47 
 
 		 1209 aa  50.8  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  20.16 
 
 		 995 aa  48.9  0.0006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3191  hypothetical protein  24.1 
 
 		 288 aa  48.5  0.0007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  23.56 
 
 		 1041 aa  47.8  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1545  hypothetical protein  33.82 
 
 		 1195 aa  47.8  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0985179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1424  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  21.41 
 
 		 1194 aa  45.8  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3141  N-6 DNA methylase  35.38 
 
 		 746 aa  45.8  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  26.56 
 
 		 950 aa  45.1  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>