More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_1571 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_2362  metal dependent phosphohydrolase  81.59 
 
 
402 aa  687    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.014285  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2862  HDIG domain-containing protein  89.28 
 
 
401 aa  724    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2677  metal dependent phosphohydrolase  84.54 
 
 
401 aa  700    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0495903  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1707  metal dependent phosphohydrolase  84.29 
 
 
401 aa  699    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.336199  hitchhiker  0.00000000228232 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2756  metal dependent phosphohydrolase  84.54 
 
 
401 aa  700    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000497336 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1510  metal dependent phosphohydrolase  98 
 
 
401 aa  810    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.933649  hitchhiker  0.00011733 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1577  metal dependent phosphohydrolase  98.25 
 
 
401 aa  812    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.287908  hitchhiker  0.000399612 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2642  metal dependent phosphohydrolase  86 
 
 
401 aa  701    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1571  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
401 aa  824    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000899891 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1740  metal dependent phosphohydrolase  66.25 
 
 
401 aa  543  1e-153  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0020457  hitchhiker  0.000000139322 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2844  metal dependent phosphohydrolase  63.25 
 
 
404 aa  528  1e-149  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000021567 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2375  metal dependent phosphohydrolase  62.66 
 
 
407 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000143917  unclonable  0.000001487 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1519  putative metal dependent phosphohydrolase  57.35 
 
 
404 aa  486  1e-136  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000671855  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2459  metal dependent phosphohydrolase  59.5 
 
 
400 aa  481  1e-135  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1691  metal dependent phosphohydrolase  56.33 
 
 
398 aa  474  1e-132  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0771353  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2512  hypothetical protein  57.28 
 
 
406 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2807  metal dependent phosphohydrolase  33.9 
 
 
419 aa  229  4e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0596042  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2351  metal dependent phosphohydrolase  33.01 
 
 
421 aa  225  1e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0796971  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1539  putative metal dependent phosphohydrolase  31.16 
 
 
418 aa  224  2e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.359761  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1724  metal dependent phosphohydrolase  31.07 
 
 
419 aa  222  7e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.843768  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1788  metal dependent phosphohydrolase  31.4 
 
 
421 aa  219  7e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.979757  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2078  hypothetical protein  33.49 
 
 
417 aa  218  1e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000117952  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2489  metal dependent phosphohydrolase  30.39 
 
 
416 aa  212  9e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03619  hypothetical protein  31.31 
 
 
416 aa  210  3e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002441  HD-GYP domain-containing protein  31.39 
 
 
417 aa  209  1e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000172513  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1942  HDIG domain-containing protein  29.83 
 
 
420 aa  204  2e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2333  hypothetical protein  29.69 
 
 
426 aa  202  9e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.250947  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1577  metal dependent phosphohydrolase  29.34 
 
 
420 aa  202  9e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.138527 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2258  metal dependent phosphohydrolase  29.58 
 
 
420 aa  202  9e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1652  metal dependent phosphohydrolase  29.34 
 
 
420 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.1275  hitchhiker  0.00033988 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1721  metal dependent phosphohydrolase  29.09 
 
 
420 aa  196  6e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.6453  normal  0.200178 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1847  metal dependent phosphohydrolase  29.06 
 
 
420 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00300439  hitchhiker  0.00112641 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2497  metal dependent phosphohydrolase  29.06 
 
 
420 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.542039  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2504  metal dependent phosphohydrolase  29.06 
 
 
420 aa  194  3e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.683485  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2617  metal dependent phosphohydrolase  29.06 
 
 
421 aa  194  3e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0331163 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1979  metal dependent phosphohydrolase  29.6 
 
 
431 aa  173  5e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.334785  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0570  metal dependent phosphohydrolase  30.3 
 
 
417 aa  162  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000128734 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1822  metal dependent phosphohydrolase  29.55 
 
 
395 aa  149  8e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.248214  normal  0.0148052 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0282  metal dependent phosphohydrolase  26.03 
 
 
448 aa  147  2.0000000000000003e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2511  hypothetical protein  25.47 
 
 
446 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0698  putative metal dependent phosphohydrolase  29.3 
 
 
439 aa  138  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3785  metal dependent phosphohydrolase  27.25 
 
 
436 aa  135  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915661  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1802  metal-dependent phosphohydrolase  27.09 
 
 
413 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2630  metal dependent phosphohydrolase  26.24 
 
 
435 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2944  metal dependent phosphohydrolase  27.06 
 
 
466 aa  131  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0592  hypothetical protein  26.9 
 
 
403 aa  129  6e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1865  metal dependent phosphohydrolase  28.87 
 
 
377 aa  129  9.000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1719  metal dependent phosphohydrolase  29.09 
 
 
402 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0350  metal-dependent phosphohydrolase  25.77 
 
 
406 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0505  metal dependent phosphohydrolase  27.35 
 
 
404 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.311766  normal  0.892483 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0518  metal dependent phosphohydrolase  27.2 
 
 
406 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.454264 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1533  metal dependent phosphohydrolase  25.95 
 
 
454 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.35985  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1096  hypothetical protein  28.94 
 
 
409 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.988771  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1495  metal dependent phosphohydrolase, HD region  26.46 
 
 
404 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0636739  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0329  metal dependent phosphohydrolase  32.16 
 
 
448 aa  126  6e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.855527  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3456  metal dependent phosphohydrolase  28.47 
 
 
412 aa  126  8.000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1218  metal dependent phosphohydrolase  30.71 
 
 
448 aa  125  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1451  metal dependent phosphohydrolase  28.97 
 
 
366 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.32319  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2785  metal dependent phosphohydrolase  26.63 
 
 
448 aa  125  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.471926  normal  0.576348 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1617  metal dependent phosphohydrolase  26.35 
 
 
410 aa  124  3e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.035653 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0100  metal dependent phosphohydrolase  25.74 
 
 
392 aa  123  5e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2515  hypothetical protein  24.93 
 
 
402 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0603316  decreased coverage  0.00307837 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4285  metal dependent phosphohydrolase  26.65 
 
 
388 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00317648  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1140  metal dependent phosphohydrolase  29.08 
 
 
395 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0187  HDIG  25.36 
 
 
401 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2450  metal dependent phosphohydrolase  26.12 
 
 
401 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.573389 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1832  metal dependent phosphohydrolase  32.09 
 
 
350 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.49605  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3871  metal dependent phosphohydrolase  31.16 
 
 
396 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2378  metal dependent phosphohydrolase  26.3 
 
 
402 aa  117  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0137  HD domain-containing protein  26.03 
 
 
392 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3231  metal dependent phosphohydrolase  25.71 
 
 
366 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3954  metal dependent phosphohydrolase  28.57 
 
 
411 aa  116  7.999999999999999e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3861  metal dependent phosphohydrolase  28.57 
 
 
411 aa  116  8.999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3670  metal dependent phosphohydrolase  26.91 
 
 
401 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0739  metal dependent phosphohydrolase  24.45 
 
 
411 aa  115  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498255  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2783  metal dependent phosphohydrolase  25.15 
 
 
403 aa  114  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0136  putative metal dependent phosphohydrolase  28.44 
 
 
398 aa  113  8.000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0215  metal-dependent phosphohydrolase  26.52 
 
 
400 aa  112  9e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1030  metal dependent phosphohydrolase  33.17 
 
 
353 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.239219  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2138  metal dependent phosphohydrolase  24.44 
 
 
369 aa  112  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4444  metal dependent phosphohydrolase  26.25 
 
 
396 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2302  HD domain-containing protein  29.5 
 
 
421 aa  111  2.0000000000000002e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.332838  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003582  HD-domain protein  25.81 
 
 
405 aa  111  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0845  metal dependent phosphohydrolase  27.3 
 
 
429 aa  112  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.242914  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4069  metal dependent phosphohydrolase  28.44 
 
 
396 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3410  hypothetical protein  31.09 
 
 
1333 aa  111  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277305  normal  0.24869 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4711  HD domain-containing protein  28.44 
 
 
394 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1010  metal dependent phosphohydrolase  24.54 
 
 
419 aa  110  5e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1532  metal dependent phosphohydrolase  24.01 
 
 
413 aa  110  6e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1725  metal dependent phosphohydrolase  42.54 
 
 
207 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000183773 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3912  metal dependent phosphohydrolase  30.26 
 
 
397 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0592  metal dependent phosphohydrolase  28.15 
 
 
431 aa  109  7.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1152  HDIG domain protein  24.79 
 
 
395 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2795  metal dependent phosphohydrolase  34.86 
 
 
357 aa  109  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.835639 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0203  metal dependent phosphohydrolase  30.21 
 
 
360 aa  109  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.640069  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1234  HD-GYP domain-containing protein  26.96 
 
 
424 aa  108  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4158  metal dependent phosphohydrolase  24.93 
 
 
348 aa  109  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0636099  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4304  metal dependent phosphohydrolase  25.96 
 
 
396 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4249  metal dependent phosphohydrolase  23.94 
 
 
396 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0582  metal dependent phosphohydrolase  25.95 
 
 
400 aa  108  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>