More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_1232 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_3309  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  94.68 
 
 
395 aa  754    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2987  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  94.68 
 
 
395 aa  753    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.198648  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1293  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  76.46 
 
 
395 aa  646    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.664438  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1308  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  74.43 
 
 
395 aa  637    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000307899  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1376  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  94.94 
 
 
395 aa  755    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.877608  normal  0.696352 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1547  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  76.96 
 
 
395 aa  643    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00611389  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1435  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  76.96 
 
 
395 aa  650    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00436536  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1231  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  98.73 
 
 
395 aa  793    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1302  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  98.48 
 
 
395 aa  790    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1119  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  75.89 
 
 
411 aa  635    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3002  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  94.94 
 
 
395 aa  755    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0839555  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3145  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  94.68 
 
 
395 aa  754    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0657183 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1232  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  100 
 
 
395 aa  800    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2649  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  94.68 
 
 
395 aa  752    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2362  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  76.71 
 
 
395 aa  628  1e-179  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.034876  normal  0.596671 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1259  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  76.96 
 
 
395 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0514835  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1296  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  42.82 
 
 
393 aa  326  4.0000000000000003e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1189  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  42.82 
 
 
393 aa  326  4.0000000000000003e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0343666  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0415  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  42.82 
 
 
393 aa  325  1e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.873233  hitchhiker  0.00131878 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4249  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  42.13 
 
 
414 aa  324  2e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.548158  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0291  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  41.67 
 
 
386 aa  322  7e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2734  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  41.54 
 
 
393 aa  319  5e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1261  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  40.51 
 
 
393 aa  316  4e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21096  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3011  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  39.49 
 
 
393 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02978  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  39.85 
 
 
402 aa  312  7.999999999999999e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.373211  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1171  Pyrrolo-quinoline quinone  40.05 
 
 
399 aa  311  2e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0406546  normal  0.22444 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3606  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  39.49 
 
 
393 aa  306  4.0000000000000004e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.612684 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1121  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  39.74 
 
 
393 aa  305  7e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0732  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  38.87 
 
 
385 aa  304  2.0000000000000002e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01070  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  38.13 
 
 
386 aa  303  3.0000000000000004e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3123  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  39.09 
 
 
415 aa  300  2e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126817  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3006  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  39.53 
 
 
392 aa  295  8e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.901484  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004346  YfgL protein  37.06 
 
 
386 aa  291  1e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2758  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  37.96 
 
 
392 aa  285  8e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.267883 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2664  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  37.7 
 
 
392 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.280231 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2714  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  37.7 
 
 
392 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.359129  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2671  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  37.7 
 
 
392 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2777  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  37.7 
 
 
392 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.985011  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02404  protein assembly complex, lipoprotein component  37.7 
 
 
392 aa  283  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.005806  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1165  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  37.7 
 
 
392 aa  283  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.035422  normal  0.0264667 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02366  hypothetical protein  37.7 
 
 
392 aa  283  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0111233  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2663  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  37.7 
 
 
392 aa  283  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000327746  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2796  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  37.7 
 
 
392 aa  283  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000117492  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3736  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  37.7 
 
 
392 aa  282  7.000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.550553  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1156  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  37.43 
 
 
392 aa  281  1e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00537914  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2887  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  37.7 
 
 
392 aa  281  1e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00225508  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2888  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  37.43 
 
 
392 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.597931  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0010  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  36.92 
 
 
391 aa  252  8.000000000000001e-66  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.469712  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0899  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  38.08 
 
 
380 aa  250  3e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000144468 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3497  Pyrrolo-quinoline quinone  36.9 
 
 
379 aa  243  3e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0856  hypothetical protein  38.08 
 
 
380 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0886  Pyrrolo-quinoline quinone  37.82 
 
 
380 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.80102  normal  0.395139 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0821  Pyrrolo-quinoline quinone  35.79 
 
 
372 aa  240  2.9999999999999997e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.403647  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1251  quinoprotein  37.43 
 
 
381 aa  240  4e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.926962  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4322  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  37.31 
 
 
389 aa  239  5e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000139016 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1437  PQQ enzyme repeat domain protein  36.63 
 
 
384 aa  237  3e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4598  Pyrrolo-quinoline quinone  36.36 
 
 
380 aa  225  9e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40260  YfgL-like phosphoquinolipoprotein kinase  33.67 
 
 
384 aa  225  1e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0902958  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14910  hypothetical protein  36.9 
 
 
380 aa  224  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1314  hypothetical protein  36.9 
 
 
380 aa  224  3e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.605472  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1661  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  34.33 
 
 
402 aa  223  4e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.274941 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2046  hypothetical protein  33.7 
 
 
400 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500116  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1130  Pyrrolo-quinoline quinone  34.55 
 
 
389 aa  209  5e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2197  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  30.41 
 
 
385 aa  205  9e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.763782  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01057  serine/threonine protein kinase  33.24 
 
 
400 aa  205  1e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.553657  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06109  serine/threonine protein kinase  33.24 
 
 
400 aa  205  1e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.144457  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2891  putative lipoprotein  33.76 
 
 
395 aa  204  2e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1712  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  32.43 
 
 
411 aa  201  9.999999999999999e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.368  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2857  Pyrrolo-quinoline quinone  31.72 
 
 
387 aa  200  3.9999999999999996e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.725617  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2103  Pyrrolo-quinoline quinone  31.94 
 
 
383 aa  199  9e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0841326  normal  0.0433282 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1776  serine/threonine protein kinase  32.43 
 
 
411 aa  198  1.0000000000000001e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.801728  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2083  Pyrrolo-quinoline quinone  31.94 
 
 
392 aa  197  4.0000000000000005e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.397286  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2982  Pyrrolo-quinoline quinone  31.13 
 
 
386 aa  187  3e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1615  Pyrrolo-quinoline quinone  32.32 
 
 
390 aa  187  3e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000904136 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0737  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  31.03 
 
 
396 aa  187  4e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.918396  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1218  lipoprotein transmembrane  32.35 
 
 
388 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.032892  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1437  PQQ repeat-containing protein  30.73 
 
 
384 aa  182  8.000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.234341  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1597  transcription accessory protein, TEX  29.32 
 
 
386 aa  178  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.207769  normal  0.115808 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2538  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  29.32 
 
 
381 aa  178  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0468312  hitchhiker  0.00031384 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1417  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  30.1 
 
 
386 aa  176  5e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0124773 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1254  Pyrrolo-quinoline quinone  32.43 
 
 
383 aa  174  1.9999999999999998e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00763008  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1062  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  30.89 
 
 
392 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1154  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  30.89 
 
 
392 aa  173  5.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.536052 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0685  hypothetical protein  28.57 
 
 
387 aa  171  2e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000893693  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1466  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  30.03 
 
 
381 aa  170  4e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0655  Pyrrolo-quinoline quinone  27.76 
 
 
402 aa  167  4e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.808652  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1288  Pyrrolo-quinoline quinone  28.46 
 
 
388 aa  166  6.9999999999999995e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.38604  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0667  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  28.46 
 
 
385 aa  163  5.0000000000000005e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3387  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  29.45 
 
 
380 aa  163  6e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1359  Pyrrolo-quinoline quinone  28.22 
 
 
377 aa  160  4e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000339921 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1747  Pyrrolo-quinoline quinone  29 
 
 
381 aa  160  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.698447  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1786  Pyrrolo-quinoline quinone  28.15 
 
 
381 aa  160  4e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1499  hypothetical protein  28.42 
 
 
384 aa  159  8e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5110  Pyrrolo-quinoline quinone  29.27 
 
 
381 aa  159  9e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.205621  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1484  hypothetical protein  28.14 
 
 
384 aa  159  1e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6270  Pyrrolo-quinoline quinone  29.27 
 
 
381 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.729477  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1833  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  29 
 
 
381 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1809  Pyrrolo-quinoline quinone  29.27 
 
 
381 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1720  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  28.69 
 
 
350 aa  157  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.363455 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0624  Pyrrolo-quinoline quinone  26.98 
 
 
417 aa  157  4e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>