46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2226 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_1533  Ig domain-containing protein  61.93 
 
 		 807 aa  949    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000967383  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2226  Ig domain-containing protein  100 
 
 		 819 aa  1625    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736647 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2498  Ig domain-containing protein  51.06 
 
 		 835 aa  694    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.284109  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2252  Ig domain-containing protein  50.17 
 
 		 851 aa  675    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.124017  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1320  Ig-like, group 1  53.14 
 
 		 821 aa  748    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00729266  normal  0.247272 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2480  Ig domain-containing protein  49.94 
 
 		 820 aa  676    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.311981  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2843  Ig domain-containing protein  49.65 
 
 		 838 aa  674    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000356214  decreased coverage  0.00000000529133 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1801  Ig domain-containing protein  50.46 
 
 		 837 aa  669    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0716764  hitchhiker  0.0000241302 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2330  Ig-like, group 1  51.18 
 
 		 818 aa  693    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1853  Ig domain protein group 1 domain protein  70.8 
 
 		 817 aa  1129    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.498276  hitchhiker  0.000000271075 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4101  Ig domain-containing protein  51.49 
 
 		 676 aa  600  1e-170  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1195  intimin/invasin family protein  40.61 
 
 		 878 aa  492  9.999999999999999e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.634  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1658  Ig domain-containing protein  33.52 
 
 		 1224 aa  331  3e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.377498  hitchhiker  0.000563606 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1583  Ig domain-containing protein  33.52 
 
 		 1224 aa  331  4e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.61768  normal  0.0651551 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1949  invasin domain-containing protein  33.85 
 
 		 1237 aa  329  2.0000000000000001e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2491  Ig domain-containing protein  34.54 
 
 		 1209 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1727  Ig domain-containing protein  33.26 
 
 		 1224 aa  324  4e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.252949  normal  0.106608 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2611  Ig domain-containing protein  34.31 
 
 		 1209 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0062709 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0191  Ig-like, group 1  33.06 
 
 		 811 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000536098  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2663  Ig-like, group 1  38.92 
 
 		 638 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000158035 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3723  Ig domain-containing protein  34.21 
 
 		 826 aa  249  1e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00549605  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0314  hypothetical protein  36.68 
 
 		 651 aa  248  3e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.358502  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4080  hypothetical protein  31.78 
 
 		 826 aa  247  6.999999999999999e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0531  Ig domain-containing protein  32.35 
 
 		 834 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.33736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3807  Ig domain-containing protein  29.85 
 
 		 837 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0493  Ig domain-containing protein  32.9 
 
 		 829 aa  241  5e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0592  Ig domain-containing protein  30.14 
 
 		 840 aa  239  1e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0510  Ig domain-containing protein  32.34 
 
 		 836 aa  239  2e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3633  Ig domain-containing protein  32.95 
 
 		 829 aa  238  3e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3457  Ig domain-containing protein  32.37 
 
 		 829 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3742  Ig domain-containing protein  30.62 
 
 		 851 aa  232  2e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0536  Ig domain protein group 1 domain protein  31.22 
 
 		 836 aa  232  2e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0570  Ig domain-containing protein  30.73 
 
 		 851 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.131384 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3069  hypothetical protein  34.32 
 
 		 830 aa  207  6e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4390  Ig domain-containing protein  28 
 
 		 843 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0783  hypothetical protein  35.16 
 
 		 476 aa  172  3e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.628796  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0677  hypothetical protein  35.17 
 
 		 638 aa  162  3e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.123416 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2695  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit, glutamine-dependent  37.24 
 
 		 366 aa  145  4e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000000319474  decreased coverage  0.000345849 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0935  hypothetical protein  36.27 
 
 		 498 aa  92.4  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.421015  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3697  LigA  32.04 
 
 		 951 aa  57.8  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0503311  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02355  invasin domain protein  27.36 
 
 		 845 aa  57  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.497303  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3639  LigA  34.04 
 
 		 948 aa  56.2  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3780  LigA  31.68 
 
 		 948 aa  52.8  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.155782  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2358  Ig-like, group 1  29.61 
 
 		 727 aa  52  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00702146  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2924  Ig-like, group 1  35.06 
 
 		 633 aa  46.2  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2782  Ig domain protein group 1 domain protein  27.76 
 
 		 4672 aa  45.4  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.117201 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>