More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_2832 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1917  multidrug resistance protein, putative  89.19 
 
 		 413 aa  688    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2957  major facilitator transporter  99.28 
 
 		 415 aa  834    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0612766 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2814  major facilitator transporter  99.52 
 
 		 415 aa  836    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.807872  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2832  major facilitator transporter  100 
 
 		 415 aa  839    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1622  major facilitator transporter  89.59 
 
 		 436 aa  711    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.227848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1697  major facilitator transporter  89.83 
 
 		 436 aa  714    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1731  major facilitator transporter  90.1 
 
 		 422 aa  679    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1544  major facilitator superfamily MFS_1  99.28 
 
 		 415 aa  833    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1692  Xaa-His dipeptidase  90.07 
 
 		 436 aa  693    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2720  major facilitator transporter  66.67 
 
 		 411 aa  532  1e-150  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1672  major facilitator transporter  59.03 
 
 		 437 aa  495  1e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000523239  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2913  major facilitator transporter  55.34 
 
 		 427 aa  437  1e-121  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1721  major facilitator transporter  54.98 
 
 		 434 aa  422  1e-117  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.554921  normal  0.0271862 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1454  major facilitator transporter  57.03 
 
 		 409 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0344021  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1441  major facilitator transporter  55.75 
 
 		 405 aa  412  1e-114  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2214  multidrug resistance protein, putative  54.78 
 
 		 409 aa  385  1e-105  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1423  major facilitator transporter  38.5 
 
 		 393 aa  224  2e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.775397  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1225  putative multidrug resistance protein  33.33 
 
 		 405 aa  206  9e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1070  MFS transporter  32.67 
 
 		 402 aa  204  2e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2851  major facilitator superfamily protein  34.29 
 
 		 409 aa  200  3e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.525644  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1390  major facilitator transporter  34.56 
 
 		 400 aa  199  7.999999999999999e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.238534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1294  major facilitator transporter  35.37 
 
 		 400 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.556112  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2281  major facilitator transporter  32.98 
 
 		 421 aa  196  6e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0316528 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3226  major facilitator superfamily MFS_1  32.38 
 
 		 410 aa  193  5e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.361793 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1825  major facilitator superfamily MFS_1  31.66 
 
 		 407 aa  190  4e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.010235  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2045  major facilitator superfamily MFS_1  32.97 
 
 		 404 aa  189  7e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.588816  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5072  major facilitator family transporter  33.69 
 
 		 425 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.348741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1035  major facilitator superfamily MFS_1  31.35 
 
 		 410 aa  188  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2800  major facilitator transporter  30.65 
 
 		 399 aa  187  3e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0394  major facilitator transporter  32.86 
 
 		 414 aa  186  7e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1604  major facilitator family transporter  31.79 
 
 		 417 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1898  major facilitator superfamily MFS_1  32.81 
 
 		 424 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.164459  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5112  major facilitator superfamily protein  32.14 
 
 		 418 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2306  major facilitator family transporter  31.7 
 
 		 417 aa  182  8.000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.200396 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0416  general substrate transporter  31.44 
 
 		 424 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.225586 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01565  predicted transporter  31.7 
 
 		 417 aa  182  9.000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2047  major facilitator superfamily MFS_1  31.7 
 
 		 417 aa  182  9.000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.349329  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1803  major facilitator family transporter  31.7 
 
 		 417 aa  182  9.000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01555  hypothetical protein  31.7 
 
 		 417 aa  182  9.000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2034  major facilitator transporter  31.7 
 
 		 417 aa  182  9.000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1670  major facilitator family transporter  31.7 
 
 		 417 aa  182  9.000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4945  major facilitator transporter  33.14 
 
 		 414 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.395119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5122  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 414 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1443  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 416 aa  176  7e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0420  major facilitator transporter  32.18 
 
 		 422 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2135  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 425 aa  172  1e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5767  major facilitator family transporter  33.68 
 
 		 438 aa  172  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.554362  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2042  major facilitator superfamily MFS_1  31.27 
 
 		 422 aa  170  4e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.316098  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66510  putative MFS transporter  34.05 
 
 		 438 aa  170  4e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5565  major facilitator transporter  33.16 
 
 		 402 aa  168  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1917  major facilitator transporter  31.46 
 
 		 417 aa  167  2.9999999999999998e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1686  inner membrane transport protein YnfM  33.25 
 
 		 417 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1588  inner membrane transport protein YnfM  33.33 
 
 		 417 aa  167  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.185202 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2343  major facilitator superfamily MFS_1  30.18 
 
 		 422 aa  167  4e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1597  inner membrane transport protein YnfM  33.33 
 
 		 417 aa  167  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1853  inner membrane transport protein YnfM  33.33 
 
 		 417 aa  167  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1656  inner membrane transport protein YnfM  33.33 
 
 		 417 aa  167  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5217  major facilitator superfamily MFS_1  33.84 
 
 		 404 aa  166  5e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.877552  normal  0.0536068 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1955  major facilitator superfamily MFS_1  28.94 
 
 		 393 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.135687  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5292  major facilitator superfamily MFS_1  32.06 
 
 		 407 aa  166  9e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.479452 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4750  major facilitator transporter  33.08 
 
 		 404 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1871  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 422 aa  162  8.000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00512651  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1120  major facilitator superfamily MFS_1  30.87 
 
 		 405 aa  162  8.000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0908494  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1983  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 432 aa  162  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.239613  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3403  major facilitator transporter  31.51 
 
 		 426 aa  162  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1518  major facilitator superfamily MFS_1  32.89 
 
 		 402 aa  159  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0691325  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06410  arabinose efflux permease family protein  28.57 
 
 		 405 aa  157  5.0000000000000005e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.859642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1968  major facilitator superfamily MFS_1  30.23 
 
 		 438 aa  155  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.878316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2333  major facilitator family transporter  30.23 
 
 		 438 aa  155  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4358  major facilitator superfamily MFS_1  28.68 
 
 		 412 aa  153  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900983 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2555  major facilitator superfamily MFS_1  30.16 
 
 		 434 aa  152  8e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0238485  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02138  hypothetical protein  32.9 
 
 		 403 aa  152  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4629  major facilitator superfamily MFS_1  28.43 
 
 		 499 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.458536  normal  0.277274 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0642  major facilitator superfamily MFS_1  29.58 
 
 		 422 aa  152  1e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0791  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 		 434 aa  150  4e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.039054  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4412  major facilitator transporter  29.97 
 
 		 434 aa  149  8e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.388207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003683  permease  32.04 
 
 		 407 aa  148  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3949  major facilitator transporter  30.23 
 
 		 417 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0881757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5298  major facilitator transporter  31.44 
 
 		 413 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0770  major facilitator superfamily MFS_1  30.53 
 
 		 440 aa  147  5e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2753  major facilitator superfamily MFS_1  28.84 
 
 		 397 aa  146  6e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03772  MFS transporter  28.21 
 
 		 426 aa  146  7.0000000000000006e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3378  major facilitator transporter  31.19 
 
 		 441 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4989  major facilitator transporter  31.19 
 
 		 441 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.448474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0185  major facilitator superfamily MFS_1  29.31 
 
 		 440 aa  143  6e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.899358 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4017  major facilitator transporter  26.2 
 
 		 387 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2213  major facilitator superfamily MFS_1  29.22 
 
 		 428 aa  142  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.175074  decreased coverage  0.00000120086 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4723  major facilitator superfamily MFS_1  29.95 
 
 		 413 aa  142  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0900603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0657  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 399 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0558  major facilitator transporter  27.84 
 
 		 384 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.257784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1491  major facilitator transporter  30.26 
 
 		 409 aa  139  7.999999999999999e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0444  major facilitator family transporter  29.95 
 
 		 433 aa  139  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.420207  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2302  major facilitator transporter  30.61 
 
 		 448 aa  139  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.44154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4365  major facilitator transporter  28.99 
 
 		 406 aa  138  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03550  arabinose efflux permease family protein  29.53 
 
 		 376 aa  138  2e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02570  arabinose efflux permease family protein  31.18 
 
 		 442 aa  137  5e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3894  major facilitator transporter  30.27 
 
 		 445 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2970  major facilitator superfamily MFS_1  30.73 
 
 		 408 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.588323  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0181  major facilitator family transporter  28.39 
 
 		 526 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0897  MFS drug efflux pump  25.5 
 
 		 381 aa  134  3e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>